科研产出
大渡河上游鱼类资源现状
《淡水渔业 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:2017-2019年,对大渡河上游鱼类种类组成、优势种和多样性指数等进行了调查。结果显示:大渡河上游采集到鱼类2目6科24种,其中包括了四川省级保护鱼类2种、长江上游特有鱼类8种以及外来物种3种。大渡河上游现有分布鱼类以齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)和重口裂腹鱼(S.davidi)等为优势种群,生态类群以杂食性、底层、冷水性为主;鱼类种类数、Shannon-Weiner多样性指数、Margalef物种丰富度指数和Pielou均匀度指数均表现为泸定电站库区最高。结果表明大渡河上游鱼类区系组成简单,属典型的青藏高原类群,但受梯级电站的开发、肆意地人工放生活动等影响,鱼类资源呈现衰退趋势,外来鱼类入侵现象严重。
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四川省二化螟不同地理种群遗传多态性的差异分析
《应用昆虫学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:【目的】为了解四川省二化螟Chilo suppressalis (Walker)不同地理种群的遗传结构,分析各个种群间的亲缘关系,为区域治理对策提供新的依据。【方法】通过测定四川省17个市县二化螟样本的线粒体COⅡ基因和核糖体ITS基因,利用MEGA软件分析二化螟不同地理种群的基因遗传多样性,以获取样本群体遗传多样性信息。【结果】对114条幼虫线粒体COⅡ基因序列分析发现,在500 bp的区段中共有147个位点存在多态性,包含33个单倍型;川东地区和川西地区二化螟种群的单倍型多样度分别为0.703 83和0.802 26;系统发育树显示,除眉山-1-1种群之外,其他二化螟地理种群聚合为一个大分支。而对同批二化螟核糖体ITS基因序列分析结果表明,在533 bp的区段中存在299个位点多态性,有92个单倍型;川东地区和川西地区二化螟种群的单倍型多样度分别为0.967 48和0.975 71;在系统发育树中,犍为种群聚合为一支,其余种群聚合为一支。【结论】川西地区二化螟线粒体COⅡ基因和核糖体ITS基因多态性比川东地区样本丰富。地理种群之间的遗传分化与分布之间的相关性不大,这可能与种群本身差异相差不大相关。
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1997-2018年盐边县蚕茧生产的空间分异特征
《中国蚕业 》 2021
摘要:蚕桑产业是盐边县乡村振兴的主打产业之一。以盐边县各个乡镇的蚕茧产量为基础,探究1997—2018年盐边县蚕茧生产的时空格局演变特征,以揭示盐边县蚕茧生产格局的形成过程。结果表明:(1)1997年—2018年期间,盐边县的蚕茧生产总量整体表现为一种上升趋势,2018年达到3 233 t。(2)盐边县的蚕茧产量超过1 000 t的乡镇有2个,分别是惠民乡和永兴镇。(3)盐边县的蚕茧产量超过100 t的乡镇有6个,分别是惠民乡、永兴镇、渔门镇、国胜乡、鱤鱼彝族乡和箐河傈僳族乡。(4)盐边县各蚕茧生产乡镇的年际变化特征存在明显差异。其中,2000年、2010年和2017年分别为从减到增、从加速增加到增速放缓、从增速放缓到二次加速增加的3次转折的3个明显的时间节点。(5)盐边县蚕茧产量增速最快的3年分别是2000年、2004年和2017年,这一特征较好地吻合了盐边蚕丝业大事件的发生,表明了政府、企业和学会在推动蚕桑产业发展中的作用是不可忽略的。这将为其他山地地区乡村振兴提供实际的案例与发展借鉴。
关键词: 县域 蚕桑产业 蚕茧产量 乡村振兴 多元化 时空组学
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桑轮纹病发生区桑叶表面细菌群落结构在冠层内的分异
《中国生态农业学报(中英文) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:探明桑轮纹病发生区冠层内叶表面微生物多样性、结构组成和功能的变化情况,有助于快速筛选控制桑轮纹病病原菌(Gonatophragmium mori)潜在的拮抗微生物。本研究基于高通量测序技术,分析冠层上部和下部叶片上表面和下表面细菌相对丰度的差异。结果发现:1)在多样性指数(Shannon)上,冠层上部叶片是冠层下部叶片的1.26倍,冠层内叶片上表面是下表面的1.49倍。2)在结构上,冠层下部叶片的下表面(LB)和冠层上部叶片的下表面(UB)的优势属均为泛菌属(Pantoea),其相对丰度分别为38.04%和25.31%,而冠层下部叶片的上表面(LS)为沙雷氏菌属(Serratia)、冠层上部叶片的上表面(US)为寡养单胞菌属(Stenotrophomonas),其相对丰度分别为18.0%、23.73%。3)在功能上,冠层下部叶片细菌的碳水化合物和氨基酸的运输和代谢功能比冠层上部叶片强,然而脂质的运输和代谢功能比冠层上部叶片弱;冠层上部叶片上表面细菌的细胞壁生物发生功能比下表面强,而氨基酸的运输和代谢功能弱于下表面;冠层下部叶片上表面细菌的次生代谢物的生物合成、运输和分解代谢和脂质运输和代谢功能强于下表面,而细胞运动比下表面弱。4)冠层内叶片表面芽孢杆菌属(Bacillus)、不粘柄菌属(Asticcacaulis)和苯基杆菌属(Phenylobacterium)的相对丰度与病原菌的相对丰度负相关性显著(P<0.05),相关性最大的为芽孢杆菌属,系数为-0.87。上述结果表明桑轮纹病发生区冠层内桑叶上下表面细菌群落的多样性、结构组成和功能存在显著差异,对进一步研究桑轮纹病的生物防控具有一定的科学意义。
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基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析
《华北农学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:为揭示甘薯及其野生种之间的遗传多样性,分析甘薯及其野生种之间的遗传关系,利用SCoT分子标记对22份甘薯及其野生种三浅裂野牵牛和三裂叶薯的PCR扩增结果、遗传多样性、进化关系、群体结构进行分析。结果表明:43条SCoT引物共检测到278条稳定条带,每条引物可检测4~12个条带;SCoT-8、SCoT-20、SCoT-26、SCoT-36、SCoT-35 5条引物多态性丰富,可用于甘薯及其野生种研究的分子标记。基于分子标记的遗传多样性分析表明,三浅裂野牵牛的遗传多样性最高,甘薯次之,三裂叶薯最小。遗传聚类和群体遗传结构分析结果将参试22份种质材料分为三大类群,各材料归类基本和其所属物种一致,不同物种间的血缘交流少,遗传组成相对单一,比较而言,甘薯与三浅裂野牵牛之间的血缘交流比三裂叶薯之间的血缘交流多,其与三浅裂野牵牛之间的遗传关系较三裂叶薯更近。综上,研究结果初步证明SCoT分子标记在甘薯进化研究中具有潜在应用价值,同时揭示了甘薯与其近缘野生种之间的不同遗传关系,为今后甘薯育种中引入三浅裂野牵牛等野生种血缘,提高甘薯遗传多样性提供了理论支持。
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盐渍藠头盐水细菌多样性及基因功能预测分析
《中国酿造 》 2020
摘要:采用Mi Seq高通量测序技术对来凤地区盐渍藠头盐水细菌多样性进行解析,并采用PICRUSt技术对其基因功能进行预测.结果表明,99.58%的基因序列长度为425~451 bp,基本覆盖16S r RNA V3-V4区序列;优势细菌门为硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),平均相对含量分别为43.94%、33.12%和18.21%;优势细菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)和嗜热油菌属(Thermoleophilum),平均相对含量分别为30.28%、18.21%和16.13%;共有219个核心操作分类单元(OTU),包含的序列数占总序列数的75.56%;盐渍藠头盐水中可能共有大量具有较强氨基酸转运和代谢功能的细菌类群.
关键词: 藠头 高通量测序 细菌多样性 乳酸菌 基因功能预测
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四川省丁香假单胞猕猴桃致病变种的遗传多样性分析
《中国农学通报 》 2020
摘要:为明确四川省猕猴桃溃疡病菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)的遗传多样性及群组划分与地理来源的相关性。以四川省不同地理来源的40个Psa菌株为研究试材,用rep-PCR技术进行分子标记,NTSYS软件分析UPGMA聚类。3对rep-PCR检测引物(REP、ERIC和BOX)共获得42个位点,其中38个为多态位点,占90.5%。UPGMA聚类结果显示,以相似系数为0.70阀值时,40个Psa菌株被分为2个类群(Ⅰ、Ⅱ),其中85.0%的菌株属于第Ⅱ类群;在相似性系数为0.80时,第Ⅰ类又可分为2个亚类(Ⅰ-1、Ⅰ-2),第Ⅱ类则分为5个亚类(Ⅱ-1、Ⅱ-2、Ⅱ-3、Ⅱ-4、Ⅱ-5),菌株无明显的采集地聚类。以上结果表明,四川省各地区的猕猴桃溃疡病菌菌株具有较高的遗传多样性,但其遗传变异与菌株地理来源无明显相关性。
关键词: 猕猴桃 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种 rep-PCR 遗传多样性 遗传变异
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康定冬虫夏草子囊孢子弹射期土壤细菌群落研究
《中国食用菌 》 2020
摘要:为探究四川甘孜藏族自治州康定市冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)在子囊孢子弹射期土壤理化因子和细菌群落组成,找出可能影响冬虫夏草子囊孢子弹射的关键菌群,为更好开展冬虫夏草人工抚育奠定基础。以康定冬虫夏草人工抚育基地土壤为研究对象,对冬虫夏草虫体周际土壤和对照土壤进行高通量测序和土壤理化因子分析。结果显示:冬虫夏草虫体周际有机质(OM)、总氮(TN)、碱解氮(AN)、pH、镉(Cd)、铅(Pb)、汞(Hg)和砷(As)均显著低于对照地(P<0.05),有相对更高含量的速效钾。样品细菌群落划分为33门、126纲、230目、375科、592属。门水平上,Proteobacteria、Acidobacteria和Actinobacteria为相对丰度最高的前三个门,三者占样品相对丰度比78.29%~81.47%,且Proteobacteria与Hg、AN和OM呈正相关;Acidobacteria与AP呈正相关,与OM、TN、Pb和As呈负相关;Actinobacteria与AK和OM呈正相关。属水平上,Rhodoplanes、DA101 (未命名)、Candidatus Solibacter、Ralstonia、Ochrobactrum、Rhodococcus等无论是否在冬虫夏草产地都有分布,以Rhodoplanes在J1、J2和J3中平均相对丰度分别为6.33%、6.28%和4.41%,显著高于J4的1.96%。研究结果对冬虫夏草子囊孢子弹射期其虫体周际土壤重金属、常规理化性质及土壤细菌组成有了进一步的认识,对更好开发康定市冬虫夏草资源具有重要意义。
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四川省小麦育成品种系谱分析及发展进程
《遗传 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:品种系谱蕴含亲本来源、选育方式、亲缘关系等大量信息,对揭示农作物品种演变特点、规律并最终指导育种实践具有重要意义。本文汇总了四川省1936~2017年间326个小麦品种的系谱信息,对育种方式、亲本构成、高频亲本及骨干亲本的变化、遗传贡献、易位系及人工合成种质分布等情况进行了梳理与分析。从20世纪30年代至今,四川省育种家从大量材料中选用387个直接亲本,采用杂交育种等方式,配制数千个组合,从256个组合中选育出314个品种,对四川省小麦生产做出了重要贡献,同时也为小麦育种提供了更为优异的材料基础。四川省小麦育种经历了从无到有,从主要依靠引进材料、地方品种到自主创制材料的过程;高频亲本、骨干亲本随育种进程推进而逐渐变化。易位系和人工合成种质对四川省小麦育种贡献巨大。育种目标的一致性必然导致遗传多样性散失和遗传基础脆弱,今后重点应加强资源的创制、保护和利用。本文通过育成品种的系谱梳理,对四川省小麦的育种发展进程进行了分析,以期为未来种质资源的收集创制和育种研究提供重要参考信息。
关键词: 小麦育种 系谱 遗传贡献 遗传多样性 易位系 人工合成种质
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