科研产出
甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛KNOX基因家族鉴定及其在块根发育中的表达分析
《核农学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究甘薯近缘种三浅裂野牵牛KNOX(ItrKNOX)基因家族在块根发育过程中的作用，本研究在基因组水平对ItrKNOX基因家族进行了鉴定，并利用转录组测序技术对ItrKNOX基因在三浅裂野牵牛Y22块根发育不同阶段的表达量变化进行了分析。共鉴定到分布于10条染色体的12个ItrKNOX基因。进化分析显示，这些ItrKNOX基因可分为Class Ⅰ、Class Ⅱ和Class M三类，KNOX家族基因的类型和数目在三浅裂野牵牛、三裂叶薯、牵牛和圆叶牵牛这4个甘薯属二倍体物种基因组中都较为稳定，其中三浅裂野牵牛和三裂叶薯的亲缘关系较近。对ItrKNOX基因启动子区进行分析，发现多个与生长发育、植物激素、光和逆境胁迫相关的顺式作用元件。转录组分析显示，在Y22块根发育过程中，不同ItrKNOX基因表达模式不同。其中，Class M基因ItrKNOX12几乎不表达，而ItrKNOX02、ItrKNOX03、ItrKNOX09和ItrKNOX10在整个根部发育过程中持续高表达。从不定根时期到块根发育期，ItrKNOX01～ItrKNOX03、ItrKNOX05、ItrKNOX09和ItrKNOX11的表达量明显上调，ItrKNOX08的表达量明显下调。值得注意的是，ItrKNOX06在块根膨大到直径大于2 mm后表达量才明显上调，ItrKNOX07在不定根和成熟块根中表达水平明显低于发育中的块根。本研究为探索甘薯及其近缘野生种三浅裂野牵牛KNOX家族基因的功能和调控机制提供了参考。
关键词： 三浅裂野牵牛 KNOX基因家族 进化 基因表达 块根发育
全文链接
请求原文
藏猪、川乡黑猪妊娠期子宫体繁殖功能相关lncRNA鉴定和功能预测
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在藏猪、川乡黑猪繁殖过程中的调控机理，筛选相关lncRNA。【方法】采集具有不同产仔数的藏猪和川乡黑猪妊娠期的子宫体组织作为样本，建立特异性猪子宫mRNA文库，利用Illumina PE150 HiSeq平台进行测序，测序结果经过质控、比对与拼接后，筛选出差异表达lncRNA并预测其靶基因，对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。随机选取7个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR验证。【结果】在藏猪和川乡黑猪子宫体中存在32个共同差异表达lncRNAs,共得到168个靶基因。GO功能分析显示，不同繁殖能力的样本共同差异表达lncRNA的靶基因主要富集于分子代谢、转录活性调节、细胞增殖调节、子宫体修饰、微量元素代谢等条目中；KEGG通路分析显示，共同差异表达lncRNA的靶基因主要富集在糖酵解过程、卵母细胞分裂、细胞寿命调节、Ras信号通路、RIG-Ⅰ信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路、调控稳态过程等。实时荧光定量PCR结果显示，7个差异表达lncRNAs的表达与转录组测序结果一致。【结论】本研究在藏猪和川乡黑猪子宫体中发现了32个可能通过调控潜在靶基因参与母猪妊娠过程的lncRNAs,为进一步研究lncRNA在母猪繁殖过程中的调节机制提供了参考依据。这些lncRNA可作为新的繁殖性状生物标记用于猪的育种过程中。
关键词： 藏猪 川乡黑猪 子宫体 妊娠期 长链非编码RNA(lncRNA)
全文链接
请求原文
密码子优化的RHDV2双VP60基因重组杆状病毒构建及表达蛋白免疫原性分析
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】试验旨在优化兔出血症病毒2型（Rabbit hemorrhagic disease virus 2,RHDV2）病毒样颗粒（virus-like particle, VLP）疫苗的制备策略，探究RHDV2 VLP疫苗对家兔的免疫原性，为低成本、高产量RHDV2新型疫苗研发提供新思路。【方法】根据昆虫细胞的密码子偏好性优化合成RHDV2 VP60全基因，将双VP60基因插入真核载体pFastBacTM Dual,转化携带Bacmid质粒的大肠杆菌DH10Bac感受态细胞，构建含双VP60基因的重组杆粒Bacmid-VP60-VP60,转染Sf9昆虫细胞，通过Western blotting、间接免疫荧光试验（IFA）及透射电镜对重组杆状病毒Bacmid-VP60-VP60进行表达验证；将优化策略制备的重组蛋白抗原与氢氧化铝佐剂按照9∶1比例制备VLP灭活疫苗，通过安全性检验、最小免疫剂量、免疫持续期等评估优化策略制备的RHDV2 VLP疫苗的保护效果。【结果】试验成功构建重组杆粒Bacmid-VP60-VP60。Western blotting鉴定结果显示，重组杆状病毒转染Sf9细胞表达出大小约60 ku的RHDV2 VP60蛋白。IFA鉴定结果显示，感染重组杆状病毒的Sf9细胞产生了大量的黄绿色荧光，表明重组杆状病毒在Sf9细胞中大量表达VP60蛋白。透射电镜观察结果显示，VP60蛋白折叠成VLP,大小为40 nm左右，呈现球形结构，表面光滑。优化策略制备的RHDV2 VLP疫苗对家兔具有良好的安全性和免疫原性，最小免疫剂量为0.5 mL/只，免疫持续期可达210 d以上。【结论】试验构建了含有密码子优化的双VP60基因的重组杆状病毒，并在昆虫细胞中成功表达RHDV2 VP60蛋白，该蛋白制备的VLP疫苗对家兔具有良好的免疫原性。
关键词： 兔出血症病毒2型（RHDV2） 病毒样颗粒（VLP） 密码子偏好性 重组杆状病毒 免疫原性
全文链接
请求原文
转录组和蛋白组筛选就巢鸡卵巢发育候选基因及其调控网络构建
《畜牧兽医学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了研究蛋鸡就巢性的潜在调控机制，本研究选用300日龄体况良好、体重一致的城口山地鸡12只，其中3只个体处于正常产蛋期，其余9只个体分别处于就巢期10、20和30天。采集各组蛋鸡卵巢组织进行组织解剖学形态观察，然后利用转录组(RNA-seq)和蛋白组(iTRAQ)测序技术分别对产蛋组正常卵巢(normal ovary, NO)和就巢组萎缩卵巢(atrophic ovary, AO)进行测序分析。筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs)并进行功能富集分析，鉴定与家禽就巢性相关的候选基因。结果表明：就巢导致蛋鸡卵巢发生萎缩，卵泡大量闭锁。在卵巢组织中鉴定出930个DEGs,其中430个基因上调，500个基因下调；同时鉴定出546个DEPs,其中178个蛋白上调，368个蛋白下调。通过功能注释和富集分析发现，这些DEGs和DEPs显著富集在细胞外基质(extracellular matrix, ECM)受体相互作用、黏着和PI3K-Akt等信号通路。最后通过转录组和蛋白组联合分析，筛选出7个蛋鸡就巢性的候选基因：COMP、FN1、ITGA8、THBS1、COL4A2、COL4A1和COL1A1。综上所述，本研究通过分析转录组测序和蛋白组测序结果筛选了蛋鸡就巢性关键候选基因，并构建了家禽就巢状态下卵巢发育的调控网络。本研究为深入解析就巢期卵巢萎缩的分子调控机制提供了理论参考，丰富了调控家禽就巢性状的候选基因，为蛋鸡的遗传改良和分子育种研究提供理论依据。
全文链接
请求原文
蜀兴1号肉兔与伊拉兔肉质差异的分子机制
《江苏农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为明确蜀兴1号肉兔(SX)与伊拉兔(IRA)肉质差异及差异形成分子机制，本研究通过采集2个品种兔背最长肌样品，进行肉质性状测定及转录组测序和代谢组分析，筛选差异表达基因和差异代谢物并进行功能富集分析。结果表明，蜀兴1号肉兔的肌纤维直径和滴水损失率显著低于伊拉兔，而肌纤维密度、熟肉率和肌内脂肪含量显著高于伊拉兔。蜀兴1号肉兔与伊拉兔转录组中共筛选出81个差异表达基因，其中蜀兴1号肉兔中51个基因上调，30个基因下调。SMTNL1、PM20D2和EDN1等可能是导致两种兔肉品质差异的基因。差异表达基因显著富集于cAMP信号传导途径。挥发性代谢组学比较共得到12种差异显著代谢物，均在蜀兴1号肉兔中上调，其中，2-十一烯醛、4-乙基辛酸、(E)-2-壬烯醛、鸟氨酸和十一醛等代谢物与肉质风味正相关，挥发性代谢物显著富集于2-氧代羧酸代谢、ABC转运蛋白和精氨酸生物合成等KEGG代谢通路。广泛靶向代谢组学比较分析共得到15种差异显著代谢物，其中蜀兴1号肉兔中7种代谢物上调，8种下调，2个品种兔肉中γ-L-谷氨酸-L-谷氨酰胺、L-谷氨酸-L-谷氨酰胺和溶血磷脂酰胆碱(LPC)等肉质风味相关物质的含量差异较大，广泛靶向代谢物显著富集于咖啡因代谢和昼夜节律夹带等KEGG代谢通路。本研究得到的差异表达基因和差异代谢物可为进一步的优质兔养殖和优质兔选育提供参考依据。
全文链接
请求原文
川乡黑猪重要经济性状SNP位点分型及分子系谱构建
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在分析川乡黑猪重要经济性状因果突变和紧密关联SNP位点基因型分布情况，构建川乡黑猪分子系谱。利用全基因组SNP芯片技术对样本进行扫描分析，通过主成分分析、计算遗传距离、ROH分析等对公猪亲缘关系和血统进行划分，解析川乡黑猪的群体结构和遗传多样性。结果显示：川乡黑猪群体中采食量、氟烷（Hal）基因和酸肉基因2（RN2）已完全剔除非优势基因q；体长基因无QQ基因型和Qq杂合基因型，qq非优势基因型频率达100%；抗仔猪腹泻和多胸椎数基因Qq、qq基因型总比例分别为18.07%和26.10%，其中qq基因型比例为3.21%和2.01%；公猪精液品质和酸肉基因1（RN1）的Qq、qq基因型总比例较高，分别为45.78%和34.54%，并且Qq基因型比例均超过30%；多肋骨数和耗料增重比基因中优势基因型QQ比例只有18.47%和47.79%，低于50%。公猪群体主成分分析和聚类分析结果显示，该群体可被划分为16个不同的家系。以上结果表明，川乡黑猪的选育可着重于提高抗仔猪腹泻、多胸椎数、多肋骨数、公猪精液品质、酸肉和耗料增重比等基因的优势基因型频率，并结合亲缘关系和家系划分结果，通过分子标记辅助选择技术进一步优化种群结构。
全文链接
请求原文
大豆活性肽对黄羽肉鸡生长性能、屠宰性能、肉品质、免疫功能及抗氧化能力的影响
《动物营养学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文旨在研究大豆活性肽对黄羽肉鸡生长性能、屠宰性能、肉品质、免疫功能及抗氧化能力的影响。选用1日龄健康大恒黄羽肉鸡公鸡800只，随机分成5组，每组10个重复，每个重复16只鸡。对照组饲喂基础饲粮，抗生素组饲喂基础饲粮+0.2 g/kg恩拉霉素，试验组分别饲喂以0.2%、0.4%、0.6%的大豆活性肽替代基础饲粮中豆粕的试验饲粮。试验期70 d。结果表明：1)抗生素组和0.2%大豆活性肽组的末重、平均日增重显著高于对照组（P＜0.05），料重比显著低于对照组（P＜0.05）。各组之间平均日采食量无显著差异（P＞0.05）。2)各组之间屠宰率、全净膛率、半净膛率、胸肌率、腿肌率和腹脂率无显著差异（P＞0.05）。3)各组之间血常规指标无显著差异（P＞0.05）。4)0.2%大豆活性肽组的胸肌45 min肉色显著高于对照组、抗生素组和0.4%大豆活性肽组（P＜0.05）。各组之间胸肌45 min和24 h pH、24 h肉色、滴水损失、蒸煮损失以及肌纤维直径、横截面积和密度无显著差异（P＞0.05）。5)抗生素组和0.2%、0.4%、0.6%大豆活性肽组的血清溶菌酶含量显著高于对照组（P＜0.05）。0.2%大豆活性肽组的血清白细胞介素-1β（IL-1β）和干扰素-γ（IFN-γ）含量显著低于对照组（P＜0.05），血清白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、免疫球蛋白G（IgG）、免疫球蛋白A（IgA）和免疫球蛋白M（IgM）含量显著高于对照组（P＜0.05）。6)各组之间脾脏指数和法氏囊指数无显著差异（P＞0.05）。7)抗生素组和0.2%大豆活性肽组的血清总抗氧化能力（T-AOC）显著高于对照组（P＜0.05）。各组之间血清谷胱甘肽过氧化物酶（GSH-Px）和总超氧化物歧化酶（T-SOD）活性无显著差异（P＞0.05）。由此可见，饲粮中添加0.2%大豆活性肽可提高黄羽肉鸡生长性能和免疫功能，改善肉品质和增强机体抗氧化能力，且具有替代抗生素的作用。
关键词： 大豆活性肽 黄羽肉鸡 生长性能 屠宰性能 肉品质 免疫功能 抗氧化性能
全文链接
请求原文
酵母菌对发酵萝卜品质的影响
《食品与发酵工业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究酵母菌对发酵萝卜品质的影响，以常规母水和无酵母母水为研究对象，对其发酵过程中微生物数量、pH值、总酸、还原糖、有机酸和挥发性风味物质的动态变化规律及差异进行分析。结果表明，常规母水体系较无酵母母水体系还原糖消耗速度加快，总酸和有机酸含量降低，有机酸组成改变。常规母水体系发酵终点乳酸含量较无酵母母水体系下降了5.67 mg/mL,乙酸含量较无酵母母水体系增加了0.33 mg/mL。在挥发性风味物质上，发酵结束时常规母水体系中醇类、酯类和酸类化合物相对含量较高，胺类酚类等成分相对含量较低，通过分析得到19种差异化合物(VIP值>1,P<0.05),包括6种醇类，5种烃类，4种酯类，2种胺类，1种酚类和1种酸类化合物，其中贡献花果香风味的差异化合物在常规母水组含量较高。研究结果揭示了母水中酵母菌对发酵萝卜品质形成具有重要作用，为提高发酵萝卜产品品质稳定性提供了理论基础。
全文链接
请求原文
碳中和目标下四川省林业生态工程对植被碳汇的影响研究
《环境监测管理与技术 》 2024 CSCD
摘要：基于遥感、气象和统计年鉴数据，对四川省2002—2018年间县域的林业生态工程建设和植被碳汇的时空变化进行分析，采用多重高维固定效应模型探究林业生态工程对植被碳汇的影响。结果表明：四川省植被碳汇在时间上呈波动上升趋势，由1 737.56 g/（m2·a）增至1 836.89 g/（m2·a）,年均增速达0.34%;在空间分布上，植被碳汇高值集中在川西南山地地区，低值集中在川西北高原地区；在趋势变化上，全省县域的植被碳汇整体呈增长趋势。四川盆地和川西南地区是林业生态工程实施重点地区，累计造林面积占比分别为61.44%和26.02%。四川省林业生态工程能显著促进植被碳汇的增加，并存在时滞效应。此外，人均GDP、年降水量、年均气温对植被碳汇具有显著正向影响，而人口密度则具有显著负向影响。
关键词： 碳中和目标 林业生态工程 植被碳汇 多重高维固定效应模型 四川省
全文链接
请求原文
外源铁对花叶冷水花根表铁膜及磷吸收的影响
《西南大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探讨不同磷质量浓度处理下，不同质量浓度Fe2+对湿地植物根表铁膜形成及磷吸收的影响，揭示湿地植物根表铁膜在净化磷污染水体中的作用，以花叶冷水花为试材，构建了基质外源铁(Fe2+)质量浓度分别为0,500,1 000 mg/kg和污水P质量浓度分别为0,5,10,50,100 mg/L的模拟垂直流人工湿地系统，在系统持续运行6周后，分析各处理下花叶冷水花的株高、干质量、根表铁膜含量，以及根系、地上部分和根表铁膜对磷的吸收量.结果表明：湿地植物根表铁膜的形成受基质中Fe2+质量浓度和污水P质量浓度的共同影响，当P质量浓度不高于10 mg/L时，铁膜量随Fe2+质量浓度增加呈先降低后升高趋势，当P质量浓度不低于50 mg/L时，铁膜量随Fe2+质量浓度的增加而增加；铁膜对磷的吸附量与基质中外源Fe2+加入量和污水中P质量浓度有关，当基质中无外源Fe2+时，P质量浓度增大会抑制花叶冷水花根表铁膜的形成，同时降低铁膜对磷的吸附能力；根表铁膜与花叶冷水花株高增长量呈显著正相关(r=0.713**,p<0.01),与花叶冷水花地上部分磷吸收量和铁膜磷吸附量也具有显著正相关性，相关系数分别为0.386**, 0.476**.研究表明：在应用湿地植物花叶冷水花净化高磷污染水体时，适当加入外源Fe2+有利于根表铁膜的形成和花叶冷水花的生长，并促进花叶冷水花地上部分对磷的吸收，达到转移污水中磷的作用，对磷污染水体的植物修复有着重要的意义.
全文链接
请求原文
