科研产出
三角紫叶酢浆草ISSR反应体系的建立与优化
《草业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：采用正交设计直观分析法,对影响三角紫叶酢浆草ISSR-PCR反应较大的5个因素(Mg2+、Taq酶、引物、模板DNA、dNTP)在5个水平上进行优化实验;从100个随机引物中筛选出适宜的引物,并筛选出其最佳退火温度;最后对反应程序进行优化。由此首次建立了适合三角紫叶酢浆草的ISSR-PCR反应体系:25μL反应液中含10×buffer 2.5μL,Mg2+1.25mmol/L,Taq酶0.9U,引物0.3μmol/L,模板DNA 60～100ng,dNTP 0.25mmol/L。反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性50s,退火时间60s(根据不同引物选择对应最佳退火温度),72℃延伸1.5min,循环40次;72℃延伸7min,4℃保存。这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术研究酢浆草属植物提供理论依据和技术参考。
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银耳种质资源遗传多样性及酶学特性分析
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：从不同地区采集引进了银耳菌株共14株,利用ISSR分子标记技术对这14株银耳菌株进行了遗传多样性分析,从75条引物中筛选出14条引物,共获得105条带,其中多态性条带70条,占条带总数的67%。聚类分析结果表明:在相似水平为70%时,14个菌株可以划分为4个类群,且类群的划分与地理来源之间并无明显相关性,菌株间遗传差异较大,遗传多样性较高,表明供试菌株在DNA分子水平上存在比较显著的遗传变异。利用紫外分光光度法测定了纤维素酶活性,并采用SPSS软件进行了酶活力差异显著性分析。结果显示:供试的14株银耳菌株纤维素酶活大小在1.300～0.922间,纤维素酶活性很低,酶活力差异显著,且与地理来源无明显相关性。
关键词： 银耳 ISSR 遗传多样性 聚类分析 纤维素酶 SPSS 差异显著性
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中国野生蘑菇属90个菌株遗传多样性的DNA指纹分析
《食用菌学报 》 2009 北大核心
摘要：对90个中国野生蘑菇属菌株(其中44株经同工酶初步鉴定为双孢蘑菇菌株)的总DNA进行SRAP和ISSR分析,获得了18条SRAP和12条ISSR标记条带并进行聚类分析,构建了亲缘关系树状图。结果显示这些菌株大体上可分为野生双孢蘑菇和野生蘑菇属其它菌株两大类群,其中来自川藏高原的41个野生双孢蘑菇按照采集地的不同聚为4个群,地域性差异比较明显;部分来自新疆、西藏的白色野生双孢蘑菇菌株新疆野生、AgX04和AgX042具有独特带型,与其它双孢蘑菇菌株的遗传相似值仅为10%～13%。
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蘑菇圈上四孢蘑菇个体间遗传差异的ISSR分析
《食用菌学报 》 2009 北大核心
摘要：对四孢蘑菇(Agaricus campestris L.:Fr.)形成的蘑菇圈形态和子实体发生进行了调查,并对蘑菇圈上的四孢蘑菇个体间遗传差异进行了ISSR分析,建立遗传关系聚类图。结果表明,在生长于四川西部平坦高原草地上,四孢蘑菇形成的蘑菇圈为圆环状,蘑菇圈上生长的植物明显较蘑菇圈内、外生长的植物茂盛,同一蘑菇圈上生长的子实体生长期不完全一致;同一蘑菇圈上的四孢蘑菇个体之间相似系数为0.473~0.755,不同蘑菇圈上的个体遗传相似系数为0.333~0.604;在相似系数0.524水平上,不同蘑菇圈上的四孢蘑菇个体分别聚为不同类群。
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利用ISSR分析野生蘑菇与双孢蘑菇的遗传多样性
《四川大学学报(自然科学版) 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用 ISSR 分子标记对一批野生蘑菇进行分子鉴别,从选用的60个 ISSR 引物中,筛选出11个引物,对供试的14个菌株基因组 DNA 进行扩增,获得的指纹图谱清晰稳定、多态性强.结果表明,在获得的116个条带中,74.1%是多态性条带,相似系数从0.32到0.72.用NTSYS 软件进行聚类分析,野生蘑菇与双孢蘑菇的相似系数较低,最高的仅在0.7的水平上.研究结果袁明,该批野生蘑菇有明显的遗传多样性,可以作为蘑菇杂交育种的资源.
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附子ISSR-PCR反应体系的建立
《四川食品与发酵 》 2008
摘要：ISSR分析可对附子(Radix Aconiti Lateralis Preparata)的遗传多样性进行研究。为获得清晰、重复性高的ISSR扩增结果,对影响ISSR-PCR的多个因素,包括DNA模板浓度、Taq酶用量、引物和Mg2+浓度进行了比较、优化。研究表明,10-60ng模板DNA,1UTaq酶,0.2μmol/L引物,1.5mmol/LMgCl2,4种dNTPs各200μmol/L,10×PCR缓冲液构建的20μL的ISSR反应体系为最适体系。
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五个野生木耳属菌株的ISSR分析
《食用菌学报 》 2008 北大核心
摘要：以7个栽培菌株为参照,采用ISSR分子标记技术对5个野生木耳属菌株进行分析,使用NTSYSpc2.1生物软件对12个供试菌株进行聚类分析,构建系统树。试验筛选出了11个扩增谱带清晰、多态性好的ISSR引物,共扩增出78条清晰易辨的多态性谱带。聚类分析结果表明,利用ISSR技术可将全部供试材料区分开,遗传相似系数变异范围为0.108~0.822,在相似系数为0.51时,12个菌株聚为6个群,其中5个野生菌株各自聚为不同类群,遗传差异较大。
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