科研产出
川芎α-淀粉酶抑制剂基因的原核表达与条件优化
《生物学杂志 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：利用实验室前期已获得的α-淀粉酶抑制剂基因(LASI),将其分别连接到不同载体上构建重组原核表达质粒,在原核表达系统中诱导表达LASI重组蛋白,并优化其诱导条件.通过Western Blot分析鉴定LASI重组蛋白,并采用碘-淀粉呈色法测定LASI对猪源淀粉酶的抑制活性.结果表明:pET28a是LASI的较好表达载体,当诱导时间为8 h,IPTG终浓度为1.0 mmol/L,诱导温度为27℃时,LASI重组蛋白的表达量达到最佳;在最优的诱导表达条件下,表达出的部分LASI重组蛋白以可溶性蛋白的形式存在,并能够与HIS标签单抗杂交;经纯化后获得的LASI重组蛋白对猪源淀粉酶存在抑制作用,终抑制比为34%.研究优化LASI重组蛋白的表达条件,获得足量的LASI重组蛋白,为进一步研究LASI的功能奠定基础.
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153份四川小麦主推品种和后备品系抗病基因的分子检测
《麦类作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解四川现有主栽小麦品种的抗病现状,发现并推广多抗性小麦品种,选用四川省153份小麦主要推广品种和后备品系,采用条锈菌接种诱发鉴定的方法于2018-2019和2019-2020年度进行条锈病成株期抗性鉴定与分析,同时利用已知抗病基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Pm21和Fhb1的分子标记分别对其进行抗条锈病、赤霉病和白粉病基因检测.结果显示,在153份供试小麦材料的条锈病成株期抗性鉴定中,两年度均表现为抗病的材料有122份,占供试材料的79.7%.分子标记检测结果表明,可能携带抗条锈病基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18和Yr26的小麦材料分别有12、25、77、12、4和90份,分别占供试材料的7.8%、16.3%、50.3%、7.8%、2.6%和58.8%;可能携带抗白粉病基因Pm21的小麦材料有40份,占供试材料的26.1%;可能携带抗赤霉病基因Fhb1的小麦材料有12份,占供试材料的7.8%;有15份抗病材料未检测到本研究所测基因.
关键词： 小麦;条锈病;赤霉病;白粉病;分子检测
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'金冠'苹果及优系(SGP-1)果实糖积累与其代谢相关酶活性研究
《西北农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以'金冠'苹果及其优系(SGP-1)为试材,测定果实发育期间可溶性糖及组分含量和代谢相关酶活性,分析它们的变化规律及相关关系,明确糖分积累的关键时期和关键酶,探讨两材料果实生长发育期间糖代谢的生理差异.结果表明:(1)两材料果实中可溶性糖呈上升趋势,在果实发育前期,'SGP-1'可溶性糖的含量显著高于'金冠',到后期则显著低于'金冠'.(2)两材料果糖、蔗糖、葡萄糖和山梨醇含量变化趋势一致,除山梨醇外,总体呈上升趋势.前期'SGP-1'山梨醇含量显著高于'金冠';后期果糖和葡萄糖含量显著高于'金冠',蔗糖和山梨醇则显著低于'金冠',且两材料成熟果实均以果糖占比最高.(3)'金冠'与'SGP-1'果实的糖代谢酶活性在前期变化趋势不同,后期基本一致;'SGP-1'总体表现为前期显著高于'金冠',后期除SOX高于'金冠',其余酶活性持平或显著低于'金冠'.(4)相关性分析表明,果实发育前期'SGP-1'果实各糖组分含量主要受SDH、SS-S调控,而'金冠'则主要受SDH、NI调控;后期'SGP-1'果实各糖组分含量主要受SPS、NI调控,而'金冠'则主要受SPS、SS-C和AI调控.研究发现,'SGP-1'果实糖积累的关键期为发育前期,而'金冠'则在发育后期快速积累,且对两材料糖积累起主要调控作用的酶活性和种类存在差异.
关键词： ’金冠’苹果 ’金冠’优系 果实品质 糖积累 糖代谢酶
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道地中药材川贝母特异性PCR鉴别方法研究
《中国农学通报 》 2022 CSCD
摘要：为建立快速检测中药材川贝母成分的特异性PCR法,从NCBI数据库下载植物HMGR基因序列,根据同源性区域设计兼并引物,对川贝母及其易混品鳞茎基因组进行扩增.通过比对川贝母特异性DNA片段区域,设计引物扩增获得川贝母基原物种特异核酸片段.从川贝母基原鳞茎中提取DNA,设计特异引物对BMH-TF/BMH-TR,优化PCR扩增条件,通过特异性、灵敏度实验验证,建立特异性PCR检测体系.采用该方法从川贝母基原中扩增出一条120 bp左右条带,而非川贝母样品、空白对照在相同条件下无扩增条带,检测灵敏度为2 ng/μL,检测下限为4 ng.对10个市售药材的检测结果证明,该方法简便可行、重现性好.该PCR法可快速、准确鉴别川贝母基原,具有操作简便、快速、特异性高的优点.
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家蚕非滞育红卵突变体Re-nd突变基因的定位克隆
《昆虫学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】家蚕Bombyx mori非滞育红卵突变体Re-nd是唯一在非滞育状态下卵色呈现鲜红色的突变品种。本研究通过基因连锁分析和定位克隆的方法确定Re-nd的突变基因所在的染色体及紧密连锁位置，为后续Re-nd的功能研究及应用奠定基础。【方法】以家蚕卵色突变体Re-nd和野生型大造进行杂交，配制基因连锁分析群体材料和定位克隆群体材料；针对家蚕全染色体进行SNP标记开发，利用BC1代群体材料进行基因连锁分析，确定Re-nd的突变基因所在的染色体；针对定位的Re-nd的突变基因所在染色体进行SNP标记开发，利用BC1群体材料对Re-nd的突变基因进行定位克隆。【结果】基因连锁分析结果显示Re-nd的突变表型与第6号染色体上的SNP标记完全连锁；初步定位克隆结果显示Re-nd的突变基因位于SNP标记SNP7和SNP17之间，物理距离4.04 Mb;以SNP7和SNP17之间筛选出的6个SNP标记和25个重组个体进行精细定位克隆，结果显示Re-nd的突变基因所在的区域位于SNP10和SNP12两个SNP标记之间的nscaf2853上，物理距离949.3 kb左右。【结论】将Re-nd的突变基因定位于第6号染色体的2个SNP标记SNP10和SNP12之间，物理距离约949.3 kb。本研究为后续Re-nd突变基因的精细定位及功能应用研究奠定了基础。
关键词： 家蚕 非滞育红卵 标记开发 基因连锁分析 定位克隆
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‘金冠’苹果及其优系(SGP-1)果实发育期间有机酸代谢特征比较
《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以‘金冠’苹果及其优系‘SGP-1’为试材，测定果实发育期间有机酸组分、含量和苹果酸代谢相关酶活性，分析它们的变化规律及相关关系，以探索苹果有机酸积累的关键时期和关键酶，揭示果实低酸成因。结果表明：(1)苹果果实发育期间，‘SGP-1’的有机酸含量显著低于‘金冠’,成熟时仅为‘金冠’的二分之一，且主要由苹果酸、奎宁酸、酒石酸和柠檬酸组成，幼果期以奎宁酸为主，成熟期以苹果酸为主。(2)‘SGP-1’的苹果酸含量显著低于‘金冠’,其在幼果期和膨大期变化规律与‘金冠’相反，且积累关键时期和快速下降期早于‘金冠’;‘SGP-1’果实其余酸组分含量变化趋势与‘金冠’基本一致，但在幼果期显著高于‘金冠’,在成熟期与‘金冠’差异不显著。(3)‘SGP-1’的苹果酸代谢相关酶活性在幼果期均显著高于‘金冠’,成熟期持平或显著低于‘金冠’;幼果期MDH活性和成熟期ME活性在两材料间变化规律相反。(4)‘SGP-1’的幼果期苹果酸积累与PEPC和VHA活性呈极显著正相关关系，而同期‘金冠’则与MDH、PEPC和VHA活性呈极显著负相关关系；‘SGP-1’膨大期苹果酸积累与MDH、PEPC活性呈极显著负相关关系，与PEPCK和VHA活性呈显著正相关关系，而同期‘金冠’则与PEPC、ME和VHP活性呈极显著或显著负相关关系；二者成熟期苹果酸积累均与MDH、PEPC、ME和VHP活性呈极显著或显著负相关关系。研究发现，‘SGP-1’是以苹果酸为主的低酸型‘金冠’苹果变异优系，对苹果酸积累起主要调控作用的酶种类和活性与‘金冠’不同，导致了‘SGP-1’的低酸品质，该研究结果为深入探索果实低酸形成机理和培育高糖低酸新品种奠定了基础。
关键词： ‘金冠’苹果优系(SGP-1) 有机酸积累 苹果酸代谢酶
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长江鲟mstn克隆、组织分布以及饥饿复投喂对其在肌肉中表达量的影响
《农业生物技术学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：肌肉生长抑制素(myostatin, mstn)是肌肉生长的负调节因子,属于转化生长因子β(transforming growth factorβ, TGF-β)家族成员,通过抑制成肌细胞增殖发挥作用。为研究mstn在长江鲟(Acipenser dabryanus)补偿生长过程中的作用机制,本研究根据前期转录组测序结果克隆验证mstn CDS区cDNA序列,分析该基因在饥饿0、3、7和14 d以及在饥饿后复投喂14 d条件下各组织的表达情况。结果显示,长江鲟mstn全长为2 552 bp (GenBank No. MZ666180),CDS区为1 122 bp,编码373个氨基酸;在肌肉中表达量最高,其次是皮肤、鳃和眼;饥饿条件下,长江鲟肌肉mstn表达量随饥饿时间的延长逐渐下降;复投喂14 d后,3 d组mstn表达量显著高于对照组(P<0.05),7 d和14 d组mstn表达量与对照组没有显著差异(P>0.05)。表明饥饿能抑制长江鲟mstn的转录,而短期饥饿后及时补充营养物质,能激活长江鲟肌肉mstn功能。本研究为评估长江鲟对环境胁迫的生理适应机制提供参考,有助于了解长江鲟的生长及其生长调控机制,为今后的生产实践提供参考。
关键词： 长江鲟 肌肉 肌肉生长抑制素(mstn) 饥饿复投喂
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水稻干尖线虫生殖方式、生活史及温度对其存活能力的
《植物保护学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解近年我国水稻主产区水稻干尖线虫Aphelenchoides besseyi种群的生物学特性,并为寻找新的水稻干尖线虫病害防控方法,通过在胡萝卜愈伤组织、灰葡萄孢菌Botrytis cinerea和水稻中培养水稻干尖线虫的方法对其生殖方式、生活史和温度对其存活能力的影响及其在水稻中的分布进行研究.结果表明,在供试的12个水稻干尖线虫种群中,只有G8-315种群可孤雌生殖;在25℃下,水稻干尖线虫在胡萝 卜愈伤组织和灰葡萄孢菌上生活史均约为12 d,在水稻苗上生活史约为11 d;-20℃以下低温或42℃以上高温处理12 h,在清水、胡萝 卜愈伤组织和灰葡萄孢菌中水稻干尖线虫存活率均显著下降,处理72 h水稻干尖线虫存活率均为0;带虫干燥谷粒在-80、-20和4℃低温保存6个月后,谷粒内水稻干尖线虫存活率均显著低于25℃(对照),其中-80℃保存的谷粒内水稻干尖线虫存活率为0;56、70和80℃高温处理12 h后,2个水稻品种谷粒内水稻干尖线虫存活率均显著下降,80℃处理16 h后2个水稻品种谷粒内水稻干尖线虫存活率均为0;水稻幼苗各部位均可检测出水稻干尖线虫,其中假茎部位水稻干尖线虫数量最多,此外多数谷粒不携带水稻干尖线虫,携带线虫的谷粒呈无规则随机分布.
关键词： 线虫 水稻干尖线虫 孤雌生殖 极端温度 存活率 分布 介质
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融合BERT-WWM和注意力机制的茶叶知识图谱构建
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]针对当前茶叶领域语料数据库不完善、多源异构数据聚合能力差、知识共享困难等问题,提出一种基于BERT-WWM-BiLSTM-AttTea-CRF模型的茶叶知识图谱构建方法.[方法]以基于全词掩码的BERT-WWM(Whole Word Masking)层替换预训练模型中的随机掩码BERT层,并根据茶叶领域语料数据的全局文本特征,设计可实现茶叶关键实体权重分配的注意力机制层以提高文本提取的准确率,最后通过条件随机场对序列中的各个实体进行分类提取,从而完成茶叶中文实体识别的整个流程.[结果]BERT-WWM-BiLSTM-AttTea-CRF模型能有效识别茶叶知识文本数据中的实体,对茶叶非结构化数据的实体抽取效果优于RoBERTa_BiLSTM_CRF、ALBERT_BiLSTM-CRF 等主流模型,识别的准确率、召回率、F1 值分别为 92.03%、90.36%、91.19%.经改进后的模型对茶叶品种数据和茶叶病害数据的识别率有明显提升,其F1值分别达到94.32%和94.05%.[结论]本研究所构建的茶叶知识图谱具有数据覆盖面广、聚合能力强、体系完整等优势,对农业特定领域的知识图谱构建和农业中文命名实体的提取研究具有重要意义.
关键词： 茶叶 知识图谱 条件随机场 双向长短词记忆模型 注意力机制
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