科研产出
基于转录组测序分析猪子宫内膜妊娠中的关键非编码RNA及其调控通路
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究调控具有不同产仔数的川乡黑猪和藏猪的猪子宫内膜妊娠过程的相关miRNA、lncRNA及靶基因,进一步揭示影响不同品种猪子宫内膜妊娠相关非编码RNA富集的信号通路.[方法]对平均产仔数为11.35和6.70的川乡黑猪和藏猪第2、5胎次的子宫内膜进行分离,提取RNA,质检合格后进行转录组测序,测序数据经过拼接、比对到miRNA和lncRNA并预测其靶基因,进行GO和KEGG富集分析筛选到调控川乡黑猪和藏猪不同产仔数的候选基因以及信号富集通路.[结果]不同胎次的川乡黑猪和藏猪之间存在多个miRNA、lncRNA及靶基因的差异表达,其中第2胎次具有1571个miRNA和2042个lncRNA差异表达,第5胎次具有1042个miRNA和2096个lncRNA差异表达.进一步根据靶基因的GO和KEGG富集分析发现川乡黑猪在促性腺激素释放激素(GnRH)分泌、ECM受体互作以及Wnt信号通路等的富集程度高于藏猪.同时发现川乡黑猪相比藏猪有醛固酮调节钠重吸收、谷胱甘肽代谢、果糖和甘露糖代谢等过程的富集.此外,已鉴定的关键候选调控基因包括FSHR(Follicle stimulating hormone receptor)、DBX1(Developing brain homeobox 1)、ARID2(AT-rich interaction domain 2)、TNC(Tenascin C)、NT5C2(Neuropilin 2)、LAMC3(Laminin subunit gamma 3)、MADD(MAP kinase activating death domain)等.[结论]高产仔数的川乡黑猪相比低产仔数的藏猪在子宫内膜妊娠过程中有更高的促性腺激素释放激素(GnRH)分泌、ECM受体互作以及Wnt信号通路富集(GO分析结果),同时也有代谢途径的参与(KEGG分析结果).涉及到的关键调控基因主要有FSHR、DBX1等.本研究为探究非编码RNA在猪子宫内膜妊娠过程中的功能及其分子调控机制提供了新的思路.
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牦牛热休克蛋白B11通过抗凋亡缓解热应激对肾细胞的体外损伤
《兽类学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：热休克蛋白B11 (Heat shock protein beta-11, HSPB11)是小热休克蛋白家族的成员之一，具有抗凋亡、促进细胞存活和维持细胞形态等功能。在热应激条件下，自噬失调是急性肾损伤、肾损伤修复不全及慢性肾脏疾病的发病机制之一，而肾细胞的基础自噬是维持肾脏稳态、结构和功能的关键。为探讨牦牛HSPB11对热应激牛肾细胞(Madin Darby Bovine Kidney, MDBK)活性和凋亡的作用，本研究将MDBK细胞分为对照组、热应激组和处理组，采用PCR扩增、生物信息学分析、原核表达载体构建、CCK-8法、吖啶橙染色法、荧光酶标仪检测、荧光定量PCR等方法。扩增得到牦牛HSPB11目的片段757 bp；构建的系统进化树显示，牦牛与黄牛HSPB11的相似性高达99%；成功构建p ET-32a-HSPB11重组质粒，表达获得约35 k Da的牦牛HSPB11；筛选得到牦牛HSPB11最佳浓度为10.0μg/m L，作为处理组HSPB11浓度。研究结果显示，对照组细胞相对活性极显著高于热应激组(P=0.004)，处理组细胞相对活性极显著高于热应激组(P <0.001)。热应激组细胞出现收缩、细胞核裂解呈现碎片状，处理组少见细胞裂解。此外，热应激组MDBK细胞核酸荧光强度均极显著高于对照组和处理组(P <0.001)。热应激组caspase-3、caspase-9、Bcl-2的m RNA表达量极显著高于对照组和处理组(P <0.001)。综上，推测牦牛HSPB11通过凋亡途径缓解热应激对MDBK细胞损伤，为探究牦牛HSPB11的功能提供基础资料。
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羊消化道4种易混淆线虫虫卵的形态学观察与比较
《黑龙江畜牧兽医 》 2024 北大核心
摘要：为了方便临床上鉴定羊消化道常见且易混淆线虫虫卵并丰富相关资料,试验从羊消化道中采集疑似捻转血矛线虫、夏伯特线虫、食道口线虫和奥斯特线虫共 4 种线虫,采用形态学和分子生物学方法鉴定虫种,将 4 种线虫于体外短暂培养后得到纯种虫卵,通过观察虫卵不同发育阶段的胚胎形态变化获取每种线虫虫卵形态特征,并对虫卵的长径、宽径和长宽比进行测定.结果表明:经鉴定 4 种线虫分别为捻转血矛线虫、绵羊夏伯特线虫、粗纹食道口线虫和普通奥斯特线虫.4 种线虫虫卵初期胚胎多呈收缩状态且形似桑葚,在外观形态上具有相似性,均为双层卵壳,多数对称,少数不对称.捻转血矛线虫虫卵呈短椭圆形,颜色较浅;绵羊夏伯特线虫虫卵呈椭圆形,颜色较捻转血矛线虫虫卵深;粗纹食道口线虫虫卵呈长椭圆形,颜色较捻转血矛线虫虫卵深,与绵羊夏伯特线虫虫卵相近;普通奥斯特线虫虫卵亦呈长椭圆形,颜色与捻转血矛线虫相近,较绵羊夏伯特线虫和粗纹食道口线虫虫卵浅.虫卵在生理盐水中培养 1~6 d后,捻转血矛线虫、绵羊夏伯特线虫和普通奥斯特线虫依次进入蝌蚪期和幼虫期,但仅凭肉眼依然难以区分虫卵种类;绵羊食道口线虫未观察到含蝌蚪或含幼虫的虫卵,仅在桑葚期观察到胚胎收缩成 1 团及分裂成 2 团或 3 团不同形态的虫卵.部分粗纹食道口线虫和普通奥斯特线虫虫卵可观察到明显的气室.捻转血矛线虫卵大小为(61.22~102.05)μm×(37.96~69.33)μm,长宽比为 1.51;绵羊夏伯特线虫卵大小为(81.89~139.14)μm×(43.97~90.60)μm,长宽比为 1.57;粗纹食道口线虫卵的大小为(84.57~104.59)μm×(40.86~59.18)μm,长宽比为 1.83;普通奥斯特线虫卵大小为(82.83~117.22)μm×(41.70~71.79)μm,长宽比为 1.76.说明 4 种线虫虫卵的外观形态虽有细微差异,但没有特征性标识,临床上易造成误判,因此采用分子生物学方法进行鉴定更为可靠.
关键词： 羊 消化道线虫 虫卵 形态学 捻转血矛线虫 绵羊夏伯特线虫 粗纹食道口线虫 普通奥斯特线虫
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不同牛羊粪替代对燕麦饲草产量和土壤肥力的影响
《四川农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】通过不同施肥处理对燕麦产量和土壤肥力的影响研究，探索牛羊粪的合理利用方式及其在燕麦生产中的实际效果。【方法】设置了化肥、牛粪、羊粪单独施用及牛粪、羊粪与化肥混合施用的12种不同的牛羊粪施用水平。对燕麦全株产量、养分吸收量和土壤理化性质进行方差分析和显著性分析。【结果】燕麦产量受施肥处理显著影响，施用化肥显著提高产量，施用羊粪以及羊粪替代化肥用量均能一定程度上提高燕麦产量。不同施肥组合对燕麦的氮、磷、钾吸收量产生了差异性影响。此外，对重金属的累积表明，不同施肥处理对燕麦重金属吸收存在差异性影响关系。对土壤性质的研究表明，施肥处理对土壤pH、全钾和铵态氮产生显著影响。【结论】在所有施肥处理中，羊粪单施、化肥+羊粪混合施用显著促进了燕麦的生长和产量，有效提高了土壤pH和铵态氮含量，羊粪替代可实现保障产量、减少化肥施用的目的。
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母猪饲粮能量水平对哺乳仔猪生长性能和粪便菌群的影响
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探讨围产期和泌乳期母猪饲喂不同能量水平饲粮对哺乳仔猪生长性能及粪便菌群的影响.试验选择 2~3 胎川乡黑猪母猪 36 头,随机分为 3 组,每组 12 头猪,分别饲喂代谢能水平为 13.26、13.86、14.46 MJ/kg的哺乳期饲粮.试验期从产前 7 d开始,至产后第 21 天结束.结果表明:饲粮代谢能水平从13.26 MJ/kg提高至 13.86 MJ/kg和 14.46 MJ/kg对母猪繁殖性能及仔猪生长性能均无显著影响;母猪饲粮能量水平提高至 14.46 MJ/kg时母猪初乳免疫球蛋白G含量降低(P<0.05),乳糖含量增高(P<0.05),哺乳仔猪血清甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇和葡萄糖含量均高于其余 2 组(P<0.05);哺乳仔猪粪便微生物分析结果显示,当母猪饲粮能量水平提高至14.46 MJ/kg时,哺乳仔猪粪便菌群中厚壁菌门(Fiemicutes)相对丰度降低(P<0.05),变形菌门(Proteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)等丰富度增加(P<0.05),对维持肠道微生物稳态不利.由此可见,在川乡黑猪哺乳母猪饲粮能量水平为 13.26 MJ/kg的基础上提高饲粮能量水平并不能改善哺乳仔猪的生长性能,提高至 14.46 MJ/kg时则会影响哺乳仔猪血液脂质代谢和肠道菌群平衡,不利于机体健康.
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松乳菇菌丝生长促生细菌的筛选与鉴定
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】从乳菇(Lactarius sp.)菌柄基部土壤分离并筛选出对松乳菇菌丝生长有促进作用的细菌(MHB),以提高松乳菇菌根苗人工合成效率。【方法】从乳菇菌柄基部土壤分离得到细菌，将纯化后的细菌液体培养离心后获得胞外代谢产物，以添加不同菌株和不同浓度胞外代谢产物的PDA培养基接种松乳菇菌丝块，并以未添加胞外代谢产物PDA平板接种松乳菇菌丝为对照，比较25℃培养30 d后松乳菇菌丝生长的直径大小和菌丝密度；另一方面，基于形态特征和16S rDNA序列鉴定对松乳菇菌丝生长有促进作用的细菌。【结果】共筛选出3株可促进松乳菇菌丝生长的芽胞杆菌属细菌，即菌株L1、L2和L3。当3株菌株的胞外代谢产物添加量为2.5%时，均能显著促进松乳菇菌丝生长，其菌落直径分别增加33.6%、55.6%和75.4%。当3株菌株胞外代谢产物以不同组合等比例混合后，在混合物添加量为5.0%时，L1-L3,L1-L2-L3两个组合显著促进松乳菇菌丝生长，松乳菇菌丝直径分别增加36.9%和42.5%。L3菌株的胞外代谢产物在添加量为2.5%、5.0%和7.5%时均能增加松乳菇菌丝密度，且添加量为7.5%时增加松乳菇菌丝密度效果最佳；L1-L3和L1-L2-L3两个组合也能增加松乳菇菌丝密度。通过对3株菌株形态特征鉴定和16S rDNA序列测定，L1菌株为高山芽孢杆菌(Bacillus altitudinis),L2菌株为蜡样芽胞杆菌(B.cereus),L3菌株为环状芽孢杆菌(B.zanthoxyli)。【结论】筛选出3株可促进松乳菇菌丝生长的芽孢杆菌，其中B.zanthoxyli促进松乳菇菌丝生长效果最好。
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基于非靶向代谢组学分析黄色和白色金针菇代谢物差异
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：金针菇Flammulina filiformis是我国重要的食用真菌，主要包括黄色和白色两种品系。为了探究不同颜色金针菇子实体代谢物的差异，以相同条件下栽培的黄色和白色金针菇子实体为供试材料进行非靶向代谢组学分析。结果显示：大部分差异代谢物在黄色金针菇中的积累量明显较高，黄色和白色子实体之间的差异代谢物显著富集到苯丙氨酸和酪氨酸及色氨酸生物合成途径、淀粉和蔗糖代谢途径。黄色金针菇中苯丙氨酸含量降低同时酪氨酸含量增加，对应的苯丙氨酸解氨酶基因PAL1的表达水平下调，酪氨酸酶基因TYR表达上调；苯丙氨酸解氨酶和酪氨酸酶的活性均显著高于白色金针菇。此外，益智或呈味相关氨基酸半胱氨酸、精氨酸、脯氨酸、天冬氨酸和组氨酸在黄色金针菇中含量更高。本研究整体呈现了两种金针菇的代谢物差异并为后续完整解析子实体颜色表型差异提供了线索和铺垫。
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中国皱木耳类群种质资源鉴定和表型性状分析
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：以我国27株皱木耳类群种质资源为材料，利用ITS进行分子鉴定，采用多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法，对16个表型性状进行评价。结果表明：供试菌株鉴定为皱木耳类群中的2个物种中国皱木耳和皱木耳；16个表型性状的Shannon-Wiener’s多样性指数范围为0.42–1.60，平均值0.97;4个数量性状变异系数范围为4.35%–26.49%；部分表型性状间存在相关性；经聚类分析，在欧氏距离1.54处，划分为3个类群，5个表型性状即菌丝体胶质物、菌丝体(栽培种)颜色变化、鲜耳片腹面主要颜色、耳片质地和子实体成熟期为类群划分的指标性状；主成分分析将16个表型性状转化为5个主成分，累计贡献率为81.55%，第1主成分的方差贡献率26.67%，命名为子实体颜色性状因子、第2主成分的方差贡献率是23.05%，为菌丝体性状因子、第3主成分方差贡献率仅为12.89%，定为生育期-商品性状因子。经综合分析筛选出菌丝体胶质物、鲜耳片腹面主要颜色和子实体成熟期等3个表型性状作为种质评价关键指标。
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6份毛木耳种质氨基酸组成及其营养评价
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究不同毛木耳种质的氨基酸组成及营养差异，为合理开发利用毛木耳资源提供科学参考。【方法】测定6份毛木耳种质（SH、QB、CB、FS、HY和CF）的氨基酸和常规营养成分，基于主成分分析、聚类分析，利用氨基酸比值（RAA）、氨基酸比值系数分（SRC）等指标综合评价营养差异。【结果】6份毛木耳种质均含17种氨基酸，氨基酸总量4.139～6.314 g/100 g，以QB的氨基酸总量最高，且显著高于其他5份种质（P＜0.05，下同）；天门冬氨酸（Asp）和谷氨酸（Glu）含量相对较高，半胱氨酸（Cys）、蛋氨酸（Met）、酪氨酸（Tyr）和异亮氨酸（Ile）含量相对较低；第一限制性氨基酸为Met+Cys，第二限制性氨基酸为赖氨酸（Lys），呈味氨基酸以鲜味氨基酸为主，必需氨基酸与总氨基酸比值均高于联合国粮食及农业组织/世界卫生组织（FAO/WHO）模式；SRC为63.999～75.217，以FS和CB相对较高。不同毛木耳种质营养差异明显，必需氨基酸含量1.515～2.227 g/100 g,QB和HY显著高于其他种质；蛋白质含量5.508～7.707 g/100 g，以HY最高；粗多糖含量3.827～10.140 g/100 g，钙含量1.790×10~3～4.867×10~3 mg/kg，铁含量17.007～180.667 mg/kg，灰分含量1.967～5.400 g/100 g，均以FS最高；粗脂肪含量0.100～0.500 g/100 g，锌含量6.333～10.800 mg/kg，硒含量0.015～0.084 mg/kg，均以CB最高，且显著高于其他种质。主成分分析结果显示，6份种质氨基酸综合得分由高到低排序为QB＞HY＞FS＞CF＞CB＞SH。聚类分析将6份种质分成三大类群，SH、CB和CF聚为类群Ⅰ，综合品质较差；FS单独聚为类群Ⅱ，综合品质居中；QB和HY聚为类群Ⅲ，综合品质最佳。【结论】6份毛木耳种质氨基酸种类齐全，必需氨基酸占比较高，营养均衡性好；不同毛木耳种质的氨基酸组成及营养品质差异明显，以QB和HY的综合营养品质最佳。
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莲子壳主料对代栽灵芝生长及其生产效益的影响
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：莲子壳作为农业副产物体量较大，可用作食用菌栽培原料。本研究以资源化利用莲子壳和拓展灵芝栽培原料来源、降本增效为目的，以10%、20%、40%、60%和80%的莲子壳替代基础配方（杂木屑45%、玉米芯45%、麦麸5%、玉米粉4%、石膏1%）的木屑和玉米芯，研究各试验配方的灵芝农艺性状、品质及生产效益，从中优选出莲子壳基质高效配方，为探究莲子壳在代料灵芝生产中的应用提供依据。结果表明，培养料添加一定比例莲子壳可促进灵芝菌丝生长，60%处理的菌丝生长速度最快，达4.44mm/d；基料添加莲子壳会减少菌柄长度、菌盖厚度和子实体含水量，对菌盖大小、菌柄直径和单朵鲜重无明显影响。活性成分测定结果表明，随栽培料莲子壳比例的增加，灵芝子实体多糖和蛋白质含量明显增加，80%处理的多糖含量（10.57mg/g）是对照的1.66倍、蛋白质含量（15.14%）显著高于对照（14.12%）；而栽培料莲子壳对灵芝子实体三萜酸的影响呈“低比例促进、高比例抑制”趋势。另外，莲子壳配方会显著提高灵芝子实体氨基酸总量，以10%处理最高，氨基酸总量为32.44%，该处理检测到13种氨基酸的含量最高值。生产效益分析表明，栽培料添加莲子壳可显著提高灵芝栽培利润，以80%处理栽培利润最高（1.22元/袋）。综上所述，莲子壳作为原料栽培灵芝有明显增产效果，可进一步示范推广。
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