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盐渍藠头盐水细菌多样性及基因功能预测分析

文献类型： 中文期刊

作者： 葛东颖 1 ; 仇港 1 ; 赵楠 2 ; 赵慧君 1 ; 郭壮 1 ;

作者机构： 1.湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所

2.四川省农业科学院农产品加工研究所

关键词： 藠头;高通量测序;细菌多样性;乳酸菌;基因功能预测

期刊名称： 中国酿造

ISSN： 0254-5071

年卷期： 2020 年 010 期

页码： 157-161

摘要： 采用Mi Seq高通量测序技术对来凤地区盐渍藠头盐水细菌多样性进行解析,并采用PICRUSt技术对其基因功能进行预测.结果表明,99.58%的基因序列长度为425~451 bp,基本覆盖16S r RNA V3-V4区序列;优势细菌门为硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),平均相对含量分别为43.94%、33.12%和18.21%;优势细菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)和嗜热油菌属(Thermoleophilum),平均相对含量分别为30.28%、18.21%和16.13%;共有219个核心操作分类单元(OTU),包含的序列数占总序列数的75.56%;盐渍藠头盐水中可能共有大量具有较强氨基酸转运和代谢功能的细菌类群.

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