康定冬虫夏草子囊孢子弹射期土壤细菌群落研究

冯仁才; 叶雷; 张笑萍; 亢宗静; 李小林; 《中国食用菌 》 2020

摘要：为探究四川甘孜藏族自治州康定市冬虫夏草（Ophiocordyceps sinensis）在子囊孢子弹射期土壤理化因子和细菌群落组成,找出可能影响冬虫夏草子囊孢子弹射的关键菌群,为更好开展冬虫夏草人工抚育奠定基础。以康定冬虫夏草人工抚育基地土壤为研究对象,对冬虫夏草虫体周际土壤和对照土壤进行高通量测序和土壤理化因子分析。结果显示:冬虫夏草虫体周际有机质（OM）、总氮（TN）、碱解氮（AN）、pH、镉（Cd）、铅（Pb）、汞（Hg）和砷（As）均显著低于对照地（P<0.05）,有相对更高含量的速效钾。样品细菌群落划分为33门、126纲、230目、375科、592属。门水平上,Proteobacteria、Acidobacteria和Actinobacteria为相对丰度最高的前三个门,三者占样品相对丰度比78.29%～81.47%,且Proteobacteria与Hg、AN和OM呈正相关;Acidobacteria与AP呈正相关,与OM、TN、Pb和As呈负相关;Actinobacteria与AK和OM呈正相关。属水平上,Rhodoplanes、DA101 （未命名）、Candidatus Solibacter、Ralstonia、Ochrobactrum、Rhodococcus等无论是否在冬虫夏草产地都有分布,以Rhodoplanes在J1、J2和J3中平均相对丰度分别为6.33%、6.28%和4.41%,显著高于J4的1.96%。研究结果对冬虫夏草子囊孢子弹射期其虫体周际土壤重金属、常规理化性质及土壤细菌组成有了进一步的认识,对更好开发康定市冬虫夏草资源具有重要意义。

关键词： 冬虫夏草 子囊孢子 土壤理化 细菌群落 多样性

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古蔺野生大茶树资源叶表型多样性研究

唐晓波; 彭海; 张厅; 刘飞; 刘晓; 龚雪蛟; 李春华; 王云; 《安徽农业科学 》 2018

摘要：[目的]明确古蔺野生大茶树资源的叶表型多样性。[方法]对古蔺县139份野生大茶树资源(7个天然居群)叶片18个表型性状遗传多样性进行分析。[结果]野生大茶树资源叶片性状变异丰富,变异系数在4.42%~24.28%,其中各性状在各居群间的变异系数最大值均超过10.00%,多样性指数在0.826 1~5.194 7(其中,Simpson指数在0.826 1~1.000 0,Shannon-Weaver指数在2.413 1~5.194 7);对18个叶片表型性状进行主成分分析,前6个主成分叶面积、叶缘、叶片宽度、叶面、叶色、叶身累计贡献率达74.65%;UPGMA聚类分析结果显示,7个居群亲缘关系较近,在遗传距离2.290 0处,7个居群可分为4大类,其中居群2与居群7的遗传距离最大,为3.966 2,居群4与居群5之间的遗传距离最小,为1.932 9。[结论]该研究结果为茶树优异种质资源的收集保存、良种选育及开发利用提供了参考。

关键词： 野生大茶树 叶片 表型性状 多样性

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四川地区茶树种质资源叶表型性状多样性分析

张厅; 黄梅; 唐晓波; 王迎春; 刘飞; 李春华; 王云; 《中国农学通报 》 2018

摘要：为揭示不同类型茶树种质资源叶片表型性状遗传变异,提高川西茶区优异茶树资源的利用率,以来自川西地区的114份茶树种质资源为研究对象,对其成熟叶、新梢芽叶等19个主要表型性状进行统计分析。结果表明,9个数值型性状的变异系数介于10.09%~23.4%之间,平均值为16.2%;多样性指数在1.39~2.04之间,平均值为1.86。10个描述型性状中有7个性状在各描述级别中均有分布,表现出不同的遗传分化,其余3个性状仅分布在部分描述级别中,多样性指数在0.66~1.31之间。基于9个数值型性状,可将参试的114份茶树种质资源分成6个类群,其中85%的茶树种质聚在了第Ⅲ大类。选取叶长、叶宽、1芽2叶长、1芽2叶百芽重4个数值型性状,以类群III为参照,比较各类群间的差异。

关键词： 茶树 种质资源 叶片 表型性状 多样性

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利用de novo测序分析蚕豆瓣酱醅微生物多样性

周评平; 李治华; 董玲; 赵驰; 朱永清; 《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：【目的】分析蚕豆瓣醅微生物多样性并比较与过去采用16S、ITS等扩增子测序的差异。【方法】利用de novo测序方法研究微生物菌群多样性。【结果】嗜盐四联球菌(Tetragenococcus halophilus)是蚕豆瓣酱醅的优势微生物,相对丰度占一半以上(m OTUs方法为64.26%,Metaphlan2方法为50.80%),Metaphlan2方法发现破布子乳酸菌(Lactobacillus pobuzihii)也是优势菌株,其相对丰度为17.60%,另外,存在大量未分离到的微生物有待进一步研究。【结论】该方法能分析到蚕豆瓣醅微生物中种或菌株的水平,研究结果不仅为后续深入研究提供了技术支撑,而且对郫县豆瓣的微生物安全性评价提供了有效的方法。

关键词： de novo测序 蚕豆瓣酱醅 微生物 多样性

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基于PCR-DGGE分析不同品牌郫县豆瓣酱真菌多样性

李治华; 李华佳; 王雪涛; 董玲; 黄巧莲; 《食品科学 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：以不同品牌的郫县豆瓣酱为研究对象,通过聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳免培养技术分析样品中微生物真菌菌群结构,并对典型条带进行测序,构建系统发育进化树。结果表明:郫县豆瓣酱真菌菌群种类较丰富,不同品牌的郫县豆瓣酱真菌菌群既包含共有菌群又存在一定差异。假丝酵母(Candida sp.)、曲霉(Aspergillus)、鲁氏酵母(Zygosaccharomyces rouxii)、奥默柯达酵母菌(Kodamaea ohmeri)是优势种群,尤其是黄曲霉(Aspergillus flavus)共有10个条带,占整个测序条带32.25%,表明郫县豆瓣酱的生产应特别注意防控黄曲霉。

关键词： 郫县豆瓣 真菌 聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳 多样性

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红地球葡萄健康叶片内生细菌多样性分析

李燕; 刘晓; 龚林忠; 孙其宝; 王琦; 《植物病理学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：本研究利用平板分离方法和变性凝胶梯度电泳(DGGE)技术,分析了北京、成都、合肥、武汉等4个地区的红地球葡萄在开花期、成熟期和衰老期健康叶片中内生细菌的群落结构。平板分离培养结果表明不同地区葡萄叶片中的内生细菌数量在8.0×10~3~2.8×10~4CFU·g~(-1)之间,其中武汉地区最高;不同生长时期葡萄叶片中的内生细菌数量在0.8×10~3~1.5×10~4CFU·g~(-1)之间,其中成熟期数量最大。扩增16S rRNA基因序列鉴定,分离获得的内生细菌属于芽胞杆菌属、泛菌属、短小杆菌属、假单胞菌属和葡萄球菌属,芽胞杆菌属为常见菌群。DGGE分析结果显示,同一地区和同一生长时期的样品间相似性较高;不同地区以成都地区的内生细菌种类最丰富;不同生长时期以成熟期种类最多。对特征条带回收测序,结果显示不可培养细菌和未确认的海洋浮游细菌在葡萄叶片中大量存在。

关键词： 葡萄 叶片 内生细菌 DGGE 多样性

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不同产区青稞根部可培养内生固氮菌的多样性研究

岳筱; 王波; 薛蓓; 王强锋; 《麦类作物学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：为认识青稞内生固氮菌群落组成,丰富内生固氮菌资源,明确产地对青稞内生固氮菌多样性的影响,本研究利用纯培养技术分别对在拉萨、林芝、日喀则栽培的藏青2000根部内生固氮菌进行分离、纯化,并测定各菌株的固氮酶活性及高固氮酶活性菌株的溶磷、溶钾及产IAA特性,最后,通过16SrDNA基因测序和构建系统发育树研究了高固氮酶活性菌株的分类学地位。结果显示,通过Ashby培养基分离、纯化得到内生固氮菌37株,其中,具有高固氮酶活性的11株,占总分离菌株27%,有6株菌株具有分泌IAA的能力,2株具有溶钾能力,1株具有溶磷能力。16S rDNA测序结果表明,11株高固氮酶活性的菌中,有5株菌属于Bacillus,为优势菌属,其余菌株分别属于Gemmatimonas、Sphingomonas、Devosia、Agrobacterium、Mesorhizobium和Burkholderia。

关键词： 青稞 根 内生固氮菌 多样性

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川楝内生放线菌多样性及抗菌活性筛选

廖萍; 赵翀; 张瀚能; 刘茂柯; Petri Penttinen; 张小平; 赵珂; 《微生物学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：【目的】探究药用植物川楝内生放线菌多样性,从中挖掘出新的放线菌菌株,发现新的潜在农业生防和医药先导化合物。【方法】从四川境内的资阳、遂宁以及重庆万州采集川楝的根、茎、叶、果、皮,采用纯培养方法,用4种培养基共分离获得148株放线菌。通过形态学观察筛选出60株放线菌进行RFLP分析,选出代表菌株进行16S r RNA基因序列分析。以3株细菌和6株病原真菌作为指示菌株,检测初筛出的60株菌株的抗菌活性以及聚酮合酶(PKSⅠ、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和卤化酶(Halo)基因。【结果】基于16S r RNA-RFLP分析,60株放线菌被分成10簇,筛选出25株代表菌株分别属于7个属,包括Streptomyces、Micromonospora、Planotetraspora、Streptosporangium、Nocardiopsis、Prauseria、Microbispora,其中链霉菌占73.3%。供试的川楝内生放线菌对细菌、真菌有不同程度的抗菌活性;其中含有4类化合物合成基因的菌株占10%-55%。【结论】药用植物川楝内生放线菌具有丰富的多样性,且不同地区不同部位川楝组织中放线菌的种群存在差异;分离菌株广谱的抗菌活性证明,川楝内生放线菌在次生代谢产物合成方面具有巨大潜力,这为进一步的药物开发提供了丰富的菌种资源。

关键词： 川楝 内生放线菌 多样性 抗菌活性

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土壤微生物多样性的研究方法

李睿玉; 杨红; 马丹炜; 全津莹; 雷波; 《山西农业科学 》 2016

摘要：对土壤微生物多样性的研究方法进行了综述。其中,微生物平板记数法仅能简单反映样品中微生物的类型和数量;从生化方面研究微生物多样性的方法主要包括基于底物利用率的代谢图谱以及磷脂脂肪酸生物标记法;土壤微生物在基因水平上的多样性可以用PCR-DGGE和PCR-TGGE技术、单链构象多态性分析(SSCP)、限制性片段长度多态性(RFLP)和末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)等进行研究。荧光原位杂交可通过寡核苷酸探针和全细胞杂交进行原位鉴定和计算单个微生物细胞。目前,基因芯片技术已在微生物检测和群落分析中获得了很大关注,而高通量测序技术使得对土壤微生物转录组和基因组进行全面分析成为可能。

关键词： 土壤微生物 多样性 研究进展

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采收期松茸菌塘土壤理化特性及对细菌多样性的影响

李强; 金鑫; 陈诚; 熊川; 戢林; 李廷轩; 郑林用; 《微生物学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：【目的】探讨四川松茸菌塘土壤理化因素对细菌多样性的影响。【方法】应用DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分析和比较四川省小金、雅江、木里、盐源及盐边县松茸主产区的松茸菌塘土壤与对照土壤在松茸采收期的细菌多样性,并结合不同样品土壤理化因子的差异,采用主成分分析(PCA)和多元回归树分析(MRT)方法研究土壤理化因子对细菌多样性的影响。【结果】不同样品土壤理化性质之间差异明显,菌塘土壤的总体肥力水平明显高于非菌塘土壤;不同县域之间土壤微生物多样性指数有着明显差异,且同一地区内的对照土壤微生物多样性指数与菌塘土壤之间并没有相关性;MRT结果表明,当有效铜含量为0.296 7 mg/kg≤Cu<0.651 7 mg/kg时,有机质在此限量内(136.5 g/kg≤OM≤257.1 g/kg)含量越大、速效氮在该范围内(151.2 mg/kg≤AN≤277.0 mg/kg)含量越高,松茸菌塘土壤细菌多样性越大;而当Cu≥0.651 7 mg/kg时,p H在该范围内(4.800

多样性越大。【结论】有效铜、有机质、p H、速效氮、交换性钙及速效钾6个因子对菌塘土壤细菌多样性影响最大。

关键词： 土壤理化因素 松茸 细菌 多样性 多元回归树

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