科研产出
高原作物青稞根及根际内生细菌群落结构的高通量分析
《作物杂志 》 2016 北大核心
摘要：利用高通量测序技术分析了西藏青稞主栽品种藏青2000根及根际内生细菌的16S V4变异区序列,同时应用Uparse RON、KA等软件整理和统计样品序列数和操作分类单元(OTU)数,分析物种丰度及Alpaha多样性等指标。获得的用于分析青稞根部内生细菌的有效序列和OTUs为55 192/3 613,用于分析青稞根际土壤内生细菌的有效序列和OTUs为62 181/4 399;根部及根际土壤Chao1指数分别为3 443.4290和4 632.5820,shannon多样性指数分别为8.542和9.967。在门水平对代表性OTU进行注释发现,青稞根及根际土壤内生细菌主要是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)。在属水平上主要是假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)、土地杆菌属(Pedobacter)、黄杆菌属(Flavobacterium)、红游动菌属(Rhodoplanes)。结果显示,青稞根及根际内生细菌具有丰富的多样性,且二者的优势菌属一致。
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偏肿栓菌内生木霉菌株18-21抑菌效果研究
《微生物学杂志 》 2016 CSCD
摘要：为了筛选获得对植物根腐病及食用菌腐败等有效的生防菌,采用抑菌圈法和对峙培养法筛选生防菌株,通过形态学和16S r DNA分子鉴定确定生防菌分类地位。从1株野生偏肿栓菌Trametes gibbosa子实体中分离获得1株具有抑菌效果的生防菌,代号为18-21。筛选获得的这株生防菌对植物根腐病及食用菌腐败病原菌腐皮镰刀菌(Fusarium solani)、三线镰刀菌(Fusarium tricinctum)的抑制率分别为56.7%、65.8%,并对铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)、侧芽胞杆菌(Bacillus latersprorus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)等病原细菌均具有显著的抑菌效果,通过形态学和分子生物学分类鉴定,确定为渐绿木霉(Trichoderma viridescens)。研究结果拓宽了生防菌的分离材料来源,丰富了生防资源,具有很大的应用潜力。
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四川都江堰川芎根茎真菌的分离与鉴定
《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：探究川芎内生真菌、附生真菌的种类,为川芎病害防治提供理论基础。本试验采用组织分离的方法,对采得的30份都江堰川芎根茎样品进行分离,鉴定其内生真菌和附生真菌。结果表明:分离得到10种真菌,其中内生真菌4种,附生真菌9种。内生真菌以镰孢属和木霉属为主,附生真菌中木霉、镰刀菌和毛霉为主,内生、附生真菌以木霉和镰刀菌为主要种群,附生真菌数量及种群组成均比内生真菌丰富,并在附生真菌中发现丛梗孢属,在以往研究川芎附生真菌的报道中均未见。
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铬污染区糙野青茅内生耐铬细菌筛选及其促生能力
《应用与环境生物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以铬污染区糙野青茅[Deyeuxia scabrescens(Griseb.)]为研究对象,从中分离耐重金属铬的内生菌,获得对重金属铬有强耐受性和具有促生功能的细菌,为微生物与植物联合修复重金属污染提供菌种资源.采用LB培养基,以涂布和撒接两种分离方法获得内生细菌,通过内生细菌在不同铬浓度培养基的生长状况来判断其对于重金属铬的耐受性,初筛耐受性强的菌株培养于含铬LB液体培养基培养后测定其OD值,以验证其对铬的耐受性.将耐铬能力突出的菌株接种于含铬LB液体培养基培养后测定培养基中的残留铬含量,初探其去铬能力,并分析耐铬菌株多样性和产吲哚乙酸IAA、产铁载体、溶磷、降解纤维素等促生能力.结果显示:从糙野青茅中共分离得到33株内生细菌,其中27株表现出较强的铬耐受性,5株细菌的铬耐受浓度高达1 000μg/m L.2株菌在铬浓度为300μg/m L的处理下培养48 h后去铬率分别为79.55%和75.27%.经16S rDNA序列测定,内生细菌属于Bacillus、Staphylococcus、Terribacillus、Ochrobacterium、Ignatzschineria、Alcaligenes 6个属.24株菌(88.89%)具有产IAA能力,18株菌(66.67%)具有产铁载体能力,10株菌(37.04%)具有溶磷能力,13株菌(48.15%)具有降解纤维素能力.本研究表明,铬污染区植物内生细菌在铬污染土壤的生物修复中具有很大潜力.
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生姜内生溶磷细菌遗传多样性及溶解Al-P和Fe-P能力研究
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：开展生姜内生溶磷细菌的遗传多样性及溶磷能力研究,有助于获得新的溶磷微生物,促进土壤磷素转化。本文从采自重庆、四川雅安和眉山及贵阳等地生姜样品中分离得到32株内生溶磷细菌,采用BOX-PCR对其遗传多样性进行分析,进而研究供试菌株溶解Al-P和Fe-P的能力。BOX-PCR分析表明,供试菌株具有丰富的遗传带谱,聚类分析中,供试菌株在55%聚为一群;在70%的相似水平处,供试菌株分为6个BOX遗传群。在添加2 g/L Al-P和1 g/L Fe-P的液体培养基中,供试菌株溶解Fe-P能力高于溶解Al-P,有效磷含量分别为1.14~9.95和2.98~55.42μg/m L。其中,QW40溶磷效果最好,发酵液有效磷含量分别为9.95和55.42μg/m L。供试菌株对Al-P和Fe-P溶磷量与发酵液的p H值呈显著负相关关系。
关键词： 生姜 BOX-PCR 内生细菌 溶磷特性 遗传多样性
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野生翘鳞肉齿菌子实体内生菌多样性
《应用与环境生物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了解翘鳞肉齿菌[Sarcodon imbricatus(L.ex Fr.)Karst.]子实体内生菌的多样性,以西藏、吉林的新鲜野生翘鳞肉齿菌子实体为材料,采用可培养方法分离并鉴定其中的内生细菌与真菌.共从中分离出52株细菌、26株真菌.鉴定结果显示,所有内生细菌分别隶属于变形菌门(Proteobacteria)及厚壁菌门(Firmicutes),变形菌门占96.2%,处绝对优势.其中伯克氏菌属(Burkholderia)最多,占40.4%,假单胞菌属(Pseudomonas)次之,占23.1%.26株真菌共分为14个属,Phaeomoniella最多,占26.9%,隐球菌属(Cryptococcus)其次,占11.5%.从菌柄及菌盖中分离的细菌、真菌种类及数量均有差异.本研究分离的这些菌株具有很大的潜在利用价值,可为筛选具有特殊功效的菌株提供新的材料来源,同时也可为探索外生菌根菌与共生植物之间的物质交换与菌根合成打下基础.图2表1参30
关键词： 翘鳞肉齿菌 虎掌菌 子实体 内生菌 多样性 外生菌根
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四川松茸内生细菌群落结构与多样性
《应用生态学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：为了解松茸的内生细菌群落结构与多样性,以采自四川7个松茸主产区的14个松茸样品为材料,通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析其内生细菌的群落结构与多样性差异.结果表明:各个产区松茸样品的内生细菌群落结构与多样性存在明显差异.但采自相近地点、相似环境的松茸样品内生细菌群落结构相似性较高;样品的丰度范围为15~25,多样性指数依次为盐源>冕宁>会东>木里>雅江>盐边>小金;条带回收测序构建的系统发育树显示,松茸内生细菌种群丰富,各个产区松茸优势种群存在一定的差异,但假单胞菌属、爱文菌属、芽孢杆菌属在所有样品中均有分布,而且都占据一定的优势地位.产碱杆菌属与鞘氨醇杆菌属在大部分样品中为优势种群;而杜擀氏菌属、赖氨酸芽孢杆菌属在特定样品中为优势种群.表明松茸内生细菌具有丰富的多样性,研究结果可为筛选促进松茸生长的内生菌提供依据.
关键词： 松茸 内生细菌 群落结构 PCR-DGGE 促生细菌
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川楝内生真菌的遗传及PKS、NRPS基因的多样性
《中草药 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：目的探明川楝Melia toosendan内生真菌遗传、聚酮合成酶基因(PKS)、非核糖体多肽合成酶基因(NRPS)多样性,为寻找合成生物活性物质的潜在菌株奠定基础。方法对分离自药用植物川楝的39株内生真菌进行形态学鉴定,并通过PCR技术扩增其ITS序列、PKS基因和NRPS基因,测序后进行BLAST比较和系统发育分析。结果 39株菌株的表型鉴定和系统发育显示,川楝内生真菌分属于青霉属、曲霉属、木霉属等25个属,其中曲霉属(17.9%)、青霉属(15.4%)为川楝内生真菌的优势真菌类群;共得到12个PKS基因和6个NRPS基因,其中NRPS基因都为青霉属。结论川楝内生真菌具有非常丰富的遗传多样性和较强合成生物活性物质的潜在能力,对青霉属和曲霉属内生真菌可以进行深入研究。
关键词： 川楝 内生真菌 系统发育 聚酮合成酶 非核糖体多肽合成酶
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