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资源类型: 中文期刊
关键词:聚类分析(模糊匹配)
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药用灵芝遗传多样性的AFLP分析

中国中药杂志 2007 北大核心 CSCD

摘要:目的:分析不同药用灵芝栽培菌株的遗传差异,为灵芝道地性研究、种质资源鉴定、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法:以24个来源不同的灵芝及紫芝栽培菌株和野生菌株为材料,采用扩增酶切片断多态性AFLP方法,用NTSYSpc 2.1软件进行UPGMA法聚类分析,构建遗传系统树。结果:筛选14对引物,共扩增出177条多态性谱带。聚类结果表明利用AFLP技术可将全部供试材料区分开。结论:药用灵芝栽培菌株在分子水平上存在较大差异,并在相似系数0.676水平上聚为赤芝群和紫芝群。

关键词: AFLP 灵芝 遗传多样性 聚类分析

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南瑞苕AFLP指纹图谱的构建与聚类分析

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:以甘薯生产中主要应用的亲本材料南瑞苕及其子代品种为材料,用建立的AFLP分子标记体系进行研究,筛选得到5对多态性高、分辨力强的引物EATT、MCCA等,通过这5对引物构建出了南瑞苕的指纹图谱。用16对引物对47个与南瑞苕相关的品种进行聚类分析,统计DNA多态性条带后用UPGMA方法获得了聚类分析图,根据结果将47个品种分为5大类型,该实验结果为甘薯育种工作者了解各个品种的相互关系和进一步应用某一材料的优良性状选育品种奠定了基础。

关键词: 甘薯 南瑞苕 AFLP DNA指纹图谱 聚类分析

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中国西南地区芥菜型油菜资源遗传多样性分析

中国农业科学 2007 北大核心 CSCD

摘要:【目的】研究中国西南地区丰富的芥菜型油菜资源遗传多样性,为芥菜型油菜资源的保护和育种利用提供有益的数据。【方法】选取以西南地区为主的73份芥菜型油菜资源,分别进行14个随机引物RAPD标记多态性分析结果的聚类分析和15个主要植物学性状量测数据的聚类分析。【结果】RAPD标记多态性分析结果的聚类分析显示为3大类,共15个亚类:四川盆地资源为第1大类,含川东、川南、川北和重庆来源等6个亚类;盆周及盆周高原和云南部分资源为第2大类,分川东南、川西南和川西北来源等4个亚类;云贵高原及长江两岸为第3大类,以贵州、云南来源的资源为主,分贵阳周边、金沙江流域和云南中部来源等5个亚类。植物学性状量测数据的聚类分析显示为4大类,共14个亚类:第1大类以川东南、重庆和云南来源的资源为主,分3个亚类;第2大类以川南、川北、云南和贵州来源的资源为主,分4个亚类;第3大类以贵州、四川来源的资源为主,分4个亚类;第4大类以川西北来源的资源为主,含3个亚类。【结论】西南地区芥菜型油菜资源间差异明显,具有丰富的遗传多样性;RAPD标记多态性分析结果和植物学性状量测数据的聚类分析结果,显示分类主要遵循地域和生态环境规律,可分清芥菜型油菜资源间的亲缘关系和遗传距离远近;在分子水平上,分类结果可能更深入和准确可靠。

关键词: 芥菜型油菜 地方资源 遗传多样性 RAPD标记 植物学性状 聚类分析

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四川省2005—2006年区试小麦品种(系)的SSR遗传多样性

分子植物育种 2007 CSCD

摘要:为明确四川近年来普通小麦的遗传差异情况,本研究采用微卫星分子标记(SSR)对四川省2005~2006年参加区试的66个小麦品系进行了遗传多样性研究,用18对扩增谱带稳定的SSR引物,共检测到106个等位位点,每对引物等位位点数为2~13个,平均5.89个。SSR引物的PIC介于0.22~0.91之间,平均多态性信息0.498。聚类分析表明,品种间遗传相似系数(GS)变异范围为0.390~0.834,平均值为0.608,品种间遗传相似性变幅较大,表明这次小麦区试品种(系)间存在着不同程度的遗传多样性差异。根据品种间遗传相似系数聚类,66份材料被聚成五类。

关键词: 普通小麦 SSR标记 遗传多样性 聚类分析 品种区试

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四川省常用玉米自交系“棒三叶”农艺性状聚类分析

玉米科学 2007 北大核心 CSCD

摘要:根据玉米棒三叶的6个农艺性状对四川省常用自交系进行了聚类分析。结果表明,四川省常用玉米自交系中有许多优异资源,但以棒三叶呈较宽叶片、较大面积、较紧凑型和较大叶面积、低叶绿素含量中间型为主,未出现较长叶片、较大叶面积、较紧凑型和较大叶面积、高叶绿素含量、较紧凑型。说明在理想株型育种中,还需进一步挖掘玉米基因资源,在考虑配合力遗传的同时加强基因重组,培育不断接近理想株型的优异玉米自交系资源。

关键词: 玉米 自交系 棒三叶 种质资源 农艺性状 聚类分析

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酒曲理化品质指标相关性探讨

酿酒科技 2006 北大核心

摘要:以泸州老窖成品曲为研究对象,根据多元生物统计学原理,采用DPS数据处理系统,对曲药理化指标进行了基本参数估算、系统聚类分析和多元相关分析。结果表明,①泸州老窖的曲药质量是基本稳定的,可以95%的置信区间作为判定曲药质量是否相对稳定的范围。②曲药可分为性能各异的3个大类:第一类曲是液化力、糖化力、酯化力和酒化力均较高;第二类曲各指标值均处于中等值;第三类曲是糖化力、液化力、酯化力和产酒力均较低。③曲药的部分理化指标间存在显著的相关性,呈正相关的有酸度与氨态氮、液化力与糖化力、液化力与发酵力、发酵力与发酵醪酸度;呈负相关的有酸度与酒化力、酸度与发酵醪总酯、糖化力与发酵力、发酵醪酸度与酒化力。曲药酸度大小和氨态氮含量高低可作为反映大曲复合曲香物质强弱的指标。④传统的体现大曲产酒能力糖化力、液化力和发酵力三大指标与大曲发酵醪的产酒量(酒化力)无明显相关性,曲药的酯化力与发酵醪酯含量相关性亦不明显,表明大曲的酒化、酯化、生香功能是一个非常复杂的系统,需要更进一步的深入研究。

关键词: 泸州老窖大曲 理化指标 多元生物统计 聚类分析 多元相关分析

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中国黑子南瓜种质资源遗传多态性分析

四川大学学报(自然科学版) 2005 北大核心 CSCD

摘要:用从100个10mers随机引物中筛选出的13个具有特异多态性引物对黑子南瓜种质资源遗传多态性进行了RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA)分析.结果表明,RAPD对中国南瓜种、印度南瓜种、美洲南瓜种及黑子南瓜种的分类与传统分类学的结果相符.我国现有栽培黑子南瓜在DNA水平上的同源性极高,种质资源的遗传变异度较小,多样性水平较低,不如其它三个南瓜种多态性丰富.

关键词: 黑子南瓜 RAPD 聚类分析 遗传多样性

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杂交水稻干物质累积的基因型差异

西南农业大学学报(自然科学版) 2004 北大核心 CSCD

摘要:采用包括遗传主效和基因型与环境互作的遗传模型和统计方法,以7个籼型不育系与4个籼型、1个籼粳交偏籼型及1个籼粳交偏粳型恢复系按NCⅡ交配设计配制42个组合2个播期资料,分析各类杂交稻不同生育期干物质累积的基因效应,用聚类方法分析基因型间的遗传差异。聚类分析将42组合分为3大类,Ⅰ类组合干重的遗传由双亲共同控制,Ⅱ类组合干重的遗传主要受不育系控制,Ⅲ类组合干重的遗传主要受恢复系控制。亚种间组合干物质累积特点与品种间组合有较大差异。1103S、珍汕97A及明恢63可作为改良干重性状的优良亲本。

关键词: 杂交稻 干物质累积 遗传差异 聚类分析

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水稻早熟恢复系体细胞无性系数量性状的遗传差异

西南农业学报 2004 CSCD

摘要:对来源于水稻早熟恢复系402的53个体细胞无性系的21个数量性状进行了主成分分析及聚类分析。结果表明,前7个主成分对变异的累积贡献率达84 21%,53个体细胞无性系被分为6类。米粒长、米粒长/宽比、糙米率、精米率、整精米率、穗粒数、单株粒重、单株有效穗及株高等性状的变异较大,而其余性状的变异相对较小。各类体细胞无性系株系具有不同的性状变异组合。Ⅰ类、Ⅳ类株系综合性状较好,应作为重点测配株系。

关键词: 水稻 早熟恢复系 体细胞无性系 数量性状 主成分分析 聚类分析

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中国部分栽培南瓜种质资源遗传多态性RAPD分析

西南农业学报 2004 CSCD

摘要:从120个10 mers随机引物中筛选出9个具有特异多态性引物对我国部分地区收集到的一些栽培南瓜种质资源遗传多态性的RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA)分析。结果表明,在检测到的60条带中,有59条具有多态性,平均每个引物检测到的条带数多达6 56条;中国栽培南瓜资源在DNA水平上具有丰富的遗传多样性。UPGMA树形图显示,除N23外,可将30份材料归为中国南瓜种、印度南瓜种及美洲南瓜种3类,与传统分类学的结果相符。

关键词: 南瓜 RAPD 聚类分析 遗传多样性

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