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资源类型: 中文期刊
关键词:AFLP(模糊匹配)
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小麦品种混合对条锈病菌毒性演变的影响研究

西南农业学报 2015 北大核心 CSCD

摘要:将四川小麦条锈病菌致病类型Su-12菌株接种不同小麦品种和及其混合组合,连续繁殖3代和9代后收集夏孢子接种小麦条锈病菌生理小种鉴别寄主,发现病菌毒性发生了显著变化。连续繁殖3代后,Su-12未再检出,但出现了1个对水源11和Hybrid46均不具毒性的未知致病类型以及4个对水源11具毒性的未知致病类型。连续繁殖9代后,条中33和2个对水源11具毒性的新未知致病类型分别出现在绵阳31、川麦107和川农10号上,而条中32、Hy-4和4个对Hybrid 46具毒性的未知致病类型则分别发生在川麦36、川麦37、川育18、混I、混II和铭贤169上。起始菌株对川麦36具毒性,但在川麦107、川育18、川农10号、铭贤169和上述6个品种的等比混合上继代培养9代后对川麦36失去毒性。将不同品种和混合组合上继代培养后C1、C3和C9代的夏孢子经铭贤169繁殖后,提取DNA经酶切、连接和预扩后,利用对四川小麦条锈病菌能够显示AFLP多态性的引物对E7(GTAGACTGCGTACCAATTCAT)/M5(GACGATGAGTCCTGAGTAAAT)和E7/M3(GACGATGAGTCCTGAGTAATC)选扩产物电泳后,各样品间未观察到AFLP多态性。以上结果表明小麦抗性品种含有的抗性基因具有定向选择作用,而在感病品种上繁殖多代后,小麦条锈病菌病菌毒性有可能减弱,多品种混合组合上繁殖的小麦条锈病菌毒性弱于绵阳31和川麦36单播,可能与高抗品种的定向选择作用被稀释有关。

关键词: 小麦 条锈病菌 品种混合 毒性变异 AFLP

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四川省稻曲病菌的群体遗传结构

西南农业学报 2013 北大核心 CSCD

摘要:采用AFLP(Amplified fragmentlength polymorphism)技术分析了来自四川14个不同水稻种植区和50个不同籼型杂交稻稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性。20对选择性扩增EcoRⅠ和MseⅠ引物组合稻曲病菌株可产生40~56条DNA带,75个菌株共产生192条清晰可见的DNA带型,其中多态性121条,占总数的63.02%。结果表明:不同地理来源稻曲病菌可能具有相同的遗传群体结构,也显示特异性的群体遗传特征;稻曲病菌遗传结构与寄主品种关系不大,没有表现明显的专化性互作;稻曲病菌不同的遗传群体之间菌株的致病性存在很大差异,即使同一遗传群的不同亚群或同一亚群的不同次亚群之间的菌株致病性也显著不同。

关键词: 稻曲病菌 AFLP 遗传群体 致病性

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西藏林芝麦类条锈病菌群体多样性分析

西南农业学报 2012 北大核心 CSCD

摘要:为了解西藏麦类条锈病菌种群结构,测定了来自西藏林芝及邻近地区的70个菌株生理小种。结果表明,在检测出的23种小种类型中,林芝地区病菌分属水源致病类群及CY28以前的致病类型,水-2和水-5为林芝优势小种,但在2009年CY28以前类型的现频率高达32.35%。筛选出E2M2、E3M3、E4M6、E7M6等4对Eco R I/Mse I引物组合,对各条锈病菌株基因组DNA进行AFLP分析,共扩增出141条可统计的条带,其中多态性条带为39条,多态率为27.65%。经AFLP分析,70个参试菌株的遗传相似系数范围为0.55~1.00。当遗传相似系数为0.748时,所有菌株可分为4组。其中来自林芝的菌株大部分被聚类在A组的第一、第二亚组,而A组第四亚组、B、和D组为西藏特有遗传类型。来自四川阿坝州的菌株均属于A组第一亚组,来自四川甘孜和凉山的菌株均属于A组第二亚组。来自云南丽江的菌株分属A组第三亚组和C组。毒性分析和AFLP分析均表明,西藏条锈病菌是一个相对独立的群体,但和邻近地区特别是四川越夏区有一定的亲缘关系。

关键词: 小麦条锈菌 生理小种 AFLP 遗传多样性 西藏 四川 云南

采用AFLP分析齐口裂腹鱼DNA指纹的技术探讨

中国测试技术 2008

摘要:AFLP(选择性扩增片断长度多态性)指纹技术被认为是当今最有效的DNA指纹分析技术之一,但是由于该技术操作流程较长,对模板DNA质量要求较高以及PCR反应成分等变数条件的影响,要获得高清晰的DNA指纹图谱比较困难。文中以齐口裂腹鱼为研究对象,对AFLP的分析条件作了一定的探索。结果表明:基因组DNA必须是高纯度、高分子量;酶切充分;PCR反应最佳条件为:引物E-XYZ,M-XYZ在体系中的浓度分别为1ng/mL,5ng/mL;dNTPs浓度为0.2mmol/L;MgCl2浓度为1.9mmol/L。银染时在NaOH条件下显色比在传统银染法中的Na2CO3条件下显色,图谱背景更干净,条带更清晰。

关键词: AFLP 基因组DNA制备 条件优化 银染

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甘薯抗黑斑病材料AFLP标记分子鉴定初步研究

西南农业学报 2008 北大核心 CSCD

摘要:以南薯88等12个抗感黑斑病品种为材料,通过甘薯黑斑病室内抗性鉴定,确定其抗感病程度。通过DNA提取、酶切、PCR扩增、凝胶电泳等系列程序摸索和优化,建立了甘薯黑斑病的AFLP分子标记体系。并用该体系找到了与甘薯抗黑斑病紧密相关的特异性DNA片段,对该片段克隆、测序后发现该DNA片段由320个碱基组成,为进一步分析该片段的特异性和灵敏性为甘薯抗黑斑病分子标记辅助育种奠定了基础。

关键词: 甘薯黑斑病 抗性 分子标记 AFLP

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AFLP分子标记技术及其在家蚕遗传育种中的应用

陕西农业科学 2008

摘要:AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)技术是一种高效的基因组DNA多态性分析技术,具有在一次实验中可同时观察到大量限制性片段的优点。阐述了AFLP的基本原理和实验操作方法,综述了AFLP技术在家蚕分类和亲缘关系分析、品种(杂种)鉴定、构建遗传图谱、基因定位及分子标记辅助育种等方面的应用。展望了AFLP标记技术在蚕业科研中的应用前景。

关键词: AFLP 分子标记 家蚕 遗传育种

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药用灵芝遗传多样性的AFLP分析

中国中药杂志 2007 北大核心 CSCD

摘要:目的:分析不同药用灵芝栽培菌株的遗传差异,为灵芝道地性研究、种质资源鉴定、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法:以24个来源不同的灵芝及紫芝栽培菌株和野生菌株为材料,采用扩增酶切片断多态性AFLP方法,用NTSYSpc 2.1软件进行UPGMA法聚类分析,构建遗传系统树。结果:筛选14对引物,共扩增出177条多态性谱带。聚类结果表明利用AFLP技术可将全部供试材料区分开。结论:药用灵芝栽培菌株在分子水平上存在较大差异,并在相似系数0.676水平上聚为赤芝群和紫芝群。

关键词: AFLP 灵芝 遗传多样性 聚类分析

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南瑞苕AFLP指纹图谱的构建与聚类分析

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:以甘薯生产中主要应用的亲本材料南瑞苕及其子代品种为材料,用建立的AFLP分子标记体系进行研究,筛选得到5对多态性高、分辨力强的引物EATT、MCCA等,通过这5对引物构建出了南瑞苕的指纹图谱。用16对引物对47个与南瑞苕相关的品种进行聚类分析,统计DNA多态性条带后用UPGMA方法获得了聚类分析图,根据结果将47个品种分为5大类型,该实验结果为甘薯育种工作者了解各个品种的相互关系和进一步应用某一材料的优良性状选育品种奠定了基础。

关键词: 甘薯 南瑞苕 AFLP DNA指纹图谱 聚类分析

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K型和冈型水稻线粒体DNA的AFLP分析

重庆大学学报(自然科学版) 2007 北大核心 CSCD

摘要:用264个随机引物(E11,M24)对K型和冈型水稻(Oryza sativa L.)的不育系、保持系和F1代线粒体DNA进行AFLP分析,共筛选到了37对扩增效果较好的引物,显示出9条可能与K型水稻雄性不育相关的差异带,3条可能与冈型水稻雄性不育相关的差异带。其中引物组合E10M8(EcoRⅠ-ATA×MseⅠ-AGC)扩增后,K型和冈型水稻不育系、F1代几乎在750 bp左右的位置都同时表现出了差异条带而在保持系相应位置表现为缺失,它与"缺陷型不育"假设一致。由此证明了K型和冈型水稻不育系线粒体DNA的特异性及其与雄性不育的相关性,为回收克隆等后续工作奠定了基础。

关键词: 水稻 胞质雄性不育系 线粒体DNA(mtDNA) AFLP

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不同时期水稻主要恢复系、不育系的遗传差异变化研究

作物学报 2007 北大核心 CSCD

摘要:AFLP技术分析了我国不同年代广泛应用的野败型杂交水稻19个恢复系和13个不育系的遗传差异,同时基于其农艺性状进行了聚类,结果表明:(1)基于标记和性状两种聚类在不育系和恢复系的区分上一致,而在恢复系内和不育系内的遗传差异检测上有较大差异;(2)我国水稻亲本间的遗传差异较大,且在不育系与恢复系间>恢复系内>不育系内;(3)恢复系内的遗传差异以早期小于中期、近期,其与不育系间的遗传差异也存在同样的关系,这与20世纪80年代中、后期我国杂交水稻产量大幅度提高,90年代后一直徘徊不前的变化趋势一致;(4)不育系内的遗传差异后期大于前期,但它与恢复系间的遗传差异前、后期不显著;(5)不同年代恢复系的分子标记遗传差异变化趋势与杂交水稻产量变化趋势一致,分子标记揭示的遗传差异可为杂交育种中恢复系的选择提供参考。

关键词: 杂交水稻 遗传差异 AFLP 农艺性状

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