科研产出
毛木耳种质资源表型性状遗传多样性分析及综合评价
《核农学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为研究毛木耳种质资源表型性状变异分布和多样性特征，分析性状间关系，筛选毛木耳评价指标和性状优异的种质，本研究以我国56份毛木耳种质为材料，对其18个表型性状进行精准鉴定，采用Shannon-Weaver多样性指数、变异系数等进行表型性状遗传多样性分析，综合运用相关性分析、聚类分析、主成分分析和逐步回归等方法对毛木耳种质进行综合评价。研究结果表明，毛木耳种质资源遗传多样性指数为0.090～1.978，数量性状变异范围为4.00%～40.39%。大部分表型性状间存在不同程度的相关性，性状信息重叠。经聚类分析，在遗传相似系数0.47处，可以划分为5个类群。主成分分析将18个表型性状转化为7个主成分/综合因子，累计贡献率为74.75%。56份种质的主成分综合得分（F值）范围为-3.91～2.21，将毛木耳种质资源划分为6个群组，部分群组与聚类分析的类群重合。基于F值筛选出5份表型性状优良的种质，可进一步发掘利用。结合逐步回归分析方法，经综合评估筛选出8个表型性状，可作为毛木耳的综合评价关键性指标，分别为菌丝体（栽培种）菌棒颜色变化、鲜耳片腹面主要颜色、鲜耳片背面颜色、干耳片腹面颜色、干耳片背面颜色、耳片质地、子实体成熟期和鲜耳片长度。本研究为毛木耳种质资源高效发掘利用和新品种选育提供了重要依据。
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179份燕麦种质在成都平原的农艺性状遗传多样性分析及综合评价
《麦类作物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为给成都平原饲用燕麦育种提供参考，对179份燕麦种质14个主要农艺性状进行遗传多样性分析，并对其中10个数量性状进行聚类分析及主成分分析。结果表明，供试燕麦种质的遗传多样性指数较高，旗叶长遗传多样性指数最大(2.10);分蘖数变异系数最高(33.41%)。通过对10个数量性状的聚类分析，将179份燕麦种质分成5大类群。类群Ⅰ可作为选育籽实目标为主的优秀亲本材料；类群Ⅱ适合用作选育强分蘖的亲本材料；类群Ⅲ优良性状不显著；类群Ⅳ各性状表现一般；类群Ⅴ适合用作选育多目标性状的优秀亲本材料。经主成分分析，10个数量性状中5个主成分累计贡献率为84.57%,第1主成分反映饲草养分组成，第2、第3主成分反映叶片形态特征，第4主成分反映分蘖，第5主成分反映株高。综合来看，燕麦种质CF002393、CF003690、CF014719和CF003691可作为成都燕麦品种选育的改良亲本，有利于加快成都平原地区的燕麦育种进程。
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石榴根腐病植株和健康植株根际土壤细菌群落结构及多样性分析
《中国果树 》 2025 北大核心
摘要：研究石榴根腐病病株与健康植株的根际土壤细菌群落结构及多样性变化，为探究石榴根腐病的微生态发病机理及防治提供理论基础。利用高通量测序技术，分析和比较石榴根腐病患病植株和健康植株的根际土壤细菌群落结构组成及多样性特点。结果表明：患病植株与健康植株相比，根际土壤细菌多样性和丰富度均未达到显著差异；Beta多样性分析表明，患病植株与健康植株根际土壤的细菌群落组成存在明显差异；在优势门菌群中，放线菌门（Actinobacteriota）和变形菌门（Proteobacteria）相对丰度在患根腐病的植株根际土壤中均显著高于健康植株，而酸杆菌门（Acidobacteriota）、芽单胞菌门（Gemmatimonadota）、绿弯菌门（Chloroflexi）以及黏球菌门（Myxococcota）相对丰度在健康植株的根际土壤中均高于患病植株。在属水平上，链霉菌属（Streptomyces）、Actinospica属、分枝杆菌属（Mycobacterium）相对丰度在患病植株根际土壤中均高于健康植株；而芽单胞菌属（Gemmatimonas）相对丰度在健康植株根际土壤中高于患病植株；LefSe分析结果表明，放线菌门和芽单胞菌门在患病植株和健康植株根际土壤中的差异最大。综上所述，健康石榴植株感染根腐病后，根际土壤细菌群落结构和多样性发生了一定程度变化，链霉菌属为相对丰度最高的属，在患根腐病的植株根际土壤中明显富集，可作为候选生防菌群。
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救荒野豌豆种质资源调查收集及表型鉴定评价
2025
摘要：救荒野豌豆（
关键词： 救荒野豌豆 种质资源 调查收集 表型鉴定 遗传多样性
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四川省82 份蚕豆种质资源的农艺性状鉴定与评价
2025
摘要：四川省是蚕豆资源遗传多样性较为丰富的省份之一，本研究以82份四川省蚕豆地方种质资源为试验材料，通过遗传多样性指数、变异系数、相关性分析、聚类分析和主成分分析鉴定评价四川蚕豆地方资源的多样性水平，并筛选优异种质资源。结果表明，82份蚕豆种质资源的叶形、鲜茎色、赤斑病抗性与褐斑病抗性遗传多样性丰富；除荚宽和生育日数外的11个数量性状变异系数在11.70%~38.39%之间，每荚粒数、结荚节数、单株荚数和单株粒数的变异系数较大。相关性分析结果显示，株高、百粒重、有效分枝、结荚节数、单株荚数和单株粒数均与单株粒重呈显著或极显著正相关。聚类分析将82份蚕豆种质资源分为四类，其中第I、IV类资源的与产量正相关的性状表现较好。主成分分析提取到5个主成分，累计贡献率达79.858%，有效分枝、结荚节数、单株荚数对主成分1贡献较大，为优异资源评价的关键农艺性状，进一步筛选了主成分因子加权得分大于1的7份种质资源作为优异资源。本研究结果反映了四川省蚕豆地方种质资源的综合表现，为优异资源保护、挖掘和利用提供了数据支撑。
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成都市蝶类名录及保护策略研究
《四川农业科技 》 2025
摘要：中国大约有蝶类1700余种，而四川省约有650种，但关于成都市的蝶类种数尚不明确。2024年4—9月，对成都市11个行政区设置了20条样线，系统开展了蝶类调查，共调查到5科98种蝴蝶，分别为凤蝶科15种、粉蝶科10种、蛱蝶科47种、灰蝶科17种、弄蝶科9种。结合已有文献资料整理得出成都市蝶类共230种，分别为凤蝶科9属25种、粉蝶科7属22种、蛱蝶科42属115科、灰蝶科26属35种、弄蝶科22属33种，其中国家重点保护的野生动物有裳凤蝶(Teinopalpus imperialis)、金裳凤蝶(Troides aeacus)、三尾凤蝶(Bhutanitis thaidina)。根据成都市蝶类名录，提出了保护自然栖息地、优化城市公园的植被、修复退化栖息地、建立监测体系四项保护建议。
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黄颡鱼生长相关SSRS多态性与性状关联分析
《水产学杂志 》 2025
摘要：本研究选取黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）生长激素（growth hormone,gh）基因微卫星位点gh-GA和生长性状QTL定位点区域内微卫星pfu11克隆序列pfu11-CA位点，分析同一批次繁殖的12月龄、体质量1 g左右的300尾黄颡鱼的遗传多样性和主要生长性状的关联情况。结果表明，位点gh-GA在267尾样本中检测到的等位基因数（Na）为6，观测杂合度（H_o）为0.801，期望杂合度（He）为0.749，多态信息含量（PIC）为0.708；位点pfu11-CA共有292尾样本获得分型结果，Na为5,H_o为0.592,He为0.623,PIC为0.548。这两个位点均为高度多态，符合哈代温伯格平衡，不存在连锁不平衡现象。性状关联分析结果表明，gh-GA位点DE基因型的全长显著高于DF和CE基因型，DE基因型的体长显著高于AF、DF和CE基因型。pfu11-CA位点BC基因型的全长和体长均极显著高于DE基因型，AC和BC基因型的全长和体长均显著高于AE和DE,AC和BC基因型的体质量均显著高于DE。gh-GA位点的DE基因型，以及pfu11-CA位点的AC和BC基因型为优势基因型，这两个位点可作为生长性状的候选位点。本研究可为开展黄颡鱼生长相关遗传标记研究提供可靠的分子遗传学工具。
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基于RAD-seq技术的俄罗斯鲟SNP分子标记开发
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于限制性位点相关DNA测序(RAD-seq)开发出俄罗斯鲟(Acipenser gueldenstaedti)的潜在单核苷酸多态性(SNP)分子标记,掌握俄罗斯鲟人工养殖群体的遗传多样性,为深入研究鲟形目鱼类的保护遗传学提供技术支撑.[方法]通过CTAB法提取俄罗斯鲟鳍条DNA,构建DNA文库后利用Illumina NovaSeq 6000测序平台完成RAD-seq,经质控过滤、聚类组装及比对分析等筛选出潜在的SNP位点,并以SNaPshot和Sanger测序对SNP位点进行验证.[结果]5个俄罗斯鲟样本RAD-seq共获得14.24 Gb原始数据(Raw base),平均每个样本的有效数据(Clean base)为2.84 Gb,平均有效数据率为99.54%,Q20均在96.00%以上,GC含量在40.52%~41.36%.数据组装总长度为53211245 bp,组装Contig的平均长度为343 bp,N50为404 bp;各样本测序得到Reads与组装基因组的比对率在59.89%~62.43%,平均测序深度为15.75~23.84倍.5个俄罗斯鲟样本RAD-seq获得的SNPs位点总数在299416~367709个,SNP转换位点数在183070~224458个,SNP颠换位点数在116346~143251个,转换/颠换比(Ts/Tv)平均为1.57;SNP位点的杂合率在82.81%~97.43%,其突变类型可分为6种(T/C、T/A、T/G、C/G、C/A和A/G),以T/C或A/G的出现频率最高.基于Sanger测序从随机挑选的100个潜在SNPs位点中筛选出36个多态性SNPs位点,其突变类型中以A/G的出现频率最高(44.4%),其次是T/C(出现频率为36.1%),A/C、C/G和G/T的出现频率相对较低,分别为8.3%、8.3%和2.7%.36个SNPs位点共检测到72个等位基因,最小等位基因频率(MAF)的范围在0.0147~0.5000,观察杂合度(HO)为0.029~0.971,期望杂合度(HE)为0.029~0.523;除Ag18、Ag33、Ag35和Ag36等4个SNPs位点呈低度多态性(PIC≤0.25)外,其他32个SNPs位点均为中度多态性位点(0.25
关键词： 俄罗斯鲟 SNP分子标记 遗传多样性 RAD-seq
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基于全基因组重测序的重庆市水稻稻曲菌遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确重庆市主要水稻产区的稻曲病菌[Ustilaginoidea virens（Cooke） Tak.]群体遗传多样性。【方法】对来源于重庆市铜梁（TL）、合川（HC）、永川（YC）、涪陵（FL）、万州（WZ）、梁平（LP）、忠县（ZX）、丰都（FD）、黔江（QJ）、秀山（XS）、彭水（PS）等11个区（县）的37株稻曲病菌进行重测序,并对其遗传多样性进行深入分析。【结果】对37个U.virens菌株重测序得到约42.5 Gb的高质量测序数据,其中检测到大量的单核苷酸突变。结合系统发育学和全基因组关系矩阵分析将37个菌株分为3个类群,表明不同群体的稻曲菌之间存在差异。所有群体除ZX以外,观测杂合度均大于期望杂合度,表明在重庆市稻曲菌群里面存在显著的杂合选择优势。PS群体拥有最高的Pi值,证明其样本间的差异程度最高,表明其遗传多样性最丰富。固定系数分析结果显示,绝大多数群体间的FST值>0.15,其中最高的FST值出现在HC和TL群体之间,为0.3814,表现出较高的遗传分化;而最低水平的遗传分化出现在YC和ZX群体之间,FST值为0.0537。群体结构分析发现所有菌株大致分为4个亚群。基因流（Nm）分析表明不同群体之间存在8次较大的基因交流,并且传播方向不是单一地从某个地区传入其他地区,而是存在不同区域间交叉、反复的传播事件。Tajima’s D中性检验结果显示,除LP以外,所有群体都表现出大于阈值的Tajima's D值（>0）。上述结果表明所有种群都在经历平衡选择。【结论】稻曲病菌在重庆的遗传多样性处于较高水平,为重庆地区稻曲病的防治和抗病资源选育提供理论依据。
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芦笋根际与非根际土壤微生物群落结构及多样性特征
《四川农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探明四川芦笋根际和非根际土壤微生物群落多样性特征，为芦笋土壤生态系统的构建和保持提供理论依据。【方法】以芦笋根际和非根际土壤为研究对象，测定其土壤理化指标，同时利用高通量测序技术分析土壤细菌、真菌群落特征。【结果】芦笋根际土壤pH、全钾、速效钾均低于非根际土壤，而有机质、全氮、水解氮、全磷和有效磷均高于非根际。根际土壤细菌的多样性和丰度高于非根际，根际真菌的丰度高于非根际，而根际真菌的多样性低于非根际。芦笋根际和非根际土壤优势细菌门主要是变形菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、绿弯菌门，优势真菌门为担子菌门、子囊菌门。LSfSe分析发现在根际土壤中共鉴定14个细菌类群和20个真菌类群与非根际土壤有显著差异。主成分分析（PCA）表明，根际与非根际在土壤细菌及真菌群落结构多样性上均存在较大差异。冗余分析（RDA）显示，pH是影响土壤微生物群落结构组成最重要的因素。【结论】扩展了芦笋根际微生物的多样性的认知谱系，为探讨通过调控土壤微生物群落结构实现芦笋优质高产栽培提供理论依据。
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