科研产出
水稻对稻曲病不同抗性品种遗传多样性SSR分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：本文利用35对SSR引物对23份水稻品种(组合)进行遗传多样性分析。结果表明,35对引物在23个水稻品种上共获得342条扩增条带,其中多态性条带288条,多态性条带所占比例为84.21%。23个参试水稻品种对稻曲病的抗性表现出明显差异,病穗率范围为8.20%~75.93%,最高和最低病穗率之间相差67.73个百分点,病情指数范围为2.19~52.67,最高和最低病情指数相差50.48。成对品种的GS变化为0.614~0.954,平均值为0.740单个品种的平均GS值变化为0.686~0.778之间。共有11份供试品种的平均GS值低于GS总平均值(0.740),其它12份(占供试品种总数的52.2%)供试品种平均GS值高于GS总平均值(0.740)。聚类分析的结果表明,在遗传相似系数为0.75时,23个供试品种可分为5类。不同生育期的品种可以聚在同一类群中,聚在同一类的品种生育期最多可相差11 d,而同一生育期的品种可以分属不同的类,包括中抗到高感的不同抗性类型。
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SSR分子标记在糯高粱种质资源遗传多样性分析中的应用
《江苏农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了阐明糯高粱种质资源之间的亲缘关系,用25对SSR引物评价了29份糯高粱种质资源。结果显示,25对引物共检测出59个等位基因,每对引物检测到2.28个等位基因,平均有效等位基因为1.81个,引物位点的多态信息量变幅为0.17~0.62,平均为0.34。29份糯高粱种质资源的遗传相似系数范围为0.20~0.95,平均为0.60,UPGMA方法将29份糯高粱品种在遗传相似系数0.48处聚为2大类,其中不同地理来源的品种被聚在同一亚类,农艺性状近似的品种被聚在同一亚类。表明糯高粱品种的亲缘关系与地理来源关系不大,其种质资源具有较为丰富的遗传多样性。
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玉米圆斑病菌(Bipolaris zeicola)遗传多样性ISSR分析
《植物保护 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：利用简单序列重复间隔区(inter-simple sequence repeats,ISSR)标记对玉米圆斑病菌(Bipolaris zeicola)的遗传多样性进行了分析。筛选出9个扩增多态性好且稳定的通用引物,共扩增出47条DNA条带,大小分布于250~2 000bp之间,其中多态性条带为33条,为总条带数的70.21%。遗传距离为0.91处时,所有菌株被聚为6个组。ISSR标记可以揭示菌株间的亲缘关系及差异性,可用于玉米圆斑病菌遗传多样性研究。此外,通过分子标记划分的类群与利用寄主反应型之间存在一定相关性,但其关系并不密切。
关键词： 玉米圆斑病菌 简单序列重复间区 遗传多样性 聚类分析
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泸州老窖不同窖龄窖泥中己酸菌遗传多样性及系统发育
《四川农业大学学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究泸州老窖窖泥中己酸菌的遗传多样性和系统发育地位,筛选优良高产己酸菌株,为提高新窖酒品质提供优质菌株资源。【方法】采用BOXAIR-PCR、16SrDNA PCR-RFLP和代表菌株16SrDNA序列分析技术等对不同窖龄窖泥中乙酸菌的多样性进行分析。【结果】从不同窖龄窖泥样品中分离获得了43株产己酸细菌;BOXAIR-PCR分析结果表明,在82.2%的相似性水平处,供试菌株形成了8个BOX遗传群;16SrDNA PCR-RFLP将43株供试菌株分为8个遗传群;代表菌株16SrDNA序列系统发育分析表明,供试菌株分布于3个系统发育分支。【结论】泸州老窖窖泥中己酸菌具有丰富的遗传多样性,这些菌株主要分布于梭菌属(Clostridium)、芽孢杆菌属(Bacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas),其中芽孢杆菌属(Bacillus)为优势属。
关键词： 窖泥 己酸菌 遗传多样性 BOXAIR-PCR 16SrDNA PCR-RFLP
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我国玉米灰斑病菌遗传多样性的ISSR分析
《植物保护学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为明确我国发生的玉米灰斑病菌地理差异及遗传结构,利用简单序列重复区间(ISSR)对玉米灰斑病菌遗传多样性进行了分析,并利用尾孢菌特异引物对分离自四川、云南、湖北、贵州等西南地区的16个玉米灰斑病菌菌株进行了分子鉴定。结果显示,通过ISSR标记筛选出10个扩增多态性好且稳定的通用引物,共扩增出81条DNA条带,均为多态性条带,扩增片段大小在200~2 000 bp之间,菌株遗传相似系数为0.19~1.00。在遗传相似系数为0.19时,供试菌株被聚为2大类群,来自西南地区和东北地区的菌株各自聚为一组,在DNA水平上表现出明显差异,认为是2类不同的致病类群。分子鉴定结果显示引起西南各地区玉米灰斑病的主要致病菌均为玉米尾孢菌Cercospora zeina。表明我国玉米灰斑病菌存在丰富的遗传多样性,ISSR标记可揭示出玉米灰斑病菌株间的亲缘关系及遗传差异性,可用于其遗传多样性研究。
关键词： 玉米灰斑病菌 简单序列重复区间 遗传多样性 聚类分析
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山茶种质资源主要表型的遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为加强山茶种质资源的研究利用,对保存的51份种质资源的11个质量性状与11个数量性状进行聚类分析与主成分分析。结果表明:供试材料具有丰富的遗传多样性。多样性指数最高的是叶长,其次是雄蕊长度、花瓣长和叶柄长度;性状变异系数最大的是花柄长度,其次是果径和叶柄长度,最小的为花瓣数量。基于各种资源形态性状的遗传差异,把51份山茶聚类并划分为3大类群。第Ⅰ类为花色艳丽、大花的亲本材料,第Ⅱ类为香花或小花型山茶的亲本材料,第Ⅲ类为黄色花或花、叶某一部分具有奇特观赏性状的亲本材料。22个农艺性状的主成分分析结果表明,前7个主成分累计贡献率达79.891%,第1主成分反映花的观赏性,第2主成分反映叶的观赏性,第3成分反映叶和果实。研究结果表明,供试山茶种质资源的变异较大,遗传较丰富。
关键词： 山茶 种质资源 表型 遗传多样性 聚类分析 主成分分析
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生姜内生溶磷细菌遗传多样性及溶解Al-P和Fe-P能力研究
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：开展生姜内生溶磷细菌的遗传多样性及溶磷能力研究,有助于获得新的溶磷微生物,促进土壤磷素转化。本文从采自重庆、四川雅安和眉山及贵阳等地生姜样品中分离得到32株内生溶磷细菌,采用BOX-PCR对其遗传多样性进行分析,进而研究供试菌株溶解Al-P和Fe-P的能力。BOX-PCR分析表明,供试菌株具有丰富的遗传带谱,聚类分析中,供试菌株在55%聚为一群;在70%的相似水平处,供试菌株分为6个BOX遗传群。在添加2 g/L Al-P和1 g/L Fe-P的液体培养基中,供试菌株溶解Fe-P能力高于溶解Al-P,有效磷含量分别为1.14~9.95和2.98~55.42μg/m L。其中,QW40溶磷效果最好,发酵液有效磷含量分别为9.95和55.42μg/m L。供试菌株对Al-P和Fe-P溶磷量与发酵液的p H值呈显著负相关关系。
关键词： 生姜 BOX-PCR 内生细菌 溶磷特性 遗传多样性
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茄子品种抗黄萎病性状与SRAP标记的关联性分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以参加抗性鉴定的茄子品种为研究材料,应用茄子黄萎病抗病性鉴定标准方法和SRAP标记方法,研究了茄子抗黄萎病性状与SRAP标记的关联性。结果表明,本研究中的82个茄子品种黄萎病病情指数为12.5%~83.33%,平均病情指数为31.57%,病情指数散差较大,离散程度较低,品种间抗病性差异极显著,高抗病或者高感病品种数较少;基于K=3时ΔK最大将所有品种分为3个亚群,即两个小亚群和一个大亚群;采用MIM_Q+K模型对病指均值进行关联分析,共检测到18个SRAP标记与病指显著关联,其中标记Em7/Me7-11达极显著水平(–log P>3,P<0.001)。这些标记关联性稳定且关联度高,可用于后续分子标记辅助育种和测序,为候选基因筛选和预测提供了重要信息基础。
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