科研产出
西藏林芝麦类条锈病菌群体多样性分析
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为了解西藏麦类条锈病菌种群结构,测定了来自西藏林芝及邻近地区的70个菌株生理小种。结果表明,在检测出的23种小种类型中,林芝地区病菌分属水源致病类群及CY28以前的致病类型,水-2和水-5为林芝优势小种,但在2009年CY28以前类型的现频率高达32.35%。筛选出E2M2、E3M3、E4M6、E7M6等4对Eco R I/Mse I引物组合,对各条锈病菌株基因组DNA进行AFLP分析,共扩增出141条可统计的条带,其中多态性条带为39条,多态率为27.65%。经AFLP分析,70个参试菌株的遗传相似系数范围为0.55～1.00。当遗传相似系数为0.748时,所有菌株可分为4组。其中来自林芝的菌株大部分被聚类在A组的第一、第二亚组,而A组第四亚组、B、和D组为西藏特有遗传类型。来自四川阿坝州的菌株均属于A组第一亚组,来自四川甘孜和凉山的菌株均属于A组第二亚组。来自云南丽江的菌株分属A组第三亚组和C组。毒性分析和AFLP分析均表明,西藏条锈病菌是一个相对独立的群体,但和邻近地区特别是四川越夏区有一定的亲缘关系。
分子标记在核盘菌遗传多样性研究中的应用及展望
《安徽农业科学 》 2012 北大核心
摘要：对核盘菌遗传多样性研究中常用的分子标记方法,如随机扩增多态性(RAPD)、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、微卫星DNA(SSR)、相关序列扩增多态性(SRAP),及其发展方向进行了综述,以期为核盘菌的相关研究提供参考。
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利用SRAP标记分析四川省芋种质资源遗传多样性
《植物遗传资源学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：在分子水平研究四川省芋资源的遗传多样性和亲缘关系,为芋种质资源的分类、保护和有效利用遗传资源以及新品种选育提供依据。本研究利用SRAP分子标记技术,使用28对SRAP引物组合对65份四川省不同地区芋种质资源材料进行遗传多样性分析,采用NT-SYS 2.1统计软件对数据进行分析,建立树状聚类图。扩增出并检测到341条条带,平均每个引物组合扩增检测出12.18条带,多态性带251条,多态率73.6%。UPGMA树形图表明,所用的SRAP引物组合可以将65份材料分成5类,分别与这些材料在园艺分类学上按母芋和子芋的生长习性分类基本相符,与以芋叶心色斑颜色、叶柄中下部颜色、母芋芽色及母芋肉色4种形态性状组合描述具有相关性。研究表明,从四川省不同地区、不同生态环境下收集的不同类型芋种质资源间存在着较丰富的遗传多样性,SRAP分析聚类结果与主要形态学性状分类基本一致,可以解释芋栽培种的进化关系。
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苏丹草品种间的RAPD分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：为评价苏丹草品种间的遗传多样性,用RAPD标记对14个苏丹草品种进行了遗传多样性分析。从100条RAPD引物中筛选出20条多态性明显、反应稳定的引物。14个品种共扩增出260条谱带,平均每条引物扩增出11.6条带,多态性比率达88.5%。聚类分析结果表明:苏丹草品种间遗传多样性丰富,材料间遗传相似系数分布在0.586～0.831;14个品种分为两大类,来自美国的"伊诺"和"布鲁赛"聚为一类;第Ⅱ类把高大型和低矮型聚为两类。结果显示出:聚类结果与形态特征有一定的对应关系,这为苏丹草种质资源的保存、利用和新品种选育提供了依据。
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节节麦与普通小麦杂交后代的遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：运用SSR标记的方法,对节节麦SQ-214与普通小麦杂交后代的BC1F2群体的64份材料和高代系群体的147份材料在D基因组上的68个SSR位点的遗传多样性进行了分析。结果表明:68对SSR引物在杂交后代的两个群体等位变异位点较多,BC1F2群体共检测到67个位点有变异,等位变异数为212个,主要集中在3D染色体上。高代系中58个位点有变异,等位变异数为184个,等位变异位点多集中在2D上。BC1F2和高代系群体在D基因组的7条染色体上遗传多样性的表现不一致,BC1F2在7条染色体上的遗传多样性显著高于高代系,等位变异分布较高代系均衡。BC1F2材料间的遗传多样性高于高代系。由此可知,节节麦与普通小麦杂交衍生后代具有较高的遗传多样性,可用于进一步改良小麦;同一衍生亲本的衍生后代具有较大的遗传分化,尤其是在随机群体;经过选择后的群体遗传多样性会明显的降低。
关键词： 节节麦SQ-214 普通小麦 遗传多样性 SSR标记 选择压
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茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析。结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点。.参试茄属植物种质群体位点的平均杂合度为0.6962;平均多态信息含量为0.6441。82份栽培种茄子材料的平均相似系数为0.822,表明茄子栽培种的基因库较小,遗传基础较为狭窄。聚类分析结果表明,87份材料可分成4大类,可以较好地将茄子栽培种与其近缘野生种分开,并且基本可将高级栽培种(S.melongena L.subsp.melongena)和原始栽培种(S.melongena L.subsp.ovigerum Salis)在亚种水平上区分开来。由此可见,SRAP标记在茄子遗传研究中是一种经济、有效和可靠的分子标记手段。
关键词： 茄子 遗传多样性 SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)
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茄子种质资源SSR鉴定及遗传多样性分析
《四川大学学报(自然科学版) 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：应用SSR技术对83份茄子种质资源进行了遗传多样性分析,从23对引物中筛选出15对多态性高、稳定性好的引物进行扩增分析,共检测到148个位点,每个SSR位点的等位变异范围为3～19个,平均每对引物有9.8个扩增位点.83份种质的Jaccard's相似系数值最大为0.989(2～7),最小为0.232(58～80),平均为0.763;79个栽培种的相似系数平均为0.832,说明栽培种总体表现为遗传差异较小.以Jaccard's相似系数为基础,利用UPGMA方法构建了树状聚类图,聚类分析将83份茄子种质分为四大类群.结果表明SSR可以较好的将茄子栽培种及其近缘野生种分开,但聚类结果与地理分布没有直接联系.
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中国主栽银耳配对香灰菌的系统发育和遗传多样性
《中国农业科学 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：【目的】了解中国主栽银耳配对香灰菌的分类地位及遗传多样性,为香灰菌资源利用和育种提供分子生物学依据。【方法】采用18S-28S rDNA间隔区(ITS4/ITS5)的PCR扩增和内部简单重复序列多态性(ISSR)分子标记,对中国主栽银耳配对香灰菌的遗传多样性进行分析。【结果】16株供试菌株ITS序列分析表明,供试菌株与Annulohypoxylon stygium关系最为接近,同源性高达99%。从70个ISSR引物中筛选出了11个多态性好的引物,共获得62条ISSR标记。以相关系数0.7为阈值,将16株菌划为5个遗传组,菌株间遗传差异较大,遗传多样性较高。【结论】中国主栽银耳地区的香灰菌遗传资源较为丰富,这为利用香灰菌资源选育新品种提供了可能。
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银耳种质资源遗传多样性及酶学特性分析
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：从不同地区采集引进了银耳菌株共14株,利用ISSR分子标记技术对这14株银耳菌株进行了遗传多样性分析,从75条引物中筛选出14条引物,共获得105条带,其中多态性条带70条,占条带总数的67%。聚类分析结果表明:在相似水平为70%时,14个菌株可以划分为4个类群,且类群的划分与地理来源之间并无明显相关性,菌株间遗传差异较大,遗传多样性较高,表明供试菌株在DNA分子水平上存在比较显著的遗传变异。利用紫外分光光度法测定了纤维素酶活性,并采用SPSS软件进行了酶活力差异显著性分析。结果显示:供试的14株银耳菌株纤维素酶活大小在1.300～0.922间,纤维素酶活性很低,酶活力差异显著,且与地理来源无明显相关性。
关键词： 银耳 ISSR 遗传多样性 聚类分析 纤维素酶 SPSS 差异显著性
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四川省马铃薯主栽品种的遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：简单重复序列(SSR)是进行遗传多样性研究的一种有效分子标记。选用四川省现有及引进的马铃薯品系(种)42份,利用已发表的马铃薯SSR引物进行扩增,采用聚类分析方法对供试材料进行了遗传多样性分析。从110对SSR引物中筛选出16对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物,16对SSR引物共扩增出130个位点,其中多态性位点116,占总扩增位点的89.2%。利用NTSYS软件进行聚类分析,结果显示四川省栽培的马铃薯品种遗传多样性水平较低,品种间的遗传差异较小。
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