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基于amy基因的中国野桑蚕遗传多样性及其与家蚕的系统发育关系

文献类型： 中文期刊

作者： 刘俊凤 1 ; 刘斌彬 1 ; 董占鹏 2 ; 余泉友 3 ; 鲁成 2 ; 陈义安 1 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院蚕业研究所

2.西南大学蚕学与系统生物学研究所

3.重庆大学农学院

关键词： 家蚕;野桑蚕;遗传多样性;系统发育;淀粉酶基因

期刊名称： 昆虫学报

ISSN： 0454-6296

年卷期： 2009 年 52 卷 12 期

页码： 1338-1348

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探索中国野桑蚕Bombyx mandarina的遗传多样性及其与家蚕B.mori的系统发育关系,采用PCR产物直接测序法(少数样本克隆测序)获得34个家蚕和野桑蚕样本淀粉酶基因amy序列片段(715bp)。分析发现56个多态性位点,鉴定出28种单倍型(haplotype);核苷酸多样性π=0.01390±0.00103,单倍型多样度Hd=0.988±0.011。核苷酸不配对分析(mismatchan alysis)和Fu’sFs检测表明中国野桑蚕曾发生过种群扩张。分子方差分析(AMOVA)表明,遗野桑蚕传差异主要在种群内,种群间和地理组群间差异不显著。聚类树上34个样本聚为3枝/3蔟,野蚕和家蚕都不按地理区域或系统(类型)聚类,A枝由来自不同地区的野蚕和不同类型的家蚕混合构成,并且进一步分成3个亚枝,每一亚枝也同时包含家蚕和野蚕,B枝由3个家蚕和1个野蚕混合构成,C枝全部由来自不同地区的野蚕构成。网络分析没有发现"祖先单倍型"和优势单倍型。结果提示,淀粉酶基因是一个多态性丰富的分子标记,中国野桑蚕遗传多样性十分丰富,据此推测家蚕起源于多种生态类型混杂的野桑蚕。

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