科研产出
草地贪夜蛾与黏虫肠道微生物的多样性分析
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要：通过比较分析对食用玉米叶的草地贪夜蛾与黏虫体内肠道共生菌进行比较分析,研究玉米叶内生细菌的组成与草地贪夜蛾和黏虫肠道微生态的相互关系.选用玉米叶饲养的草地贪夜蛾和黏虫,通过16S rDNA全长扩增子测序,比较分析其肠道菌群多样性和丰富度.由α多样性研究结果可知,草地贪夜蛾和黏虫肠道菌群多样性、物种丰富度比较接近;β多样性分析结果也表明,草地贪夜蛾和黏虫肠道菌群落结构相似性较高.KEGG通路功能预测结果表明,草地贪夜蛾和黏虫肠道菌群中均以代谢功能占比最高,主要涉及糖类代谢、氨基酸代谢和能量代谢.同样取食玉米叶的草地贪夜蛾和黏虫的肠道细菌在门水平上的核心菌群相同,在属水平上的优势菌属丰度和物种多样性差异不大,群落结构相似度高,菌群功能差异不显著,其原因可能是物种遗传特点相似、取食食物和生长环境中微生物种类相同.
关键词： 草地贪夜蛾 黏虫 玉米叶 肠道微生物 多样性 丰度
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柏木低效林林窗自然更新状态与人工更新状态植物多样性对比研究-以川中丘陵区为例
《绿色科技 》 2024
摘要：林窗是森林结构调整的重要方式，也是森林群落演替过程的重要环节，对生态系统发展有着举足轻重的推动作用。为研究柏木低效林林窗自然更新状态与人工更新状态生物多样性，2021年3月砍伐形成50、100、150、200 m24种面积的林窗，并设置CK对照组。2021年7月、2022年7月2次采用样方调查法以林下植物为研究对象对不同大小林窗进行生物多样性调查和分析，在自然更新状态林窗中共记录植物11892株，49种，分属46属27科，在人工更新状态林窗中共记录植物15325株，56种，分属52属31科。分析结果表明，以人工更新状态下和自然更新状态林下植物多样性的物种丰富度Shannon-wiener指数、Pielou均匀度指数以及Simpson优势度为指标进行评价，柏木林窗林下植物的多样性在人工更新状态下优于自然更新状态下的林窗。因此，合理地进行间伐、树种引入、上层透光抚育等结构调控改善林分结构，有助于提高林分生物多样性，是柏木低效林经营的方向。
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不同肥力条件下添加黄腐酸对土壤细菌多样性、甘蓝养分吸收及产量的影响
《中国土壤与肥料 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究不同肥力条件下添加黄腐酸对土壤细菌多样性、甘蓝养分吸收和产量的影响，试验以甘蓝‘优贝特’品种为研究材料，共设置4个处理：施底肥+黄腐酸（H-FA）、施底肥（H-CK）、不施底肥+黄腐酸（L-FA）、不施底肥（L-CK）,1株甘蓝总计施入黄腐酸30 mg。结果表明，黄腐酸的施用和肥力对土壤细菌的物种丰富度和群落多样性无显著影响，但添加黄腐酸提高了解磷细菌和促生细菌的相对丰度。施底肥条件下，添加黄腐酸能显著提高氮和磷的生理利用效率，H-FA处理氮和磷生理利用效率分别为（341.00±8.34）和（2296.98±47.49）kg·kg-1，分别为H-CK处理的1.11和1.07倍。未施底肥条件下，添加黄腐酸后植株地上部氮、磷、钾积累量均高于对照。添加黄腐酸显著提高了甘蓝地上部和地下部鲜重，施底肥条件下，与对照相比分别增加了15.8%和20.7%，未施底肥条件下，与对照相比分别增加了16.2%和7.7%。因此，黄腐酸通过促进甘蓝根系生长，从而促进甘蓝产量的增加，添加黄腐酸是实现减肥不减产的有效措施。
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四川省不同流域日本沼虾群体遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]四川省河流众多,野生日本沼虾资源丰富,深入了解四川省日本沼虾种质资源现状,开展不同流域日本沼虾遗传多样性评估具有重要意义.[方法]基于线粒体Cytb序列,对四川省巴河(BH)、涪江(FJ)、嘉陵江(JLJ)、岷江(MJ)和思蒙河(SMH)5个日本沼虾野生群体的遗传多样性进行分析.[结果]所有群体的201尾日本沼虾中共检测出36种单倍型,单倍型多样性(Hd)值为0.345~0.959,Hd均值为0.802,其中JLJ群体的Hd值最高(0.959),而MJ、SMH和BH群体的Hd值相对较低,Hd值均小于0.5.所有群体的核苷酸多样性(Pi)值为0.002 25~0.015 47,Pi均值为0.015 83,其中JLJ群体的Pi值最高(0.015 47),BH群体的Pi值最低(0.002 25).日本沼虾的遗传变异主要来自群体间(68.20%),群体间存在显著的遗传分化,系统发育树分析显示所有群体呈现3个较明显分支.单倍型MJ网络图显示所有单倍型也呈现3个明显谱系,其中谱系A包含优势单倍型Hap 14,谱系B包含优势单倍型Hap 16,谱系C包含优势单倍型Hap 1.[结论]日本沼虾群体遗传多样性总体上处于较高水平,但不同流域的群体间遗传多样性水平差异较大,其中MJ、BH和SMH群体的遗传多样性相对较低,对这些流域内日本沼虾种质资源的保护有待进一步加强.本研究为四川省日本沼虾种质资源的保护与合理开发利用提供了参考依据,有利于促进四川省日本沼虾产业的可持续发展.
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52份枇杷种质资源遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法，为枇杷种质资源发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST-SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记，对52份国内外枇杷种质资源和国家西南特色园艺作物种质资源圃（成都）枇杷育种与栽培创新团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物，每对引物扩增条带为2～5条，平均85条；多态性条带比率为40.00%～100.00%,平均71.55%;多态性信息含量（PIC）为0.250～0.999,平均0.685。遗传多样性分析显示，52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791;果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元，并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外，本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记，为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。
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川芎SSR标记开发及遗传多样性分析
《中国现代中药 》 2024
摘要：目的：基于川芎基因组调研结果开发简单重复序列（SSR）标记，对109份川芎种质资源进行遗传多样性分析，为川芎种质资源评价、保存和新品种选育等提供理论依据。方法：基于Survey测序已组装序列挖掘川芎基因组中的SSR位点并设计引物，筛选多态性高的引物，对109份川芎种质资源进行遗传多样性和遗传分化分析，并在川芎及其近缘物种中进行通用性验证。结果：36对引物在109份川芎种质资源中共检测到102个等位基因位点，观测等位基因数为2.833 3，期望杂合度为0.488 5,Shannon's指数为0.807 1,Nei基因多样性为0.486 0，多态信息含量为0.419 4，采集的109份川芎种质资源具有丰富的遗传多样性。基于遗传距离的聚类分析显示，在遗传相似系数为0.76处，109份川芎聚为两大类，但其与地理分布关系不大。通用性验证显示，36对SSR引物在川芎及其近缘物种中通用性较好。结论：开发的36对SSR标记能很好地揭示川芎的遗传多样性，供试109份川芎种质遗传分化小、基因流较大。
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黄河上游支流白河、黑河鱼类群落组成与结构特征
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：白河和黑河是黄河上游四川省境内的两条支流,其独特的环境及气候条件,为黄河上游特有鱼类提供了良好的繁殖和栖息生境。为了解白河和黑河的鱼类种类组成、群落结构及其多样性,本研究结合历史资料,于2022年冬季(11月)、2023年春季(4月)、夏季(7月)和秋季(9月)对白河和黑河开展了鱼类资源调查。共采集到鱼类11种2936尾,隶属于1目2科8属;其中,黄河上游特有鱼类有花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)、极边扁咽齿鱼(Platypharodon extremus)、骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)和黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi) 4种,国家Ⅱ级重点保护鱼类有骨唇黄河鱼、拟鲇高原鳅(Triplophysa siluroides)、极边扁咽齿鱼、厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychus pachycheilus) 4种,四川省级重点保护鱼类黄河高原鳅(Triplophysa papptnhtimi) 1种,外来物种鲤(Cyprinus carpio)和鲫(Carassius auratus) 2种,分别占总种类数的36.36%、36.36%、9.09%和18.18%。相对重要性指数(IRI)显示,花斑裸鲤和硬刺高原鳅(Triplophysa scleroptera)为白河优势种;花斑裸鲤和厚唇裸重唇鱼为黑河优势种。Shannon-Wiener多样性指数(H)、Margalef丰富度指数(D)和Pielou均匀度指数(J)分别为1.764～2.364、1.364～1.798和0.7854～0.8747。丰度/生物量曲线表明,白河、黑河鱼类群落结构相对稳定,以大个体的鱼类为优势种,群落受到外界扰动程度小。Cluster和NMDS分析显示,在一定的相似性水平上,白河、黑河鱼类群落均分为3组,表明鱼类群落结构组成分布存在差异。与历史资料相比,白河和黑河鱼类呈现种类减少、多样性下降的趋势,其分别占历史总种类数的72.73%、66.67%;但黄河上游特有和保护鱼类占比很高,达到54.55%,且为典型的青藏(中亚)高原鱼类区系。本研究提供了四川境内黄河水系主要支流鱼类资源现状的基础数据,同时为该段黄河上游鱼类的保护提出了建议。
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中国皱木耳类群种质资源鉴定和表型性状分析
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：以我国27株皱木耳类群种质资源为材料，利用ITS进行分子鉴定，采用多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法，对16个表型性状进行评价。结果表明：供试菌株鉴定为皱木耳类群中的2个物种中国皱木耳和皱木耳；16个表型性状的Shannon-Wiener’s多样性指数范围为0.42–1.60，平均值0.97;4个数量性状变异系数范围为4.35%–26.49%；部分表型性状间存在相关性；经聚类分析，在欧氏距离1.54处，划分为3个类群，5个表型性状即菌丝体胶质物、菌丝体(栽培种)颜色变化、鲜耳片腹面主要颜色、耳片质地和子实体成熟期为类群划分的指标性状；主成分分析将16个表型性状转化为5个主成分，累计贡献率为81.55%，第1主成分的方差贡献率26.67%，命名为子实体颜色性状因子、第2主成分的方差贡献率是23.05%，为菌丝体性状因子、第3主成分方差贡献率仅为12.89%，定为生育期-商品性状因子。经综合分析筛选出菌丝体胶质物、鲜耳片腹面主要颜色和子实体成熟期等3个表型性状作为种质评价关键指标。
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川西高原大棚感病番茄根际土壤细菌群落特征
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探索川西高原大棚番茄感病后根际细菌群落的响应状况。【方法】利用高通量技术分析四川省甘孜州道孚县和炉霍县高原大棚健康番茄和发病番茄根际土壤微生物群落的结构特征。【结果】(1)番茄发病状况可解释土壤细菌群落结构23%的总方差。(2)道孚县土壤样品的细菌物种数比炉霍县略高，发病植株比健康植株的细菌物种数略低，但都未达到显著水平。(3)暖发菌门、厚壁菌门、候选门GAL15、螺旋体门的相对丰度在番茄发病后明显降低，而绿弯菌门、候选门RCP2-54、候选门SAR324、异常球菌门的相对丰度则在番茄发病后明显增加。(4)土壤细菌群落结构的7类功能参与了川西高原大棚番茄的健康管理，其中道孚县土壤细菌的铁呼吸功能减弱、芳香化合物降解功能增强，而炉霍县的发酵功能得到较大提升。(5)番茄根际土壤中，道孚县有127个菌种显著响应发病，炉霍县有64个菌种显著响应发病。(6)道孚县根际细菌结构与功能变化源于土壤pH的降低，而炉霍县根际细菌结构与功能变化源于土壤有机质含量的增加。【结论】川西高原大棚土壤微生物功能健全，且在番茄发病过程中能够主动招募有益微生物菌群以应对病害，如道孚县的芽单胞菌属(Gemmatimonas sp.)和炉霍县的异常球菌门细菌(Deinococcota)。
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四川加工型辣椒种质资源遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了评估四川加工型辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系，本研究以24份辣椒种质资源为研究对象，采用iPBS分子标记技术分析其遗传多样性和亲缘关系。结果表明，10条引物共扩增出171条谱带，多态性谱带103条，多态性比率为59.39%。对24份辣椒种质资源的遗传多样性进行分析，其遗传相似系数（GS）在0.713～0.901；根据果型将供试样本分为牛角椒、线椒、羊角椒和小椒4个群体，其中羊角椒群体的遗传多样性最高，其观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因指数（H）和Shannon’s信息指数（I），分别为1.473 7、1.340 9、0.189 2和0.275 2。牛角椒群体的遗传多样性最低，其Na、Ne、H和I分别为1.263 2、1.167 9、0.098 7和0.147 0；按非加权组平均法（UPGMA）构建24份辣椒种质资源的iPBS标记聚类树状图，在遗传相似系数0.82处，可将24份材料分为4个组，与形态学的分类结果存在较大差异。综合分析结果表明，多数供试材料间的亲缘关系较近，而不同组材料间的亲缘关系相对较远，鉴于组间辣椒品种间的亲缘关系以及在产量、成熟期、品质等方面存在差异，故不同组间材料可进行杂交，以选育新品种。
关键词： 加工型辣椒 iPBS分子标记 遗传多样性 聚类分析
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