科研产出
基于SSR标记检测与重测序技术的3个李品种鉴定与遗传背景简析
《中国南方果树 》 2023 北大核心
摘要：“玉带李”“青脆李”“蜂糖李”是熟期或外观相近的四川省主栽青皮李品种。为探索快速区分这3个青皮李品种的方法，对其果实成熟期与外观特征进行比较，采用前人公布的李属种质资源77对SSR标记进行分型，并使用基因组重测序技术简析其遗传背景。结果表明，29号引物和UDP98-021可以作为区分“蜂糖李”的分子标记，ASS R71可以作为区分“青脆李”的分子标记，再结合“玉带李”果实成熟期更晚和具水渍带状缝合线的特点，可以成功区分出这3个李品种。基于重测序技术的SNP、InDel变异检测及可视化分析结果表明，“玉带李”与其他两个品种的遗传背景差异较大，“青脆李”“蜂糖李”遗传背景高度相似。“玉带李”可以作为“青脆李”“蜂糖李”的配套授粉品种，是李品种改良的优良亲本。
全文链接
请求原文
利用SSR分子标记鉴定华南型黄瓜'川绿15号'杂交种子纯度
《西昌学院学报(自然科学版) 》 2022
摘要：[目的]为了快速、简便和准确地鉴定华南型黄瓜‘川绿15号’杂交种子的纯度，[方法]选用240个均匀分布在黄瓜基因组上的SSR分子标记对‘川绿15号’及其亲本进行多态性筛选及纯度鉴定。[结果]本研究从240个黄瓜SSR分子标记筛选到2对SSR标记（Cs100和Cs109）符合父母本间呈互补带型的要求，可用于川绿15号’杂交种子的纯度鉴定。准确性验证结果显示Cs100和Cs109的分子鉴定结果与田间形态的鉴定结果一致并且均能将掺入的其他品种黄瓜种子区分开来。[结论]本研究构建了以黄瓜特异性SSR分子标记Cs100和Cs109为核心引物的‘川绿15号’杂交种子纯度鉴定的技术方法，可快速、简便和准确地鉴定该品种的种子纯度，为该品种的制种和大面积推广提供技术支持。
全文链接
请求原文
不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析
《江苏农业科学 》 2019
摘要：为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2～9条带,其中具有多态性的为95条,多态性条带百分率为93.14%。POPGENE分析结果表明,平均观测等位基因数为2.967 4,平均有效等位基因数为2.419 1,有效等位基因比例为81.52%;平均Nei基因多样性指数为0.355 5,平均Shannon多态性指数为0.528 9。UPGMA法聚类结果把供试萝卜材料分为3个类群,5个亚类:第Ⅰ类为来源于德国的极耐抽薹材料,第Ⅱ类为来源于韩国和日本的耐抽薹材料,第Ⅲ类为来源于我国的材料,其中第3亚类共有45份,占材料总数的78.95%,第4亚类为5份极易抽薹材料,第5亚类仅有1份。各材料间平均遗传相似系数为0.638 1,变幅范围0.347 8～0.934 8,>0.7的仅22.87%,遗传差异较大。不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。
全文链接
请求原文
基于SSR的四川花生遗传多样性分析
《中国农学通报 》 2019
摘要：为给花生分子育种及资源库构建提供理论依据,以来源于四川各个区域的57份花生资源为试验材料,对材料的4个农艺性状及4个品质性状进行测试鉴定,利用67对SSR标记进行评价,并与表型性状进行关联分析。结果显示,花生资源的8个性状中,6个变异较大、多样性较好。67对SSR引物中,有效引物39对,获得多态性条带53条,平均每个引物扩增1.36条。平均Nei’s基因多样性指数是0.2288,平均Shannon’s指数是0.3695。采用非加权平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似系数0.5200时,SSR分子标记聚类分析将57份资源聚为2大类群,最大遗传距离为0.51。GLM分析发现多个与蛋白质含量、株高、含糖量的关联标记。研究表明,四川不同区域间花生遗传多样性较丰富,资源材料间的亲缘关系与地理分布关系不大,地方资源与主推品种间性状差异较大,亲缘关系较远。
全文链接
请求原文
基于SSR标记的四川大豆与引进大豆资源遗传多样性和群体结构分析
《大豆科学 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：利用均匀分布于20条染色体的53对SSR标记(每条染色体上2~5对),对190份大豆资源进行遗传差异检测,随后根据标记试验结果进行遗传多样性分析、聚类分析、PCA分析和群体结构分析.53对SSR标记共检测到159个等位变异,每个位点等位基因范围为2~6个,平均每个位点的等位基因为3个,有效等位基因数Nei为1.474 4±0.237 5,多态性信息含量PIC为0.305 0±0.1056;Shannon-Weaver指数值为0.476 2±0.124 9.这些参数显示了190份大豆资源异质程度不是很高,遗传多样性丰富程度一般,总体遗传多样性处于中等水平.UPGMA聚类分析结果显示190份大豆资源(群体1:P1)被分为3个大类,且四川审定大豆品种与野生大豆资源、国外引进资源亲缘关系较远,随后将四川审定大豆品种31份、国外资源13份和野生大豆资源8份共52份材料(群体2:P2)单独进行聚类分析,52份材料也被分成3个大类.群体1和群体2分别在K=3,K=2时得到合理群体结构.群体1的3个亚群分别是:亚群Ⅰ由地域来源丰富的78份材料组成,不包含野生大豆资源;亚群Ⅱ59份材料中含7份野生大豆资源;亚群Ⅲ 53份材料只包括1份野生大豆资源zy05292.群体2分成两个亚群:亚群Ⅰ26份材料中含24份四川审定大豆品种和2份国外资源;亚群Ⅱ包含了6份审定大豆品种.供试的190份大豆资源蕴含了比较丰富的遗传变异,显示了较高水平的基因多样性.群体结构不能严格地按照地域、来源国家的划分而区分,这一现象显示了大豆资源存在着广泛的基因交流.从分析结果来看,四川大豆资源的种质创新可以充分地利用国外引进资源与直立型野生大豆资源,进而丰富四川大豆的基因多样性.
关键词： 四川大豆 野生大豆 SSR标记 遗传多样性 群体结构
全文链接
请求原文
利用SSR标记分析糯高粱种质资源的遗传多样性(英文)
《Agricultural Science & Technology 》 2016
摘要：为了解析糯高粱种质资源之间的亲缘关系,用25对SSR引物检测了29份糯高粱种质资源的遗传多样性。结果表明,25对引物共检测出59个等位基因,平均每对引物检出2.28个,平均有效等位基因为1.81个,引物位点的多态信息量变幅为0.17～0.62,平均为0.34。29份糯高粱种质资源的遗传相似系数范围在0.203～0.949之间,平均为0.593,UPGMA方法将29份糯高粱品种在遗传相似系数0.475处聚为两大类。不同地理来源的品种被聚在同一亚类,农艺性状近似的品种聚在同一亚类。结果表明,糯高粱品种的亲缘关系与地理来源关系不大,该研究中的糯高粱种质资源具有较为丰富的遗传多样性。
全文链接
请求原文
17个玉米地方种质选系的杂优类群分析
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：分析玉米地方种质选系的杂优类群和杂优模式,可以为探明自交系的应用价值和优势杂交种的配制提供技术支撑。本研究以17个从玉米地方种质中选育的自交系和11个测验种(包括西南地区常用骨干自交系以及代表西南地区玉米核心种质的5个标准测验种)为供试材料,利用SSR标记,进行了杂优类群划分;以17个新选系和11个测验种按不完全双列杂交组配的187个杂交组合为材料,通过单株产量测定,杂种优势估算,分析了杂优模式。结果表明,28个自交系间遗传相似系数较小,可分为4个杂种优势群,17个新选系有7个划入旅大红骨群,3个划入改良Reid群,4个划入PB群,3个划入四平头群;在各类群组配中,PB群地方种质选系(P1-1、P1-8和P1-10)与改良Reid群;PB群地方种质选系(P1-1、P1-6和P1-14)与旅大红骨群;改良Reid群地方种质选系(P1-15、P1-16和P1-17)与四平头群可产生较强的杂种优势,特别是PB群地方种质选系P1-1与改良Reid群组配获得强优势组合可能性更高。研究结果为新选系的应用和地方种质的进一步改良提供理论依据。
全文链接
请求原文
SSR分子标记在糯高粱种质资源遗传多样性分析中的应用
《江苏农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了阐明糯高粱种质资源之间的亲缘关系,用25对SSR引物评价了29份糯高粱种质资源。结果显示,25对引物共检测出59个等位基因,每对引物检测到2.28个等位基因,平均有效等位基因为1.81个,引物位点的多态信息量变幅为0.17~0.62,平均为0.34。29份糯高粱种质资源的遗传相似系数范围为0.20~0.95,平均为0.60,UPGMA方法将29份糯高粱品种在遗传相似系数0.48处聚为2大类,其中不同地理来源的品种被聚在同一亚类,农艺性状近似的品种被聚在同一亚类。表明糯高粱品种的亲缘关系与地理来源关系不大,其种质资源具有较为丰富的遗传多样性。
全文链接
请求原文
水稻恢复系‘成恢177’稻瘟病抗性与遗传背景分析
《中国农学通报 》 2015 CSCD
摘要：为了剖析‘成恢177’稻瘟病持久抗性和高配合力特性的遗传基础,利用稻瘟病抗谱测定、抗病基因测序和SSR分子标记多态性比较的方法,分析了‘成恢177’的稻瘟病抗性和遗传背景。结果表明:在测试的63个稻瘟病单胞菌株和16个鉴别菌株中,‘成恢177’的抗性频率分别为66.67%和68.75%;‘成恢177’的稻瘟病抗性基因来自Lemont,为Pi-km。分子遗传背景分析表明,在148个SSR多态性位点中,‘成恢177’具有70.95%的‘绵恢502’位点,20.95%为美国热带粳稻品种Lemont位点;且在第1~10染色体上SSR多态性位点属‘绵恢502’较多(64.00%~100.00%),在第11、12染色体上属Lemont较多(77.78%、60.00%)。本研究认为‘成恢177’成功地聚合了Lemont的稻瘟病抗性和‘绵恢502’的高配合力。
关键词： ‘成恢177’ 抗稻瘟病基因 遗传背景 SSR标记 基因测序
全文链接
请求原文
绵麦37特异位点在其衍生品种中的遗传贡献率分析
《遗传 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：优良亲本的创制和利用能有效提高育种效率。文章对绵麦37及其衍生品种产量构成因子和抗病性进行比较鉴定,并利用SSR标记检测高产品种绵麦367遗传背景中绵麦37的遗传贡献。结果表明:衍生品种丰产性显著提高,穗粒数的增加是衍生品种增产的主要因素;绵麦37及其衍生品种高抗当前国内条锈菌主要流行小种,特别是高抗对Yr24/Yr26具有强毒性的条锈病新菌株V26;绵麦37优良的抗病性很好地传递给了后代品种;在绵麦367等后代品种的遗传背景中,绵麦37的遗传贡献率达78.9%,其中A、B、D基因组中的遗传率分别为75.0%、83.6%和74.2%,远高于理论值50.0%;衍生品种绵麦367与绵麦37相同染色体区段主要为2B的Xgwm374-Xbarc167-Xbarc128-Xgwm129-Xgwm388-Xbarc101,3B的Xwmc446-Xwmc366-Xwmc533-Xbarc164-Xwmc418等区段,这些区段包含了许多重要性状位点如穗粒数、千粒重和抗病性等。这可能是由于人工定向选择的结果,使那些与目标性状紧密连锁的位点被高频率保留下来。
全文链接
请求原文
