基于叶形态学的枇杷小种子植株遗传多样性研究

谢红江; 杨文渊; 王永清; 潘翠萍; 涂美艳; 李靖; 张耀勋; 《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：从小种子育种途径出发,以79份大五星小种子再生植株为试材,通过测量各份单株植株的13个叶形态特征值,对其遗传多样性进行了研究。结果表明,退化种子植株在叶形态上具有较丰富的遗传多样性(D=0.785),其中叶长(D=0.991),叶宽(D=0.994),叶柄长(D=0.982),叶柄宽(D=0.995),叶片厚度(D=0.987)等多样性指数居于前列,表现出最高的遗传多样性水平,各个特征变异幅度很大,变异系数在9.84%~40.09%;UPGMA法将79份材料分为了6大类群,各个类群间叶表型各异且丰富;第Ⅰ类和第Ⅵ类表现最为特殊,明显区别于母本大五星。其中Ⅰ类表型为:叶片大型、叶柄粗长、叶色浓绿、质地厚实、坚硬。Ⅵ类表现为叶片细小、叶柄细长、叶色黄绿、质地偏薄软,为枇把优良种质选育和核心种质构建的重要类群。鉴于退化种子植株在叶形态上呈现出丰富的遗传多样性,且少数植株表现显著特殊,因此退化种子途径可作为一个新思路进行枇杷新品种新品系选育,为小种子途径开拓种质资源提供了重要的形态学依据。

关键词： 枇杷 退化种子植株 性状 叶形态 多样性

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川楝内生放线菌多样性及抗菌活性筛选

廖萍; 赵翀; 张瀚能; 刘茂柯; Petri Penttinen; 张小平; 赵珂; 《微生物学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：【目的】探究药用植物川楝内生放线菌多样性,从中挖掘出新的放线菌菌株,发现新的潜在农业生防和医药先导化合物。【方法】从四川境内的资阳、遂宁以及重庆万州采集川楝的根、茎、叶、果、皮,采用纯培养方法,用4种培养基共分离获得148株放线菌。通过形态学观察筛选出60株放线菌进行RFLP分析,选出代表菌株进行16S r RNA基因序列分析。以3株细菌和6株病原真菌作为指示菌株,检测初筛出的60株菌株的抗菌活性以及聚酮合酶(PKSⅠ、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和卤化酶(Halo)基因。【结果】基于16S r RNA-RFLP分析,60株放线菌被分成10簇,筛选出25株代表菌株分别属于7个属,包括Streptomyces、Micromonospora、Planotetraspora、Streptosporangium、Nocardiopsis、Prauseria、Microbispora,其中链霉菌占73.3%。供试的川楝内生放线菌对细菌、真菌有不同程度的抗菌活性;其中含有4类化合物合成基因的菌株占10%-55%。【结论】药用植物川楝内生放线菌具有丰富的多样性,且不同地区不同部位川楝组织中放线菌的种群存在差异;分离菌株广谱的抗菌活性证明,川楝内生放线菌在次生代谢产物合成方面具有巨大潜力,这为进一步的药物开发提供了丰富的菌种资源。

关键词： 川楝 内生放线菌 多样性 抗菌活性

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土壤微生物多样性的研究方法

李睿玉; 杨红; 马丹炜; 全津莹; 雷波; 《山西农业科学 》 2016

摘要：对土壤微生物多样性的研究方法进行了综述。其中,微生物平板记数法仅能简单反映样品中微生物的类型和数量;从生化方面研究微生物多样性的方法主要包括基于底物利用率的代谢图谱以及磷脂脂肪酸生物标记法;土壤微生物在基因水平上的多样性可以用PCR-DGGE和PCR-TGGE技术、单链构象多态性分析(SSCP)、限制性片段长度多态性(RFLP)和末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)等进行研究。荧光原位杂交可通过寡核苷酸探针和全细胞杂交进行原位鉴定和计算单个微生物细胞。目前,基因芯片技术已在微生物检测和群落分析中获得了很大关注,而高通量测序技术使得对土壤微生物转录组和基因组进行全面分析成为可能。

关键词： 土壤微生物 多样性 研究进展

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采收期松茸菌塘土壤理化特性及对细菌多样性的影响

李强; 金鑫; 陈诚; 熊川; 戢林; 李廷轩; 郑林用; 《微生物学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：【目的】探讨四川松茸菌塘土壤理化因素对细菌多样性的影响。【方法】应用DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分析和比较四川省小金、雅江、木里、盐源及盐边县松茸主产区的松茸菌塘土壤与对照土壤在松茸采收期的细菌多样性,并结合不同样品土壤理化因子的差异,采用主成分分析(PCA)和多元回归树分析(MRT)方法研究土壤理化因子对细菌多样性的影响。【结果】不同样品土壤理化性质之间差异明显,菌塘土壤的总体肥力水平明显高于非菌塘土壤;不同县域之间土壤微生物多样性指数有着明显差异,且同一地区内的对照土壤微生物多样性指数与菌塘土壤之间并没有相关性;MRT结果表明,当有效铜含量为0.296 7 mg/kg≤Cu<0.651 7 mg/kg时,有机质在此限量内(136.5 g/kg≤OM≤257.1 g/kg)含量越大、速效氮在该范围内(151.2 mg/kg≤AN≤277.0 mg/kg)含量越高,松茸菌塘土壤细菌多样性越大;而当Cu≥0.651 7 mg/kg时,p H在该范围内(4.800

多样性越大。【结论】有效铜、有机质、p H、速效氮、交换性钙及速效钾6个因子对菌塘土壤细菌多样性影响最大。

关键词： 土壤理化因素 松茸 细菌 多样性 多元回归树

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野生翘鳞肉齿菌子实体内生菌多样性

李树红; 李小林; 陈诚; 黄文丽; 《应用与环境生物学报 》 2015 北大核心 CSCD

摘要：为了解翘鳞肉齿菌[Sarcodon imbricatus(L.ex Fr.)Karst.]子实体内生菌的多样性,以西藏、吉林的新鲜野生翘鳞肉齿菌子实体为材料,采用可培养方法分离并鉴定其中的内生细菌与真菌.共从中分离出52株细菌、26株真菌.鉴定结果显示,所有内生细菌分别隶属于变形菌门(Proteobacteria)及厚壁菌门(Firmicutes),变形菌门占96.2%,处绝对优势.其中伯克氏菌属(Burkholderia)最多,占40.4%,假单胞菌属(Pseudomonas)次之,占23.1%.26株真菌共分为14个属,Phaeomoniella最多,占26.9%,隐球菌属(Cryptococcus)其次,占11.5%.从菌柄及菌盖中分离的细菌、真菌种类及数量均有差异.本研究分离的这些菌株具有很大的潜在利用价值,可为筛选具有特殊功效的菌株提供新的材料来源,同时也可为探索外生菌根菌与共生植物之间的物质交换与菌根合成打下基础.图2表1参30

关键词： 翘鳞肉齿菌 虎掌菌 子实体 内生菌 多样性 外生菌根

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镍矿区紫茎泽兰根际及内生细菌多样性研究

赵珂; 李小林; 张波; 辜运富; 郑林用; 张小平; 《四川大学学报(自然科学版) 》 2015 北大核心 CSCD

摘要：利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术对四川省攀枝花市镍矿区紫茎泽兰根际及不同器官中内生细菌多样性进行分析.结果表明,紫茎泽兰根际与不同器官内生细菌多样性存在明显差异,香农-威纳指数(H)、丰度(S)及均匀度(EH)皆表现为根际土>叶>茎>根.土壤重金属含量与内生细菌多样性相关性分析表明,样品的丰度(S)与Zn含量呈显著正相关(P<0.05).典型对应分析(cononical correspondence analysis,CCA)显示,根际土细菌多样性受Zn、Cd、Pb、Ni等重金属负向影响;紫茎泽兰叶内生细菌多样性与土壤Cu元素浓度呈负相关关系.DGGE条带回收测序结果显示,根际及内生细菌主要为变形菌门(Proteobacteria)、异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、放线菌门(Actinobacteria)及部分不可培养的细菌.

关键词： 镍矿区 紫茎泽兰 细菌 多样性 DGGE

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烟草土壤真菌群落结构和多样性及环境因子对其影响

李昕竺; 袁红梅; 张宗锦; 刘松青; 郑林用; 张小平; 《四川师范大学学报(自然科学版) 》 2015 北大核心 CSCD

摘要：以盐边县代表性烟草种植区域的成熟期烟草根际及非根际土壤为研究对象,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析了真菌(18S基因)群落结构和多样性,结合之前研究所得土壤理化性质,应用多元回归树分析研究了土壤环境因子对真菌多样性的影响.免培养真菌群落结构和多样性的分析结果表明,系统的根际效应在成熟期烟草中没有体现.条带克隆测序结果表明,成熟期烟草根际和非根际免培养真菌优势种群差异显著,其中,以EF6-1为代表的不可培养真菌为非根际土壤中的特异真菌;以EF7-1为代表的不可培养真菌为根际土壤中的特异真菌.同时烟草成熟期根际土壤中优势免培养真菌为角担菌科(Ceratobasidiaceae)、伞菌纲(Agaricomycetes)、散囊菌纲(Eurotiomycetes)、马拉色菌属(Malassezia)、球囊霉属(Glomus)及部分不可培养真菌;而角担菌科(Ceratobasidiaceae)、伞菌纲(Agaricomycetes)及部分不可培养真菌为烟草成熟期非根际优势真菌.多元回归树分析结果表明,土壤环境因子中速效钾含量对真菌群落结构及多样性影响最大.

关键词： 成熟期 群落结构 多样性 多元回归树 变性梯度凝胶电泳

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四川冬菜及发酵液中产酸菌的多样性和群落结构

尹曦; 李小林; 敖晓琳; 张小平; 蒲彪; 《食品与发酵工业 》 2013 北大核心 CSCD

摘要：采用6种培养基对四川冬菜和发酵液中的产酸菌进行分离纯化,挑选出37株作为供试菌株。通过对37株菌株发酵产酸能力的测定、乳酸定性分析以及16S rDNA RCP-RFLP分析结果,最终选择17株菌株进行测序,并构建系统发育树。实验结果表明,所有供试菌株均有一定的产酸能力,其中大部分菌株产酸能力较好,且70%的菌株发酵过程中会产生乳酸。冬菜和发酵液中的产酸菌具有一定的多样性,主要为乳酸菌中的戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)和肠球菌(Enterococcus)及普通细菌葡萄球菌(Staphylococcus)。另外,腌制时间对冬菜和发酵液中产酸菌的菌相组成影响很大,在腌制4年的冬菜(H)中还检测出与致病性溶血性葡萄球菌相似性很高的菌株,说明腌制时间过长的冬菜其品质难以保证。

关键词： 冬菜 发酵液 产酸菌 多样性 16S rDNA PCR-RFLP

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泸州老窖不同窖龄窖泥中乳酸菌多样性PCR-DGGE分析

陈强; 唐玉明; 吴英英; 任道群; 陈翠平; 《应用与环境生物学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要：乳酸菌是窖泥中的重要功能菌群,参与了浓香型白酒风味形成,因而探明窖泥中乳酸菌的种群特征,对于提高白酒品质具有重要意义.采用PCR-DGGE技术对泸州老窖不同窖龄窖泥乳酸菌种群进行了分析.结果显示,根据DGGE图谱条带情况,不同窖泥样品中乳酸菌多样性差异明显;多样性指数分析结果表明,样品的Patrick丰富度指数R介于14-19,Shannon-Wiener指数H值介于2.634 5-2.888 9之间,Simpson指数C值介于0.055 7-0.071 9.根据图谱选取16条DGGE条带进行序列分析,它们分属于Lactobacillus(乳杆菌属)、Pediococcus(片球菌属)、Weissella(魏斯氏菌属)、Enterococcus(肠球菌属)、Exiguobacterium(微小杆菌属)、Bacillus(杆菌属)、Rummeliibacillus属以及Cohnella属,其中Lactobacillus(乳杆菌属)为优势菌属,L.acetotolerans(耐酸乳杆菌)为窖泥中乳酸菌的优势种群.图5表2参24

关键词： 窖泥 PCR-DGGE 泸型酒 乳酸菌 多样性

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花苜蓿内生放线菌多样性及群落结构

李小林; 江华明; 张小平; 《草业学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要：为了了解药用植物花苜蓿内生放线菌的多样性和群落结构,将采自四川省甘孜地区的药用植物花苜蓿进行严格的表面消毒灭菌后,运用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术对其根茎叶花等样品的内生放线菌进行分析。结果表明,花苜蓿不同组织中内生放线菌多样性和群落结构存在明显差异。其内生放线菌的多样性指数(H)和丰富度(S)均是花>根>茎>叶,而均匀度(EH)则是叶>根>茎>花。不同组织样品之间的放线菌群落结构相似性差异明显,其中茎与叶的相似性最高,根与叶之间相似性最低,其他组织之间相似性均很低。DGGE条带回收测序结果显示,大部分克隆条带属于链霉菌属(Streptomyces),但仍有超过43%的条带属于稀有放线菌,且主条带A23和共有条带A12属于稀有放线菌,说明部分稀有放线菌在花苜蓿样品内是优势放线菌。该研究表明了花苜蓿根茎叶花组织的内生放线菌存在丰富的多样性,且不同组织内生放线菌多样性存在明显差异,其中花组织多样性最丰富。说明甘孜地区的药用植物花苜蓿可作为一种较理想的分离内生放线菌的植物资源。

关键词： 花苜蓿 放线菌 多样性 群落结构 DGGE

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