科研产出
基于微卫星标记的不同地区乌鳢和白化乌鳢群体遗传多样性研究
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]为了解7个不同地理位置的4个乌鳢(Channa argus)群体和3个白化乌鳢育成群体的群体遗传多样性和遗传分化特点.[方法]采用20对微卫星引物对4个乌鳢群体和3个白化乌鳢育成群体,共计350尾个体的微卫星位点进行了分型检测,分析了所有微卫星标记的多态性及遗传多样性信息,并分析了群体间遗传分化特点.[结果]所有20对微卫星引物共检测出356个等位基因,等位基因数(Na)介于4~40个,每个位点平均有17.8个等位基因.观测杂合度(Ho)介于0.000~0.791,平均值为0.578;期望杂合度(He)介于0.31~0.91,平均值为0.732;多态信息含量(PIC)介于0.271~0.901,平均值为0.700,且所有乌鳢群体的Na、Ho、He、PIC均高于白化乌鳢群体.7个群体的遗传分化指数(FST)在0.07 876~0.40 303,所有群体间的遗传分化均达显著水平(P<0.05).将4个乌鳢群体和3个白化乌鳢群体分为两组进行分子方差分析(AMOVA),发现这几个群体的遗传变异主要来源于个体内,占遗传变异来源总量的69.65%.而UPGMA系统发育树聚类结果显示4个乌鳢群体和3个白化乌鳢群体分别被聚类到了 2个独立分支上.[结论]本研究的3个白化乌鳢群体的遗传多样性均相对低于4个乌鳢,在繁育过程中应加强白化乌鳢遗传多样性保护,尽量避免近亲交配,本研究为乌鳢和白化乌鳢的遗传资源保护及综合利用提供理论依据.
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玉米野生近缘种属研究利用进展
《科学通报 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：作物的近缘野生种质遗传多样性是作物遗传育种家应对气候变化、虫害和病害等胁迫的不可或缺资源.玉米（Zea mays）的野生近缘种属主要指玉蜀黍属中的大刍草种和摩擦禾属（Tripsacum L.）,它们蕴涵着栽培玉米不具有的耐盐、耐冷和抗病虫等优良特性,对扩大玉米种质的遗传基础和改进目前生产运用的玉米杂交种的特异性状具有重大意义.本文对大刍草和摩擦禾种质资源的系统分化、植物生态地理学属性、可杂交性和居群间的基因流动、基因组学数据、重要性状的基因定位克隆及育种应用进行了系统论述,并对未来如何高效保存与利用这些遗传资源、发掘新基因和高效种质创新利用进行了展望,旨在为玉米近缘野生资源多样性的了解和利用远缘杂交进行玉米遗传改良提供参考.
关键词： 作物野生近缘种属 遗传多样性 玉米 大刍草 摩擦禾
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四川省二化螟不同地理种群遗传多态性的差异分析
《应用昆虫学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为了解四川省二化螟Chilo suppressalis （Walker）不同地理种群的遗传结构,分析各个种群间的亲缘关系,为区域治理对策提供新的依据。【方法】通过测定四川省17个市县二化螟样本的线粒体COⅡ基因和核糖体ITS基因,利用MEGA软件分析二化螟不同地理种群的基因遗传多样性,以获取样本群体遗传多样性信息。【结果】对114条幼虫线粒体COⅡ基因序列分析发现,在500 bp的区段中共有147个位点存在多态性,包含33个单倍型;川东地区和川西地区二化螟种群的单倍型多样度分别为0.703 83和0.802 26;系统发育树显示,除眉山-1-1种群之外,其他二化螟地理种群聚合为一个大分支。而对同批二化螟核糖体ITS基因序列分析结果表明,在533 bp的区段中存在299个位点多态性,有92个单倍型;川东地区和川西地区二化螟种群的单倍型多样度分别为0.967 48和0.975 71;在系统发育树中,犍为种群聚合为一支,其余种群聚合为一支。【结论】川西地区二化螟线粒体COⅡ基因和核糖体ITS基因多态性比川东地区样本丰富。地理种群之间的遗传分化与分布之间的相关性不大,这可能与种群本身差异相差不大相关。
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基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析
《华北农学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为揭示甘薯及其野生种之间的遗传多样性,分析甘薯及其野生种之间的遗传关系,利用SCoT分子标记对22份甘薯及其野生种三浅裂野牵牛和三裂叶薯的PCR扩增结果、遗传多样性、进化关系、群体结构进行分析。结果表明:43条SCoT引物共检测到278条稳定条带,每条引物可检测4～12个条带;SCoT-8、SCoT-20、SCoT-26、SCoT-36、SCoT-35 5条引物多态性丰富,可用于甘薯及其野生种研究的分子标记。基于分子标记的遗传多样性分析表明,三浅裂野牵牛的遗传多样性最高,甘薯次之,三裂叶薯最小。遗传聚类和群体遗传结构分析结果将参试22份种质材料分为三大类群,各材料归类基本和其所属物种一致,不同物种间的血缘交流少,遗传组成相对单一,比较而言,甘薯与三浅裂野牵牛之间的血缘交流比三裂叶薯之间的血缘交流多,其与三浅裂野牵牛之间的遗传关系较三裂叶薯更近。综上,研究结果初步证明SCoT分子标记在甘薯进化研究中具有潜在应用价值,同时揭示了甘薯与其近缘野生种之间的不同遗传关系,为今后甘薯育种中引入三浅裂野牵牛等野生种血缘,提高甘薯遗传多样性提供了理论支持。
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四川省丁香假单胞猕猴桃致病变种的遗传多样性分析
《中国农学通报 》 2020
摘要：为明确四川省猕猴桃溃疡病菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)的遗传多样性及群组划分与地理来源的相关性。以四川省不同地理来源的40个Psa菌株为研究试材,用rep-PCR技术进行分子标记,NTSYS软件分析UPGMA聚类。3对rep-PCR检测引物(REP、ERIC和BOX)共获得42个位点,其中38个为多态位点,占90.5%。UPGMA聚类结果显示,以相似系数为0.70阀值时,40个Psa菌株被分为2个类群(Ⅰ、Ⅱ),其中85.0%的菌株属于第Ⅱ类群;在相似性系数为0.80时,第Ⅰ类又可分为2个亚类(Ⅰ-1、Ⅰ-2),第Ⅱ类则分为5个亚类(Ⅱ-1、Ⅱ-2、Ⅱ-3、Ⅱ-4、Ⅱ-5),菌株无明显的采集地聚类。以上结果表明,四川省各地区的猕猴桃溃疡病菌菌株具有较高的遗传多样性,但其遗传变异与菌株地理来源无明显相关性。
关键词： 猕猴桃 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种 rep-PCR 遗传多样性 遗传变异
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四川省小麦育成品种系谱分析及发展进程
《遗传 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：品种系谱蕴含亲本来源、选育方式、亲缘关系等大量信息,对揭示农作物品种演变特点、规律并最终指导育种实践具有重要意义。本文汇总了四川省1936～2017年间326个小麦品种的系谱信息,对育种方式、亲本构成、高频亲本及骨干亲本的变化、遗传贡献、易位系及人工合成种质分布等情况进行了梳理与分析。从20世纪30年代至今,四川省育种家从大量材料中选用387个直接亲本,采用杂交育种等方式,配制数千个组合,从256个组合中选育出314个品种,对四川省小麦生产做出了重要贡献,同时也为小麦育种提供了更为优异的材料基础。四川省小麦育种经历了从无到有,从主要依靠引进材料、地方品种到自主创制材料的过程;高频亲本、骨干亲本随育种进程推进而逐渐变化。易位系和人工合成种质对四川省小麦育种贡献巨大。育种目标的一致性必然导致遗传多样性散失和遗传基础脆弱,今后重点应加强资源的创制、保护和利用。本文通过育成品种的系谱梳理,对四川省小麦的育种发展进程进行了分析,以期为未来种质资源的收集创制和育种研究提供重要参考信息。
关键词： 小麦育种 系谱 遗传贡献 遗传多样性 易位系 人工合成种质
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基于SSR的四川花生遗传多样性分析
《中国农学通报 》 2019
摘要：为给花生分子育种及资源库构建提供理论依据,以来源于四川各个区域的57份花生资源为试验材料,对材料的4个农艺性状及4个品质性状进行测试鉴定,利用67对SSR标记进行评价,并与表型性状进行关联分析。结果显示,花生资源的8个性状中,6个变异较大、多样性较好。67对SSR引物中,有效引物39对,获得多态性条带53条,平均每个引物扩增1.36条。平均Nei’s基因多样性指数是0.2288,平均Shannon’s指数是0.3695。采用非加权平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似系数0.5200时,SSR分子标记聚类分析将57份资源聚为2大类群,最大遗传距离为0.51。GLM分析发现多个与蛋白质含量、株高、含糖量的关联标记。研究表明,四川不同区域间花生遗传多样性较丰富,资源材料间的亲缘关系与地理分布关系不大,地方资源与主推品种间性状差异较大,亲缘关系较远。
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四川省不同地域的核盘菌遗传多样性分析
《植物病理学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)属于世界性分布的植物病原真菌,可以危害油菜等多种经济作物。研究不同地域核盘菌的遗传多样性对了解核盘菌的遗传演化过程和指导病害防控具有重要意义。实验采用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记对四川省17个不同地理来源的66株核盘菌菌株的遗传多样性进行了分析。10对检测引物共获得129个位点,其中123个为多态位点,占95.35%。UPGMA聚类结果显示,在相似性系数为0.7时,66个核盘菌菌株分为5类(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ),分别包含60、2、2、1和1个菌株。在相似性系数为0.74时,第Ⅰ类又可分为3个亚类(Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅰ-3),分别包含21、37和2个菌株。聚类及组成分分析结果显示,四川省各地区的核盘菌菌株具有较高的遗传多样性,但其遗传变异与菌株地理来源无明显相关性。
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香菇种质资源遗传多样性研究
《四川农业科技 》 2019
摘要：[目的]我国香菇种质资源丰富,生产规模较大,但在生产中却存在着品质较差、菌种退化、专用加工品种缺乏的问题。研究香菇种质资源多样性是菌株选育和新品种开发的前提和基础。[方法]本研究从全国各地广泛收集香菇推广菌株53份、野生资源22份,共计75份。利用ISSR(inter-simple sequence repeat)和ITS(internal transcribed spacer)技术分析菌株的遗传多样性和系统发育特征。[结果]聚类图谱显示供试的75株香菇菌株总体相似性为62%,遗传相似系数小于0.62时,所有的供试菌株都聚为一类。在0.74的水平上,供试菌株大致分为6类;系统发育树显示供试菌株大致可以分为5大类群,其中57和60相识度为99%,说明这两个菌株的亲缘关系较近。[结论]收集的75份香菇菌株具有较为明显的遗传多样性,具有潜在应用价值。
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