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比较转录组学分析金针菇菌柄伸长调控相关途径和基因

文献类型： 中文期刊

作者： 崔玉琴 1 ; 刘询 2 ; 何晓兰 2 ; 王波 2 ; 万燕 1 ; 彭卫红 1 ;

作者机构： 1.成都大学食品与生物工程学院农业农村部杂粮加工重点实验室

2.四川省食用菌研究所

关键词： 转录组学;金针菇;菌柄;伸长;基因

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2024 年 43 卷 012 期

页码： 65-78

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 金针菇菌柄是其主要可食用部位，但是对菌柄伸长的调控机理的了解还不够深入，相关基因报道较少。本研究以工厂化栽培黄色金针菇为研究对象，分析菌柄上、中、下3个部位的伸长特性，并进行比较转录组学分析和qRT-PCR验证。结果显示，黄色金针菇菌柄伸长区位于上部，中部与下部相比的差异基因共532个，而上部与中部相比的差异基因达3522个。上部与中部相比的差异基因GO分子功能注释主要包括核糖体结构组成、结构分子活性、运输活性和跨膜转运蛋白活性；KEGG分析则显示上调基因显著富集到核糖体、类固醇生物合成、DNA复制等通路，下调基因显著富集到次生代谢物和氨基酸的生物合成、糖酵解等代谢途径。差异倍数最高的基因包括几丁质酶和糖基水解酶以及转录因子等，q RT-PCR结果证明转录组数据准确可靠。本研究全面展示可能参与金针菇菌柄伸长调控的途径和候选基因，为后续基因功能研究和金针菇的分子育种提供基因资源。

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