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资源类型: 中文期刊
关键词:RAPD(模糊匹配)
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重庆养殖中华鳖群体遗传多样性的RAPD分析

安徽农业科学 2023

摘要:[目的]利用RAPD标记技术对重庆4个养殖地区中华鳖的遗传多样性进行分析。[方法]选取(潼南、永川、江津、长寿)4个地区养殖中华鳖样本,运用RAPD方法对4个地区的中华鳖遗传多样性与其遗传距离进行了分析。[结果]用20个随机扩增引物得到142个扩增片段,多态片段数量为95个,4个地区的多态位点比例范围为50.78%~64.54%,总多态位点比例为66.90%,总基因多样性为0.227,种群内基因多样性为0.135,遗传分化系数为0.307,基因流为1.127。4个养殖中华鳖群体的遗传距离为0.049~0.151。[结论]重庆4个地区养殖中华鳖遗传多样性较高,且大部分遗传变异存在于种群内,个体间亲缘关系较近,遗传变异度较小。

关键词: 中华鳖 遗传多样性 RAPD 重庆地区

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四川省甘孜州9个不同地理蝗虫种群遗传多样性的RAPD分析

西南农业学报 2016 北大核心 CSCD

摘要:采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,研究了四川省甘孜州地区蝗虫的遗传结构。用筛选出的12条随机引物对9个种群91个个体进行扩增。结果表明,12条引物共检测到95个位点,其中多态位点共计72个。Shannon信息指数(I)和Nei's遗传多样性(H)估计的9个种群的遗传多样性水平分别是0.4161和0.2810。利用Nei's基因多样性指数进行群体内遗传多样性评价,Shannon多样性指数(I)具有相同的结果,来自四川甘孜雅县雅江(YJGL)种群值最高,为0.1674,白玉县金沙乡(BYJS)种群最低为0.0405;居群内基因多样度Hs为0.0777,表明遗传变异主要存在于居群间。基因分化系数Gst为0.7255,表明居群内的遗传变异小,群间有较大的遗传变异。用NJ法对Nei's遗传距离作聚类分析,构建分子系统树,在0.765水平上,可将9个地区的蝗虫种群完全分开,理塘县的雄坝乡汉戈村和甲洼乡俄曲村蝗虫与东亚飞蝗关系较为密切。群内的遗传距离都小于地理上的遗传距离。

关键词: 蝗虫 种群 RAPD 遗传多样性

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苏丹草品种间的RAPD分析

西南农业学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:为评价苏丹草品种间的遗传多样性,用RAPD标记对14个苏丹草品种进行了遗传多样性分析。从100条RAPD引物中筛选出20条多态性明显、反应稳定的引物。14个品种共扩增出260条谱带,平均每条引物扩增出11.6条带,多态性比率达88.5%。聚类分析结果表明:苏丹草品种间遗传多样性丰富,材料间遗传相似系数分布在0.586~0.831;14个品种分为两大类,来自美国的"伊诺"和"布鲁赛"聚为一类;第Ⅱ类把高大型和低矮型聚为两类。结果显示出:聚类结果与形态特征有一定的对应关系,这为苏丹草种质资源的保存、利用和新品种选育提供了依据。

关键词: 苏丹草 RAPD UPGMA 遗传多样性

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茄子(S. melongena L.)种质资源遗传多样性的RAPD分析

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:利用RAPD技术对来源于国内外的53份茄子种质资源进行了遗传多样性分析,从80个引物中筛选出9个多态性引物,共扩增出81条带,其中有46条多态性条带,占56.79%。种质间遗传相似系数在0.72~0.99之间,表明参试种质遗传基础比较狭窄。UPGMA树状图显示,可将53份参试茄子种质分为五大类群。聚类结果与传统分类并不完全一致,与地理分布没有联系。

关键词: RAPD 茄子 遗传多样性

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甜瓜分子标记纯度鉴定研究

中国瓜菜 2006

摘要:以2个甜瓜品种西域雪1号、西域雪2号及其亲本为试材,建立并优化了单粒种子DNA快速提取法和适合甜瓜的RAPD、SSR分子标记杂交种纯度鉴定体系。从100条随机引物中筛选出G17用于西域雪2号纯度鉴定,可有效区分母本和杂交种。从19对SSR引物中筛选出9对稳定扩增、多态性丰富的引物构建西域雪1号、西域雪2号的SSR指纹图谱。SSR分子标记用较少引物即可扩增出品种特异性条带,且多数F1代带型呈双亲互补,非常适合种子纯度鉴定。同时,使用高浓度、非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,条带更清晰,可区分只相差1个碱基的扩增片段,同RAPD相比,SSR分子标记更适合甜瓜杂交种纯度快速鉴定。

关键词: SSR RAPD 指纹图谱 甜瓜杂交种 纯度鉴定

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川西平原油菜菌核病菌群体结构研究

西南农业学报 2006 CSCD

摘要:2002年5月在川西平原4个地区:蒲江大兴、邛崃卧龙、双流黄水和邛崃固驿,从油菜病株茎杆上采集菌核,经分离和鉴定,共得到373个菌株进行菌丝生长速率、对多菌灵敏感性、菌丝融合群和遗传多样性的测定和分析,结果表明:川西油菜菌核病菌群体结构呈地域间和田块内的分化。病菌群体由遗传背景不同的8个亚类组成,而8个亚类的分布呈明显的区域性,不同地点同一田块内核盘菌株分属1(邛崃固驿)至4个(邛崃卧龙)亚类。各亚类由属于多个菌丝融合群的菌株组成,不同地点仅个别菌株属同一菌丝融合群。不同菌株间菌丝生长速度呈较大差异,各采样地点菌株平均生长速度差异较大。生长速度较快的284个菌株对多菌灵普遍敏感。

关键词: 油菜菌核病菌 多菌灵 抗药性 菌丝融合群 菌丝生长速度 RAPD

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中国黑子南瓜种质资源遗传多态性分析

四川大学学报(自然科学版) 2005 北大核心 CSCD

摘要:用从100个10mers随机引物中筛选出的13个具有特异多态性引物对黑子南瓜种质资源遗传多态性进行了RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA)分析.结果表明,RAPD对中国南瓜种、印度南瓜种、美洲南瓜种及黑子南瓜种的分类与传统分类学的结果相符.我国现有栽培黑子南瓜在DNA水平上的同源性极高,种质资源的遗传变异度较小,多样性水平较低,不如其它三个南瓜种多态性丰富.

关键词: 黑子南瓜 RAPD 聚类分析 遗传多样性

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小麦新品种川麦42分子特征

西南农业学报 2004 CSCD

摘要:应用RAPD、STS和SSR等3种分子标记对川麦42和对照品种川麦107进行了分析。结果表明,供试材料在DNA水平上存在多态性。3种标记均能揭示川麦42与对照品种在DNA水平上的遗传差异。其中,RAPD分析中共有10个引物(14 5%)和20条(12 3%)带纹,STS分析中有4个引物-酶组合(6 7%),而SSR分析中有15个位点(26 3%)能揭示材料间的差异。同时,川麦42与川麦107在SSR分子标记上的差异主要分布在B、D组染色体上,这种丰富遗传多样性可能来源于其人工合成种亲本(Altar84/Aegilopstauschii188)的影响。

关键词: 小麦 品种 人工合成种 川麦42 RAPD STS SSR

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四川蔬菜核盘菌种群结构初步研究

西南农业学报 2004 CSCD

摘要:对彭州甘蓝、莴笋、菜豆、油菜4种经济作物分离所获60个菌株在含药PDA平板上测定结果表明,1μg/mL和5μg/mL多菌灵对菌丝生长抑制率平均分别为98 46%和99 08%;最低分别为93 00%和94 52%;未发现抗药性菌株,其中4个菌株的EC50均小于0 5μg/mL。27个菌株与菌丝融合群标准菌株配对后,11个菌株可以与之融合而属于7个融合群,它们分别来自莴笋(4个),甘蓝(3个),菜豆(4个)。其余16个菌株不与30个标准菌株中的任一菌株融合,此16个菌株相互两两配对后,得到11个新融合群,其中8个菌株只与自身融合。31个菌株RAPD结果表明,除甘蓝分离核盘菌与油菜分离株具有较大差异(欧氏距离>1 5)外,不同来源菌株RAPD带谱相似甚至完全相同。

关键词: 核盘菌 蔬菜 多菌灵 敏感性 菌丝融合群 RAPD

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中国部分栽培南瓜种质资源遗传多态性RAPD分析

西南农业学报 2004 CSCD

摘要:从120个10 mers随机引物中筛选出9个具有特异多态性引物对我国部分地区收集到的一些栽培南瓜种质资源遗传多态性的RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA)分析。结果表明,在检测到的60条带中,有59条具有多态性,平均每个引物检测到的条带数多达6 56条;中国栽培南瓜资源在DNA水平上具有丰富的遗传多样性。UPGMA树形图显示,除N23外,可将30份材料归为中国南瓜种、印度南瓜种及美洲南瓜种3类,与传统分类学的结果相符。

关键词: 南瓜 RAPD 聚类分析 遗传多样性

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