科研产出
酪氨酸酶和漆酶基因在不同颜色金针菇中的表达模式
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】在金针菇（Flammulina filiformis）基因组中鉴定酪氨酸酶（TYR）和漆酶（Lac）基因家族成员，分析TYR和Lac家族基因的组织表达模式及在不同颜色金针菇菌盖表皮中的相对表达水平，为研究TYR和Lac基因在金针菇颜色差异调控中的功能提供理论基础。【方法】基于基因组数据系统鉴定金针菇TYR和Lac基因家族成员，利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析基因在不同颜色菌株（白色、黄色和褐色）菌柄和菌盖表皮组织的表达水平，并对酶活性进行测定。【结果】在金针菇基因组中共鉴定到3个TYR基因和11个Lac基因，编码蛋白均具有该家族典型保守结构域和保守基序，并与其他食用菌的相同基因家族成员亲缘关系较近。RT-qPCR分析显示，TYR3、Lac6和Lac11基因则在不同颜色菌株菌盖表皮的表达水平均高于菌柄表皮组织；Lac2在颜色较深的褐色菌盖表皮中显著高表达，而在白色和黄色菌株相对较低。进一步测定酶活性显示，白色菌盖表皮组织中的TYR酶活性显著高于褐色和黄色菌株；而Lac酶活性则在褐色菌盖表皮组织更高，其次是黄色，白色菌株中Lac酶活最低。【结论】在金针菇中鉴定出3个TYR和11个Lac家族基因；其中，漆酶家族成员可能通过催化酚类物质氧化聚合参与金针菇黑色素合成，导致金针菇菌盖呈现褐色表型。
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比较转录组学分析金针菇菌柄伸长调控相关途径和基因
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：金针菇菌柄是其主要可食用部位，但是对菌柄伸长的调控机理的了解还不够深入，相关基因报道较少。本研究以工厂化栽培黄色金针菇为研究对象，分析菌柄上、中、下3个部位的伸长特性，并进行比较转录组学分析和qRT-PCR验证。结果显示，黄色金针菇菌柄伸长区位于上部，中部与下部相比的差异基因共532个，而上部与中部相比的差异基因达3522个。上部与中部相比的差异基因GO分子功能注释主要包括核糖体结构组成、结构分子活性、运输活性和跨膜转运蛋白活性；KEGG分析则显示上调基因显著富集到核糖体、类固醇生物合成、DNA复制等通路，下调基因显著富集到次生代谢物和氨基酸的生物合成、糖酵解等代谢途径。差异倍数最高的基因包括几丁质酶和糖基水解酶以及转录因子等，q RT-PCR结果证明转录组数据准确可靠。本研究全面展示可能参与金针菇菌柄伸长调控的途径和候选基因，为后续基因功能研究和金针菇的分子育种提供基因资源。
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基于非靶向代谢组学分析黄色和白色金针菇代谢物差异
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：金针菇Flammulina filiformis是我国重要的食用真菌，主要包括黄色和白色两种品系。为了探究不同颜色金针菇子实体代谢物的差异，以相同条件下栽培的黄色和白色金针菇子实体为供试材料进行非靶向代谢组学分析。结果显示：大部分差异代谢物在黄色金针菇中的积累量明显较高，黄色和白色子实体之间的差异代谢物显著富集到苯丙氨酸和酪氨酸及色氨酸生物合成途径、淀粉和蔗糖代谢途径。黄色金针菇中苯丙氨酸含量降低同时酪氨酸含量增加，对应的苯丙氨酸解氨酶基因PAL1的表达水平下调，酪氨酸酶基因TYR表达上调；苯丙氨酸解氨酶和酪氨酸酶的活性均显著高于白色金针菇。此外，益智或呈味相关氨基酸半胱氨酸、精氨酸、脯氨酸、天冬氨酸和组氨酸在黄色金针菇中含量更高。本研究整体呈现了两种金针菇的代谢物差异并为后续完整解析子实体颜色表型差异提供了线索和铺垫。
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基于基因组重测序发掘金针菇InDel、SV及丰度SNP标记
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：以金针菇白色单核菌株wm14基因组为参考基因组,以双核菌株15W、16W、18W、19W、20Y、21Y、22Y和25Y基因组重测序数据为研究对象,以自备的4个金针菇基因组为blast检验数据库,采用VCFtools-0.1.16软件进行数据过滤,发掘可靠且多态性强的SNP、InDel及SV位点信息.使用Primer3软件设计引物,通过标记引物的blastn特异性及通用性检测,实验获得了InDel/SV标记26个;它们可以直接扩增,根据电泳条带的大小差异检测菌株的遗传差异,获得了丰度SNP标记区域63个,成功设计出通用性引物16对作为传统ITS、Rpb2、Ef1α等靶标序列的有益补充.本研究拟开发更多可用于金针菇遗传分析的分子标记,希望可以从全基因组扫描明晰研究菌株的遗传背景,为后续金针菇分子辅助育种、功能基因发掘与机理探索等研究提供助力.
关键词： 金针菇 插入与缺失标记 结构变异标记 单核苷酸多态性标记 引物设计
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实时定量PCR评估金针菇的内参基因稳定性
《菌物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：金针菇在中国和日本是最受人喜爱的食用菌之一,在重要栽培食用菌中产销量排名第四。近年来,已在活性物质、分子标记及基因鉴定方面开展了大量工作,但未见有金针菇内参基因稳定性研究的报道,导致金针菇基因表达研究无内源参考基因稳定性数据作为参考。本研究采用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper和Ref Finder4种软件评估18S核糖体RNA（18S）、28S核糖体RNA（28S）、60S核糖体蛋白L18（Rpl18）、肌动蛋白1（Act1）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（Gapdh）、翻译延伸因子EF1-alpha（Ef1A）、DNA指导的RNA聚合酶亚基2（Rpb2）、细胞色素C氧化酶亚基1（Cox1）及细胞色素b（Cyt B）等9个内参基因的稳定性。综合分析结果显示,单个基因中Act1基因最稳定,Cyt B表达稳定性最差,但单个候选内参基因的稳定性不能够满足定量PCR实验要求;根据ge Norm软件分析结果,Cyt B和Rpb2是金针菇定量PCR的稳定内参基因组合。本研究首次评估了金针菇的内参基因稳定性,将为后续的基因表达研究提供参考。
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3种保鲜膜材料对金针菇常温保鲜效果的影响
《西南农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为延长金针菇的常温货架期。【方法】以新鲜的金针菇为原料,分别以实验室自制的聚乙烯(C)、改性聚乙烯(M)、聚乳酸(P)3种保鲜膜为包装材料,在温度(25±1)℃、湿度75%~80%的贮藏环境下,研究3种保鲜膜对金针菇常温贮藏保鲜品质的影响。【结果】M保鲜膜在降低金针菇失重率、延缓褐变和游离氨基酸含量升高、保持脆度、色差方面优于C、P保鲜膜;P保鲜膜在延缓可溶性固形物含量降低、细胞膜透性升高方面优于M保鲜膜,而M保鲜膜优于C保鲜膜;在延缓菌落总数升高方面,M保鲜膜和P保鲜膜包装的效果无明显差异,但都显著优于C保鲜膜。【结论】综合评价3种保鲜膜对金针菇的常温保鲜效果,M保鲜膜包装的金针菇常温贮藏保鲜效果最佳,能有效降低金针菇在常温贮藏过程中的品质恶化,延长货架期。
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金针菇菌株农艺性状评价与遗传差异分析
《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR技术对29个金针菇菌株进行了遗传多样性和农艺性状分析,建立了遗传相似性聚类图和农艺性状指标。结果表明,29个金针菇菌株遗传相似性水平在0.67~0.89,在0.67水平上29个菌株被聚为一个类群,在遗传相似性水平为0.70上,将29个金针菇菌株分为4个大类群;在农艺性状上存在较大差异,产量上分为高产类、中产类和低产类,生育期上分为早熟和晚熟两类,子实体形态特征上分为黄色和白色、粗柄和细柄、基部绒毛分为有和无,建立了金针菇主要农艺性状指标。
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金针菇生活史中核相变化
《食用菌学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以金针菇(Flammulina velutipes)子实体、初生菌丝和次生菌丝为材料,采用荧光染色法对子实体的囊状体、担子、担孢子,初生菌丝和次生菌丝、粉孢子进行镜检、观察细胞核。结果为子实体中囊状体无细胞核,只有担子和担孢子内有细胞核,细胞核分裂不同步;细胞核变化过程为:由双核经历核融合,形成单核,经过二次减数分裂和一次有丝分裂后形成8个核,以2个为一组进入担孢子,形成双核担孢子,最后留下无核的担子。初生菌丝(由担孢子萌发的菌丝)细胞核不定,为1~5个核,次生菌丝(初生菌丝细胞质融合形成的双核菌丝)细胞核为2个,初生菌丝和次生菌丝形成的粉孢子均为1~2个核,以单核为主。
关键词： 金针菇 荧光染色 担子 担孢子 菌丝 粉孢子 细胞核
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