科研产出
中国兰遗传多样性的SRAP分析
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了分析中国兰遗产多样性,利用64对SRAP引物对中国兰24个品种的种质资源进行遗传亲缘关系分析。结果表明,筛选出的51对多态性高引物,共产生1113条扩增带,平均每对引物扩增22条带,多态性条带共1092条,占总数的98.1%。利用ntsys软件分析遗传相似系数,并构建聚类图。因此,结果表明与形态学分类基本一致,SRAP标记适用于分析不同国兰品种之间的遗传基础。
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利用SRAP分析岷江下游荔枝资源的遗传多样性与亲缘关系
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：以岷江下游的41份荔枝古树、3份合江荔枝包括合江大红袍、合江糯米糍和楠木叶为试材,选用32对SRAP(Sequence-re-lated Amplified Polymorphism)引物进行PCR扩增。共检测出222条清晰条带,其中产生182条多态性条带,平均每对引物组合5.6条,多态率为81.9%。32对引物组合遗传多样性在0.0329(me18/em26)～0.4990(me21/em18)之间,平均为0.2915,利用NT-SYS-PC(version 2.10s)软件系统进行UPGMA(Unweighted pair group method arithmetic average)聚类分析。结果表明,岷江下游44份材料之间亲缘关系较近,44材料相似系数在0.5586～0.9279,平均相似系数为0.7913。在遗传相似系数0.67处可分成4大类,其中3个引进品种与当地荔枝古树资源明显分开。由此可看出,岷江下游荔枝古树资源是荔枝育种和生物多样性保护的特殊资源。
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利用SRAP标记分析四川省芋种质资源遗传多样性
《植物遗传资源学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：在分子水平研究四川省芋资源的遗传多样性和亲缘关系,为芋种质资源的分类、保护和有效利用遗传资源以及新品种选育提供依据。本研究利用SRAP分子标记技术,使用28对SRAP引物组合对65份四川省不同地区芋种质资源材料进行遗传多样性分析,采用NT-SYS 2.1统计软件对数据进行分析,建立树状聚类图。扩增出并检测到341条条带,平均每个引物组合扩增检测出12.18条带,多态性带251条,多态率73.6%。UPGMA树形图表明,所用的SRAP引物组合可以将65份材料分成5类,分别与这些材料在园艺分类学上按母芋和子芋的生长习性分类基本相符,与以芋叶心色斑颜色、叶柄中下部颜色、母芋芽色及母芋肉色4种形态性状组合描述具有相关性。研究表明,从四川省不同地区、不同生态环境下收集的不同类型芋种质资源间存在着较丰富的遗传多样性,SRAP分析聚类结果与主要形态学性状分类基本一致,可以解释芋栽培种的进化关系。
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23个金针菇菌株的SRAP分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：采用SRAP分子标记技术对23个金针菇菌株进行分析,使用生物软件构建系统树。试验筛选出了7个扩增谱带清晰、多态性好的SRAP引物。聚类分析结果表明,遗传相似系数变异范围为0.143～1.000,遗传差异较大,相似系数为0.486时,23个菌株聚为3个群。实验结果显示出SRAP技术能够客观反映出全部供试材料遗传关系。
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应用SRAP分子标记构建茄子遗传图谱初探
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术构建茄子分子遗传连锁图,作图群体为255-4-4(Sola-num melongena L. sub sp. ovigerumSalis)与巴-3(S. melongena L. sub sp. melongena)杂交产生的118个F2单株。从88对引物中筛选多态性较好的33对引物组合进行群体检测,多态性频率为37.5%,共检测到40个多态性位点,平均每个引物组合产生1.21个多态性条带。对40个标记用Mapmanager构建连锁群,将24个SRAP标记位点进入4个连锁群,总长度为381.3 cM,标记位点间的平均距离为19.1 cM。
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南瓜资源遗传多样性的SRAP分析
《四川大学学报(自然科学版) 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用30对SRAP引物组合对南瓜属(Cucurbita)中的中国南瓜(C.moschata D.)、印度南瓜(C.maxima D.)和美洲南瓜(C.pepo L.)三个栽培种共76份南瓜资源进行了遗多样性分析.结果表明,在检测到的574条带中,有508条具有多态性,平均每对引物检测到的条带数为19.13条.UPGMA树形图显示,这些SRAP引物可将76份参试材料分为三类,它们分别与其在植物学上的印度南瓜、美洲南瓜和中国南瓜分类相符.在种内,材料间有按起源地分类的趋势,但与果形、果色等形态性状没有相关性.
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中国野生蘑菇属90个菌株遗传多样性的DNA指纹分析
《食用菌学报 》 2009 北大核心
摘要：对90个中国野生蘑菇属菌株(其中44株经同工酶初步鉴定为双孢蘑菇菌株)的总DNA进行SRAP和ISSR分析,获得了18条SRAP和12条ISSR标记条带并进行聚类分析,构建了亲缘关系树状图。结果显示这些菌株大体上可分为野生双孢蘑菇和野生蘑菇属其它菌株两大类群,其中来自川藏高原的41个野生双孢蘑菇按照采集地的不同聚为4个群,地域性差异比较明显;部分来自新疆、西藏的白色野生双孢蘑菇菌株新疆野生、AgX04和AgX042具有独特带型,与其它双孢蘑菇菌株的遗传相似值仅为10%～13%。
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甘薯SRAP连锁图构建淀粉含量QTL检测
《分子植物育种 》 2005 CSCD
摘要：SRAP标记(sequence-relatedamplifiedpolymorphism,序列相关扩增多态性)是由Li和Quiros发展了一种新的分子标记技术。SRAP标记具有简便、稳定、中等产率、在基因组中分布均匀的特点,已被广泛利用。本实验利用甘薯高淀粉品种绵粉一号与甘薯低淀粉品种红旗四号杂交F1代分离群体,根据淀粉含量,选择F1代分离群体中高、低淀粉含量极端类型材料各23个构成选择性基因型子群体。构建的连锁图包括21个SRAP标记和9个连锁群(母本4个连锁群,父本5个连锁群)。复合作图检测到1个淀粉含量QTL,红旗4号的加性效应增加淀粉6.37%,解释表型变异的20.1%。
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