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川楝内生放线菌的分离及多样性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 李小林 1 ; 李强 2 ; 张矛宇 2 ; 张波 1 ; 甘炳成 3 ; 张小平 1 ;

作者机构： 1.四川农业大学资源环境学院

2.四川大学生命科学学院

3.四川省农业科学院土壤肥料研究所

关键词： 16S rRNA基因;川楝;内生放线菌;分离;物种多样性

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2015 年 42 卷 02 期

页码： 264-271

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分离四川省各个地区川楝内生放线菌并研究其物种多样性。【方法】应用7种选择性分离培养基分离样品根、茎、叶、树皮和果实中的内生放线菌,采用16SrRNA基因RFLP分析代表菌株多样性。【结果】研究共获得403株内生放线菌。不同地点、不同植株部位、不同培养基分离得到的内生放线菌数目均有差异。广元采集的样品分离得到的数目最多,为86株;最少的是绵阳,仅有12株。从植物表皮中分离到148株放线菌,占获得菌株总数的36.7%;而从果中分离到31株,仅占获得菌株总数的7.6%;虽然从根部分离到的数量也很少,但是其出菌率却是最高的。5号和3号培养基的分离效果最为理想。16S rRNA基因RFLP分析结果显示所有供试菌株在68%的相似性上聚在一起,在84%的相似水平上分成了10个遗传类型。代表菌株的16SrRNA基因序列测定及系统发育分析结果表明:分离得到的放线菌包括4个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。其中,链霉菌是优势类群,占代表菌株数目的比例高达91%,而稀有放线菌的比例只有9%。【结论】研究发现的川楝内生放线菌主要属于链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。

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