科研产出
中国兰遗传多样性的SRAP分析
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了分析中国兰遗产多样性,利用64对SRAP引物对中国兰24个品种的种质资源进行遗传亲缘关系分析。结果表明,筛选出的51对多态性高引物,共产生1113条扩增带,平均每对引物扩增22条带,多态性条带共1092条,占总数的98.1%。利用ntsys软件分析遗传相似系数,并构建聚类图。因此,结果表明与形态学分类基本一致,SRAP标记适用于分析不同国兰品种之间的遗传基础。
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金针菇菌株遗传多样性的ISSR分析
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：本文利用ISSR技术对来自国内外栽培菌株和野生菌株114个进行了遗传多样性分析,建立了遗传相似性聚类图。结果表明,114个金针菇菌株在遗传相似性水平为0.66时,聚为一大类群,在遗传相似性水平为0.75时,将114个金针菇菌株划分为7个类群,类群Ⅰ包括97个菌株,类群Ⅱ包括8个菌株,类群Ⅲ包括1个菌株,类群Ⅳ包括1个菌株,类群Ⅴ包括3个菌株,类群Ⅵ包括5个菌株,类群Ⅶ包括1个菌株;在0.81水平上可划分为35个亚类群,显示出我国金针菇菌株具有丰富的遗传多样性。
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基于抗病功能基因标记的中国三系杂交水稻骨干亲本遗传多样性研究
《农业生物技术学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为探究实现水稻广谱持久抗性育种,以及水稻病害的有效防治,本研究利用文献中报道的与抗稻瘟病及白叶枯病相关的43个功能基因相关标记,研究了76个中国籼型(Oryza sativa ssp.indica)三系杂交水稻骨干亲本的遗传多样性。结果显示,36个标记具有多态性,多态性位点百分率(P)81.81%,共检测到87个等位基因位点;其中有效等位基因(Ne)61.96个,占71.22%,Nei's遗传多样性指数(He)变幅为0.358~0.974,平均值0.629。76份材料间的遗传相似系数(Gs)变幅为0.341~0.925,平均值0.550。采用UPGMA法进行聚类分析,在遗传相似系数0.624处分为保持系和恢复系两类。保持系和恢复系间的遗传分化系数(Fst)为0.158,呈高度遗传分化,Nei遗传距离(D)0.201。结果显示,功能基因相关标记具有较高的DNA多态性检测效率,用于类群划分和种质资源的多样性分析等方面更具准确性和可靠性;中国三系杂交稻骨干亲本在43个功能基因位点的亲缘关系较近,遗传基础狭窄,同源性较高。但保持系群和恢复群系间在这些功能基因位点的遗传差异较大,遗传分化程度较高。研究结果提示,所研究材料在DNA水平存在丰富的杂种优势利用空间,特别随着更多更细的功能基因位点的发掘,为水稻分子辅助抗性选育以及病害防治提供了有效的实现途径。
关键词： 三系杂交水稻 骨干亲本 功能基因 聚类分析 遗传多样性
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西藏林芝麦类条锈病菌群体多样性分析
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为了解西藏麦类条锈病菌种群结构,测定了来自西藏林芝及邻近地区的70个菌株生理小种。结果表明,在检测出的23种小种类型中,林芝地区病菌分属水源致病类群及CY28以前的致病类型,水-2和水-5为林芝优势小种,但在2009年CY28以前类型的现频率高达32.35%。筛选出E2M2、E3M3、E4M6、E7M6等4对Eco R I/Mse I引物组合,对各条锈病菌株基因组DNA进行AFLP分析,共扩增出141条可统计的条带,其中多态性条带为39条,多态率为27.65%。经AFLP分析,70个参试菌株的遗传相似系数范围为0.55～1.00。当遗传相似系数为0.748时,所有菌株可分为4组。其中来自林芝的菌株大部分被聚类在A组的第一、第二亚组,而A组第四亚组、B、和D组为西藏特有遗传类型。来自四川阿坝州的菌株均属于A组第一亚组,来自四川甘孜和凉山的菌株均属于A组第二亚组。来自云南丽江的菌株分属A组第三亚组和C组。毒性分析和AFLP分析均表明,西藏条锈病菌是一个相对独立的群体,但和邻近地区特别是四川越夏区有一定的亲缘关系。
分子标记在核盘菌遗传多样性研究中的应用及展望
《安徽农业科学 》 2012 北大核心
摘要：对核盘菌遗传多样性研究中常用的分子标记方法,如随机扩增多态性(RAPD)、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、微卫星DNA(SSR)、相关序列扩增多态性(SRAP),及其发展方向进行了综述,以期为核盘菌的相关研究提供参考。
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利用SRAP标记分析四川省芋种质资源遗传多样性
《植物遗传资源学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：在分子水平研究四川省芋资源的遗传多样性和亲缘关系,为芋种质资源的分类、保护和有效利用遗传资源以及新品种选育提供依据。本研究利用SRAP分子标记技术,使用28对SRAP引物组合对65份四川省不同地区芋种质资源材料进行遗传多样性分析,采用NT-SYS 2.1统计软件对数据进行分析,建立树状聚类图。扩增出并检测到341条条带,平均每个引物组合扩增检测出12.18条带,多态性带251条,多态率73.6%。UPGMA树形图表明,所用的SRAP引物组合可以将65份材料分成5类,分别与这些材料在园艺分类学上按母芋和子芋的生长习性分类基本相符,与以芋叶心色斑颜色、叶柄中下部颜色、母芋芽色及母芋肉色4种形态性状组合描述具有相关性。研究表明,从四川省不同地区、不同生态环境下收集的不同类型芋种质资源间存在着较丰富的遗传多样性,SRAP分析聚类结果与主要形态学性状分类基本一致,可以解释芋栽培种的进化关系。
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27份含D基因组山羊草属种在高产基因座Barc1183的多态性分析
《分子植物育种 》 2012 CSCD
摘要：具有D基因组的山羊草属种是小麦重要的野生近缘植物,携带丰富的优异基因,是改良现代小麦的重要遗传资源。SSR标记Barc1183是在川麦42遗传背景中发现的一个来源于人工合成小麦的高产基因座,位于4DL染色体上。本研究,利用基因座Barc1183及其紧密连锁的SSR标记Barc48,以川麦42和川农16为对照,对27份含D基因组的山羊草属材料进行了多态性分析。结果表明,27份山羊草属材料在Barc1183基因座,发现8种等位变异类型,其中6种等位变异类型为不同于对照川麦42和川农16的新类型;而在Barc48基因座,发现5种等位变异类型,这5种等位变异均为不同于对照川麦42和川农16的新等位变异类型。结合Barc1183和Barc48基因座结果分析表明,27份山羊草属材料中均含有不同于川麦42、川农16的等位变异类型,没有一份与川麦42和川农16基因型完全一致的材料。
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茄子种质资源SSR鉴定及遗传多样性分析
《四川大学学报(自然科学版) 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：应用SSR技术对83份茄子种质资源进行了遗传多样性分析,从23对引物中筛选出15对多态性高、稳定性好的引物进行扩增分析,共检测到148个位点,每个SSR位点的等位变异范围为3～19个,平均每对引物有9.8个扩增位点.83份种质的Jaccard's相似系数值最大为0.989(2～7),最小为0.232(58～80),平均为0.763;79个栽培种的相似系数平均为0.832,说明栽培种总体表现为遗传差异较小.以Jaccard's相似系数为基础,利用UPGMA方法构建了树状聚类图,聚类分析将83份茄子种质分为四大类群.结果表明SSR可以较好的将茄子栽培种及其近缘野生种分开,但聚类结果与地理分布没有直接联系.
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苏丹草品种间的RAPD分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：为评价苏丹草品种间的遗传多样性,用RAPD标记对14个苏丹草品种进行了遗传多样性分析。从100条RAPD引物中筛选出20条多态性明显、反应稳定的引物。14个品种共扩增出260条谱带,平均每条引物扩增出11.6条带,多态性比率达88.5%。聚类分析结果表明:苏丹草品种间遗传多样性丰富,材料间遗传相似系数分布在0.586～0.831;14个品种分为两大类,来自美国的"伊诺"和"布鲁赛"聚为一类;第Ⅱ类把高大型和低矮型聚为两类。结果显示出:聚类结果与形态特征有一定的对应关系,这为苏丹草种质资源的保存、利用和新品种选育提供了依据。
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节节麦与普通小麦杂交后代的遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：运用SSR标记的方法,对节节麦SQ-214与普通小麦杂交后代的BC1F2群体的64份材料和高代系群体的147份材料在D基因组上的68个SSR位点的遗传多样性进行了分析。结果表明:68对SSR引物在杂交后代的两个群体等位变异位点较多,BC1F2群体共检测到67个位点有变异,等位变异数为212个,主要集中在3D染色体上。高代系中58个位点有变异,等位变异数为184个,等位变异位点多集中在2D上。BC1F2和高代系群体在D基因组的7条染色体上遗传多样性的表现不一致,BC1F2在7条染色体上的遗传多样性显著高于高代系,等位变异分布较高代系均衡。BC1F2材料间的遗传多样性高于高代系。由此可知,节节麦与普通小麦杂交衍生后代具有较高的遗传多样性,可用于进一步改良小麦;同一衍生亲本的衍生后代具有较大的遗传分化,尤其是在随机群体;经过选择后的群体遗传多样性会明显的降低。
关键词： 节节麦SQ-214 普通小麦 遗传多样性 SSR标记 选择压
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