科研产出
小承气散对便秘母猪肠道菌群的影响
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究小承气散对便秘母猪肠道微生物菌群的影响，探讨其改善便秘的机制。【方法】选取27头经产二元母猪（大白猪×长白猪，3～5胎）,依据排便情况分为健康对照组、便秘组和试验组，每组3个重复，每个重复3头。健康对照组和便秘组正常饲喂，试验组按60 g/（头·d）的剂量在饲料中添加小承气散，每天1次，连续3 d,第4天采集各组母猪新鲜粪便样品，提取微生物基因组总DNA,采用Illumina MiSeq测序技术检测样品微生物群落多样性。【结果】便秘组母猪粪便中微生物菌群发生显著改变，与健康对照组和试验组的Simpson指数差异显著（P＜0.05）。在门水平上，与健康对照组相比，便秘组母猪肠道微生物中厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）显著减少（P＜0.05）,变形菌门（Proteobacteria）极显著增加（P＜0.01）;与便秘组相比，试验组母猪肠道微生物中拟杆菌门显著增加（P＜0.05）,厚壁菌门有增加的趋势（P＞0.05）,变形菌门极显著减少（P＜0.01）。在属水平上，与健康对照组相比，便秘组母猪肠道微生物中乳杆菌（Lactobacillus）和普雷沃菌属（Prevotella）极显著减少（P＜0.01）,梭菌属ⅪVa（Clostridium＿ⅪVa）、瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）和毛螺菌科（Lachnospiraceae）显著减少（P＜0.05）,不动杆菌属（Acinetobacter）和埃希氏杆菌属-志贺氏杆菌（Escherichia＿Shigella）极显著增加（P＜0.01）,梭状芽孢杆菌属（Clostridium＿sensu＿stricto）和罗姆布茨菌属（Romboutsia）显著增加（P＜0.05）;与便秘组相比，试验组母猪肠道微生物中普雷沃菌属极显著增加（P＜0.01）,毛螺菌科显著增加（P＜0.05）,不动杆菌属极显著降低（P＜0.01）;粪便中乙酸、丁酸和丙酸含量显著提高（P＜0.05）。【结论】小承气散可改善便秘母猪肠道微生物结构，提高肠道短链脂肪酸（short-chain fatty acids, SCFAs）含量，使肠道微生物达到新的平衡。
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藏猪呼吸道疾病临床样本中病毒的宏基因组学分析
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解我国川西高原地区藏猪呼吸道疾病综合征(porcine respiratory disease complex,PRDC)相关病毒的种类和流行情况,本研究从四川省甘孜藏族自治州地区采集藏猪呼吸道样本共计119份,其中健康藏猪鼻拭子66份(来自6个猪场),PRDC明显症状的藏猪鼻拭子、肺组织及肺泡灌洗液53份(11个猪场).将健康组和发病组样本制成两个pool样提取总核酸反转录成cDNA,建库后使用Illunima novaseq测序.经序列分析表明,健康藏猪呼吸道样品主要以细菌噬菌体为主,动物相关病毒仅检测到疱疹病毒科(Herpesviridae)的mardivirus.发病组样本的病毒种群包括14个病毒科的16种病毒,可引起PRDC的病毒有猪圆环病毒2型(PCV-2)、细环病毒(TTSuV)、猪细胞巨化病毒(PCMV)和非洲猪瘟病毒(ASFV)等.使用SOAPdenovo软件组装出两株PCV-2,三株TTSuV和一株Porprismacovirus的全基因组.遗传演化分析结果显示,两株PCV-2属于PCV-2d亚型,三株TTSuV均属于k2型,其中SCgz-1属于k2b亚型,SCgz-2和SCgz-3属于k2a亚型.Porprismacovirus毒株与越南的人源Human 16806x66_213毒株聚为单独一分支,而与猪源毒株则遗传距离较远.RDP4重组分析显示,该毒株为人源Human 16806x66_213毒株和猪源Porcine 17668x82_593毒株的重组毒株,该重组方式在国际上未见报道.本研究首次对川西高原地区藏猪的呼吸道相关病毒开展调查研究,发现藏猪呼吸道疾病相关病毒种类繁多,并存在不同家畜间、人和家畜间跨种传播的可能,应予以更多关注.同时,本研究也为藏猪呼吸道疾病的防控提供参考.
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斯氏艾美耳球虫泛素结合酶重组蛋白对家兔免疫保护效果的评价
《中国兽医科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：观察斯氏艾美耳球虫（Eimeria stiedai）重组蛋白r Es-UCE、r Es-EFG和r Es-DG32对家兔的免疫保护效果。利用相对荧光定量PCR分析Es-UCE、Es-EFG和Es-DG32 3个基因在虫体不同发育时期的转录水平并进行原核表达与蛋白纯化。在进行了3个重组蛋白对家兔的免疫保护效果初步试验后，筛选出r Es-UCE进行进一步评价，将42只45日龄无球虫家兔分为空白对照组、攻虫对照组、空载蛋白对照组、佐剂对照组和r Es-UCE免疫组，各组分别颈部皮下注射1 m L无菌PBS,1 m L无菌PBS,1 m L（2 mg/m L）皂素，1 m L（100μg/m L）Trx-His-S tag蛋白，1 m L（100μg/m L）r Es-UCE,14 d后同等剂量进行二免。二免后第14天攻虫，除空白对照组外每只无球虫兔经口感染1×104个斯氏艾美耳球虫孢子化卵囊。感染后定期观察各组兔的临床症状、称重并采血，感染后第21天剖检并收集直肠粪样，测定并统计各组兔的死亡率、卵囊排出量、相对增重率、料肉比、肝指数、血清种特异性抗体与细胞因子等。结果显示，试验各组均未出现死亡，r Es-UCE免疫组平均相对增重显著大于攻虫对照组（P＜0.05），肝指数显著低于攻虫对照组（P＜0.05）。r Es-UCE免疫组相对增重率达90.69%，卵囊减少率达78.81%，细胞因子（IL-2、IL-10、IL-17和IFN-γ）水平和特异性抗体水平均与对照组存在显著差异（P＜0.05）。结果表明，r Es-UCE可作为斯氏艾美耳球虫重组亚单位疫苗的候选抗原。
关键词： 家兔 斯氏艾美耳球虫 泛素结合酶（UCE） 重组蛋白 免疫保护
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整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究生猪养殖粪污在堆肥过程中耐药基因的消减规律。【方法】以猪粪和菌渣为发酵原料，进行有氧堆肥处理，在堆肥第1、4、8、12、16、22、29天，进行上、中、下分层多点采样，提取总DNA构建文库，经定量和检测合格后，进行宏基因组测序分析。通过宏基因组学方法对堆肥过程中耐药基因的动态变化进行分析。【结果】堆肥期间共发现613个耐药基因，分别对32类抗生素产生耐药。其中，丰度较高的抗生素分别为青霉烷类抗生素（Penam）、头孢菌素类抗生素（Cephalosporin）、氨基糖苷类抗生素（Aminoglycoside antibiotic）、磷霉素类抗生素（Fosfomycin）、糖肽类抗生素（Glycopeptide antibiotic）和四环素类抗生素（Tetracycline antibiotic）,这与现实中常用的抗生素种类相吻合。分析发现耐药基因的消减出现2个峰值，第一个峰值出现在试验起始时，在第4天迅速下降，然后在第12天（对照组）和第8天（实验组）达到第二个峰值，随着细菌的自然凋亡，耐药基因的丰度又下降到低值，慢慢消减下去。【结论】在堆肥过程中，生猪养殖粪污中耐药基因丰度呈现波动式消减。
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橘皮的干燥特性研究与品质的研究
《食品与发酵工业 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：橘皮是一种药用价值很高的中草药。为增加柑橘的产业附加值，最大限度减少橘皮的浪费，该文以新鲜的橘皮为原料，研究了不同干燥温度（30、50、70、90℃）和不同干燥方式（热风干燥、真空干燥、远红外干燥）对其干燥特性的影响，利用BP神经网络对水分比进行预测，并采用5种常用干燥数学模型分别对试验数据进行非线性拟合。结果表明，热风干燥90℃时，将橘皮干燥至安全含水率所需要的时间最短、水分有效扩散系数最大、活化能最低；远红外干燥30℃所需要的时间最长、水分有效扩散系数最小、活化能最大；经多次试验发现当隐含层节点数为7、9时相关系数R最高为0.999 99,当隐含层节点数为10时相关系数R最低为0.999 83,预测值与实验数据保持高度一致；Page模型对试验数据的拟合度最好，是描述橘皮干燥的最佳模型；热风干燥90℃复水比最大，为2.767;热风干燥90℃橘皮的硬度最大，为291.5 N;热风干燥70℃感官评价得分最高。为橘皮的干制品提供理论价值。
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整合宏基因组学分析生猪养殖粪污堆肥发酵过程中微生物群落动态变化
《动物医学进展 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以猪粪和菌渣为发酵原料,进行有氧堆肥处理,在堆肥第 1、4、8、12、16、22、29 天,进行上、中、下分层多点采样,提取总 DNA 构建文库,经定量和检测合格后,利用宏基因组测序分析堆肥过程中微生物区系变化与致病微生物动态变化.结果表明,堆肥期间微生物丰度发生明显变化,其中细菌丰度先升后降,病毒丰度变化平稳,真菌丰度稍有增长,古细菌丰度则稍有下降.在堆肥初始时,变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门等微生物群落为优势菌门;变形菌门在堆肥的第 4 天迅速达到高点,然后迅速下降并维持在原始水平,其中试验组的变化比对照组更为平稳;厚壁菌门在堆肥的前 4d,丰度急速下降,然后缓慢下降;拟杆菌门在堆肥期间,丰度持续上升.同时,大肠埃希氏菌、沙眼衣原体、肠道沙门氏菌、化脓性链球菌、停乳链球菌等强致病微生物,随着堆肥的进行,其丰度均逐渐下降.试验组和对照组的菌群结构和丰度变化趋势均无显著差异.
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西门塔尔牛体尺指标与产奶量的相关性分析
《四川农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探讨西门塔尔牛产奶量与肛殖距、体高、胸围等体尺指标之间的相关关系,为西门塔尔牛品种的选育以及我国奶业的发展提供理论依据.[方法]收集四川省阳平种牛场378头中国西门塔尔牛成年母牛的体形指标以及近5年的产奶量数据并对其进行多种统计分析.[结果]西门塔尔牛的产奶量与胸围极显著相关(P<0.01),预测产奶量回归方程为Y=4 152.38-22.78X1+16.29X2-2.82X3+35.63X4-30.66X5-1.15X6.[结论]产奶量预测回归方程具有统计学意义,可用于四川地区西门塔尔牛产奶量评估.
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Kozak序列引导的表达兔出血症病毒2型VP60蛋白重组腺病毒的构建及鉴定
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】试验旨在以复制缺陷型人5型腺病毒(Ad5)为载体，构建Kozak序列引导的表达兔出血症病毒2型(RHDV2)VP60蛋白的重组腺病毒，为RHDV2新型疫苗研究提供依据。【方法】修饰、合成带有Kozak序列的VP60基因序列，将其与腺病毒穿梭质粒进行重组，转化大肠杆菌TOP10感受态细胞，构建重组腺病毒穿梭质粒，并利用酶切与测序对重组腺病毒穿梭质粒进行鉴定；采用Ad Max腺病毒包装系统，基于HEK293细胞进行穿梭质粒与腺病毒骨架质粒的定点同源重组，构建重组腺病毒Ad5-RHDV2-VP60并感染HEK293细胞，通过RT-PCR、Western blotting及间接免疫荧光试验(IFA)对重组腺病毒进行表达验证；利用Reed-Muench方法测定重组腺病毒的病毒滴度。【结果】重组腺病毒穿梭质粒酶切鉴定结果可见2条大小分别为3 895和1 752 bp的条带，测序比对结果显示，其与GenBank中公布的相应序列相似性>99%,表明穿梭质粒构建成功。RT-PCR结果可见大小约为515 bp的特异性条带；Western blotting结果显示，大小约为60 ku的VP60蛋白特异性条带；IFA观察结果显示，感染重组腺病毒的HEK293细胞产生了绿色荧光，表明重组病毒能在HEK293细胞中表达VP60蛋白，且该蛋白具有良好的抗原性；病毒滴度测定结果显示，初代重组腺病毒的TCID_(50)为10~(5.5)/0.1 mL。【结论】本试验构建了含RHDV2 VP60基因的重组腺病毒，并成功表达了RHDV2 VP60蛋白，为进一步研究开发RHDV2疫苗提供了病毒模型。
关键词： 兔瘟 兔出血症病毒2型(RHDV2) 重组腺病毒 HEK293细胞 Kozak序列
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基于SSR分子标记的象草变异分析
《四川农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]从分子水平上确认能够在四川泸州叙永县东牛牧场自然越冬并且含糖量有明显差异的7个单株象草材料是否存在遗传变异.[方法]对8份供试材料进行含糖量测定并利用SSR分子标记进行引物筛选及PCR扩增.[结果]22对引物共扩增出166条清晰有效的条带,其中有114条多态性条带,多态性条带比率为68.67%.聚类结果表明,8份供试材料间的遗传相似系数在0.560~0.795之间,SA-4和桂牧1号的遗传相似系数最小,亲缘关系较远.[结论]根据不同引物扩增出现的特异性条带,推测含糖量最高的SA-4是桂牧1号的芽变材料.该结果为象草芽变新材料选育提供了分子生物学依据.
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