科研产出
水稻对稻曲病不同抗性品种遗传多样性SSR分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:本文利用35对SSR引物对23份水稻品种(组合)进行遗传多样性分析。结果表明,35对引物在23个水稻品种上共获得342条扩增条带,其中多态性条带288条,多态性条带所占比例为84.21%。23个参试水稻品种对稻曲病的抗性表现出明显差异,病穗率范围为8.20%~75.93%,最高和最低病穗率之间相差67.73个百分点,病情指数范围为2.19~52.67,最高和最低病情指数相差50.48。成对品种的GS变化为0.614~0.954,平均值为0.740单个品种的平均GS值变化为0.686~0.778之间。共有11份供试品种的平均GS值低于GS总平均值(0.740),其它12份(占供试品种总数的52.2%)供试品种平均GS值高于GS总平均值(0.740)。聚类分析的结果表明,在遗传相似系数为0.75时,23个供试品种可分为5类。不同生育期的品种可以聚在同一类群中,聚在同一类的品种生育期最多可相差11 d,而同一生育期的品种可以分属不同的类,包括中抗到高感的不同抗性类型。
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SSR分子标记在糯高粱种质资源遗传多样性分析中的应用
《江苏农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:为了阐明糯高粱种质资源之间的亲缘关系,用25对SSR引物评价了29份糯高粱种质资源。结果显示,25对引物共检测出59个等位基因,每对引物检测到2.28个等位基因,平均有效等位基因为1.81个,引物位点的多态信息量变幅为0.17~0.62,平均为0.34。29份糯高粱种质资源的遗传相似系数范围为0.20~0.95,平均为0.60,UPGMA方法将29份糯高粱品种在遗传相似系数0.48处聚为2大类,其中不同地理来源的品种被聚在同一亚类,农艺性状近似的品种被聚在同一亚类。表明糯高粱品种的亲缘关系与地理来源关系不大,其种质资源具有较为丰富的遗传多样性。
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川楝内生放线菌的分离及多样性研究
《微生物学通报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:【目的】分离四川省各个地区川楝内生放线菌并研究其物种多样性。【方法】应用7种选择性分离培养基分离样品根、茎、叶、树皮和果实中的内生放线菌,采用16SrRNA基因RFLP分析代表菌株多样性。【结果】研究共获得403株内生放线菌。不同地点、不同植株部位、不同培养基分离得到的内生放线菌数目均有差异。广元采集的样品分离得到的数目最多,为86株;最少的是绵阳,仅有12株。从植物表皮中分离到148株放线菌,占获得菌株总数的36.7%;而从果中分离到31株,仅占获得菌株总数的7.6%;虽然从根部分离到的数量也很少,但是其出菌率却是最高的。5号和3号培养基的分离效果最为理想。16S rRNA基因RFLP分析结果显示所有供试菌株在68%的相似性上聚在一起,在84%的相似水平上分成了10个遗传类型。代表菌株的16SrRNA基因序列测定及系统发育分析结果表明:分离得到的放线菌包括4个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。其中,链霉菌是优势类群,占代表菌株数目的比例高达91%,而稀有放线菌的比例只有9%。【结论】研究发现的川楝内生放线菌主要属于链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。
关键词: 16S rRNA基因 川楝 内生放线菌 分离 物种多样性
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生姜内生溶磷细菌遗传多样性及溶解Al-P和Fe-P能力研究
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:开展生姜内生溶磷细菌的遗传多样性及溶磷能力研究,有助于获得新的溶磷微生物,促进土壤磷素转化。本文从采自重庆、四川雅安和眉山及贵阳等地生姜样品中分离得到32株内生溶磷细菌,采用BOX-PCR对其遗传多样性进行分析,进而研究供试菌株溶解Al-P和Fe-P的能力。BOX-PCR分析表明,供试菌株具有丰富的遗传带谱,聚类分析中,供试菌株在55%聚为一群;在70%的相似水平处,供试菌株分为6个BOX遗传群。在添加2 g/L Al-P和1 g/L Fe-P的液体培养基中,供试菌株溶解Fe-P能力高于溶解Al-P,有效磷含量分别为1.14~9.95和2.98~55.42μg/m L。其中,QW40溶磷效果最好,发酵液有效磷含量分别为9.95和55.42μg/m L。供试菌株对Al-P和Fe-P溶磷量与发酵液的p H值呈显著负相关关系。
关键词: 生姜 BOX-PCR 内生细菌 溶磷特性 遗传多样性
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柑桔园(杂柑)昆虫群落演替的初步研究
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:本文采用2011-2013年在蒲江县柑桔园(杂柑)调查数据,对生物多样性(PIE),均匀度(V'),优势度(C),物种数(S)和总体个数(N)5个昆虫群落生态指标进行定量分析。结果表明:柑桔园(杂柑)昆虫群落结构随杂柑树龄(苗期→2年生→5年生→10年生)的增加而不断演替;防治措施是影响柑桔园(杂柑)昆虫群落演替的主要因子,绿色防控技术是保持桔园昆虫群落结构多样性和维护昆虫群落结构稳定的关键因子;4-6月柑桔园(杂柑)昆虫多样性、均匀度、丰富度和样本总数均相对最高,是防治的关键时期。
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烟草土壤真菌群落结构和多样性及环境因子对其影响
《四川师范大学学报(自然科学版) 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:以盐边县代表性烟草种植区域的成熟期烟草根际及非根际土壤为研究对象,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析了真菌(18S基因)群落结构和多样性,结合之前研究所得土壤理化性质,应用多元回归树分析研究了土壤环境因子对真菌多样性的影响.免培养真菌群落结构和多样性的分析结果表明,系统的根际效应在成熟期烟草中没有体现.条带克隆测序结果表明,成熟期烟草根际和非根际免培养真菌优势种群差异显著,其中,以EF6-1为代表的不可培养真菌为非根际土壤中的特异真菌;以EF7-1为代表的不可培养真菌为根际土壤中的特异真菌.同时烟草成熟期根际土壤中优势免培养真菌为角担菌科(Ceratobasidiaceae)、伞菌纲(Agaricomycetes)、散囊菌纲(Eurotiomycetes)、马拉色菌属(Malassezia)、球囊霉属(Glomus)及部分不可培养真菌;而角担菌科(Ceratobasidiaceae)、伞菌纲(Agaricomycetes)及部分不可培养真菌为烟草成熟期非根际优势真菌.多元回归树分析结果表明,土壤环境因子中速效钾含量对真菌群落结构及多样性影响最大.
关键词: 成熟期 群落结构 多样性 多元回归树 变性梯度凝胶电泳
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山茶种质资源主要表型的遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:为加强山茶种质资源的研究利用,对保存的51份种质资源的11个质量性状与11个数量性状进行聚类分析与主成分分析。结果表明:供试材料具有丰富的遗传多样性。多样性指数最高的是叶长,其次是雄蕊长度、花瓣长和叶柄长度;性状变异系数最大的是花柄长度,其次是果径和叶柄长度,最小的为花瓣数量。基于各种资源形态性状的遗传差异,把51份山茶聚类并划分为3大类群。第Ⅰ类为花色艳丽、大花的亲本材料,第Ⅱ类为香花或小花型山茶的亲本材料,第Ⅲ类为黄色花或花、叶某一部分具有奇特观赏性状的亲本材料。22个农艺性状的主成分分析结果表明,前7个主成分累计贡献率达79.891%,第1主成分反映花的观赏性,第2主成分反映叶的观赏性,第3成分反映叶和果实。研究结果表明,供试山茶种质资源的变异较大,遗传较丰富。
关键词: 山茶 种质资源 表型 遗传多样性 聚类分析 主成分分析
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绿色食品鱼的质量安全:中外标准比较研究
《世界农业 》 2015 北大核心
摘要:为了了解中国鱼类产品质量安全标准和国外相关产品标准(技术法规)之间的差距,进一步完善中国标准的制修订,加强中国鱼类产品的质量管理,促进中国鱼类产品的国际贸易,本文对NY/T 842—2012《绿色食品鱼》中冻鱼的相关规定与CODEX STAN 190—1995《速冻鱼片》(2014年修订)以及欧盟、美国、日本、韩国等鱼类产品相关标准(技术法规)的部分参数进行了比较研究。结果表明,中国《绿色食品鱼》标准具有一定的先进性,但是组胺限量远远高于欧盟和美国的规定;无机砷、甲基汞、氟等参数的规定严于国际社会的规定;药物残留限量规定基本与欧盟一致;部分指标严于国际食品法典委员会(CAC)、美国、日本和韩国,但在食品添加剂和感官要求方面的规定可操作性不强。因此,有必要进一步细化规定中国《绿色食品鱼》标准中食品添加剂和感官要求,增强标准的可操作性;细化规定不同种类鱼产品的有害物和污染物的限量值。
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42份糯高粱种质资源的SSR标记遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:种质资源遗传多样性是育种的基础。为研究糯高粱品种之间的遗传关系,本研究利用36对SSR引物分析了42份糯高粱种质资源的遗传多样性。结果表明,36个引物共检测到88个等位基因,平均每对引物检测到2.44个;36个引物的平均多态信息量为0.363,变幅0.132~0.685,引物的Shannon指数分布范围为0.271 2~1.354 0,平均为0.692 3。42份糯高粱种质资源的平均遗传相似系数为0.579,变幅0.273~0.977;UPGMA聚类分析将42份糯高粱品种划分为四大类,分类结果基本反映了品种间的亲缘关系,同时说明供试的糯高粱种质资源具有较为丰富的遗传多样性。
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我国玉米灰斑病菌遗传多样性的ISSR分析
《植物保护学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:为明确我国发生的玉米灰斑病菌地理差异及遗传结构,利用简单序列重复区间(ISSR)对玉米灰斑病菌遗传多样性进行了分析,并利用尾孢菌特异引物对分离自四川、云南、湖北、贵州等西南地区的16个玉米灰斑病菌菌株进行了分子鉴定。结果显示,通过ISSR标记筛选出10个扩增多态性好且稳定的通用引物,共扩增出81条DNA条带,均为多态性条带,扩增片段大小在200~2 000 bp之间,菌株遗传相似系数为0.19~1.00。在遗传相似系数为0.19时,供试菌株被聚为2大类群,来自西南地区和东北地区的菌株各自聚为一组,在DNA水平上表现出明显差异,认为是2类不同的致病类群。分子鉴定结果显示引起西南各地区玉米灰斑病的主要致病菌均为玉米尾孢菌Cercospora zeina。表明我国玉米灰斑病菌存在丰富的遗传多样性,ISSR标记可揭示出玉米灰斑病菌株间的亲缘关系及遗传差异性,可用于其遗传多样性研究。
关键词: 玉米灰斑病菌 简单序列重复区间 遗传多样性 聚类分析
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