科研产出
分子标记在核盘菌遗传多样性研究中的应用及展望
《安徽农业科学 》 2012 北大核心
摘要：对核盘菌遗传多样性研究中常用的分子标记方法,如随机扩增多态性(RAPD)、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、微卫星DNA(SSR)、相关序列扩增多态性(SRAP),及其发展方向进行了综述,以期为核盘菌的相关研究提供参考。
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枇杷果肉色泽深浅性状的分子标记鉴定
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为了探索与枇杷果肉色泽深浅有关的分子标记及其特异片段,本研究以枇杷突变体(红沙枇杷一枝芽变结出白沙果实)为材料,对其野生型和突变型果实品质进行评价。利用ISSR、SSR和SRAP 3种分子标记及前人研究的OPH-01/1800bp标记分析该突变体野生型和突变型基因组。结果表明,突变型果实可溶性固形物和总糖较高,β-胡萝卜素极显著低于野生型。所检测的108对SSR标记和9×11对SRAP引物组合在野生型和突变型没有多态性,从95条ISSR标记中获得了2条(UBC854和UBC813)多态性条带,这2条差异片段和OPH-01/1800bp标记都是在野生型出现,在突变型缺失,大小分别为1369(TB1)、535(TB2)和1719 bp(TB3)。通过NCBI数据库tblastx比对,TB1为非特异扩增片段,TB2碱基序列与枇杷果实发育中编码依赖NAD的山梨醇脱氢酶蛋白基因、苹果或梨属编码1-氨基环丙烷-1羧酸(ACC)合成酶蛋白基因等有较高同源关系;TB3与编码梨F-box蛋白、S-核酸酶和S核糖核酸酶及苹果MdSFBB9S9-α、S9核糖核酸酶和MdSFBB9S9-β等基因同源性较高。
关键词： 枇杷 果肉色泽 分子标记 多态性片段 β-胡萝卜素
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国兰ISSR-PCR反应体系的建立与优化
《北方园艺 》 2011 北大核心
摘要：采用正交设计与单因素结合法,对国兰ISSR-PCR反应体系中的4个因素(dNTPs、引物浓度、Mg2+、Taq DNA聚合酶)进行优化试验,结果用DPS软件进行分析。结果表明:各因素对PCR结果均有显著影响,其中Taq DNA聚合酶对反应的影响最大;筛选出了各反应因素的最佳水平,建立国兰ISSR-PCR的最佳反应体系(25μL)为:dNTPs 0.2mmol/L、引物1.0μmol/L、Mg2+2.5mmol/L、Taq DNA聚合酶1U。
关键词： 国兰 分子标记 ISSR-PCR 反应体系 正交设计
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分子标记遗传效应预测杂交水稻产量性状
《植物遗传资源学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：选用13个水稻不育系和19个恢复系按NCⅡ设计配制两套不完全双列杂交组合151个,2005年分别在重庆和泸州种植,结合AFLP和SSR标记位点的遗传效应,预测7个产量性状值。用两套组合F1产量性状对标记多态性位点进行筛选,获得阳性位点和增效位点及其加性和(或)显性效应值,通过逐步回归构建分子标记遗传效应预测产量性状模型,并对不同亲本组合(套间预测)及固定亲本组合产量性状进行了预测。结果表明:(1)阳性和增效位点进行套间预测的效果,绝大多数不理想(预测值与实际值的相关系数为-0.55~0.45),且预测效果不稳定;(2)阳性和增效位点对第二套固定亲本组合的预测效果相近,均优于套间预测,其中对固定恢复系组合的预测好于对固定不育系;(3)对固定亲本组合大部分产量性状的预测达到较理想水平,其中增效位点对固定不育系组合结实率、固定恢复系组合有效穗数、阳性位点对固定恢复系组合穗着粒数、单穗重的预测在0.6以上。用分子标记遗传效应预测产量性状,只需少数标记,应用方便,特别是对水稻育种亲本选配具有重要指导意义。
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应用SRAP分子标记构建茄子遗传图谱初探
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术构建茄子分子遗传连锁图,作图群体为255-4-4(Sola-num melongena L. sub sp. ovigerumSalis)与巴-3(S. melongena L. sub sp. melongena)杂交产生的118个F2单株。从88对引物中筛选多态性较好的33对引物组合进行群体检测,多态性频率为37.5%,共检测到40个多态性位点,平均每个引物组合产生1.21个多态性条带。对40个标记用Mapmanager构建连锁群,将24个SRAP标记位点进入4个连锁群,总长度为381.3 cM,标记位点间的平均距离为19.1 cM。
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美国西北部59个小麦品种(系)抗条锈病基因分子检测及对中国条锈菌系抗性鉴定
《中国农业科学 》 2010 CSTPCD
摘要：【目的】了解59份美国西北部小麦品种(系)对中国当前条锈菌流行小种的抗性水平,分析其抗病基因的存在情况,为培育中国抗条锈病新品种提供资源和依据。【方法】选用中国小麦条锈菌优势小种条中31号、条中32号和条中33号对大部分具有高温成株抗性的美国59份小麦品种(系)苗期及成株期进行抗性接种鉴定,利用与当前有效的全生育期抗性基因Yr10、Yr15、成株抗性基因Yr18、高温成株抗性基因Yr39紧密连锁的分子标记对供试材料进行分子检测。【结果】抗性鉴定表明,Expresso、02W50076、ACS52610、WA008012、WA008018等5份材料苗期与成株期对条中31号、条中32号和条中33号混合菌均表现为抗病,属于全生育期抗病品种。33份材料苗期表现感病而成株期表现抗病,属于成株期抗病品种。分子检测发现59份材料均不含有Yr10;含有Yr15、Yr18和Yr39的材料分别为12、33和29份,占20%、56%和49%。【结论】Yr18、Yr39在美国西北部小麦品(系)中的分布较普遍,并且大部分可以抵抗中国当前流行的条锈菌生理小种,可应用这些抗性材料配制中国小麦抗条锈病新品种。
棉花RAPD引物筛选及优质材料的遗传多样性分析
《绵阳师范学院学报 》 2009
摘要：为了对本课题组得到的大批优质棉花种质资源进行RAPD分子标记遗传多样性鉴定,我们进行了对棉花有效的引物对的筛选,并完成了24个优质棉花材料的遗传多样性分析。结果从48个随机引物对中筛选出了20对引物,这些引物对这24个优质棉花材料的有效性非常高,共扩增出113条谱带,平均每个引物扩增出5.65条,而且这20个随机引物对这24个材料的多态性谱带扩增效果非常明显,多态率高,能明显分辨出来源不同的材料。将这些多态性标记通过聚类软件分析,可将这24种材料明显的分为六类群,遗传多态性得到明显的体现。
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