科研产出
黄颡鱼生长相关SSRS多态性与性状关联分析
《水产学杂志 》 2025
摘要：本研究选取黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）生长激素（growth hormone,gh）基因微卫星位点gh-GA和生长性状QTL定位点区域内微卫星pfu11克隆序列pfu11-CA位点，分析同一批次繁殖的12月龄、体质量1 g左右的300尾黄颡鱼的遗传多样性和主要生长性状的关联情况。结果表明，位点gh-GA在267尾样本中检测到的等位基因数（Na）为6，观测杂合度（H_o）为0.801，期望杂合度（He）为0.749，多态信息含量（PIC）为0.708；位点pfu11-CA共有292尾样本获得分型结果，Na为5,H_o为0.592,He为0.623,PIC为0.548。这两个位点均为高度多态，符合哈代温伯格平衡，不存在连锁不平衡现象。性状关联分析结果表明，gh-GA位点DE基因型的全长显著高于DF和CE基因型，DE基因型的体长显著高于AF、DF和CE基因型。pfu11-CA位点BC基因型的全长和体长均极显著高于DE基因型，AC和BC基因型的全长和体长均显著高于AE和DE,AC和BC基因型的体质量均显著高于DE。gh-GA位点的DE基因型，以及pfu11-CA位点的AC和BC基因型为优势基因型，这两个位点可作为生长性状的候选位点。本研究可为开展黄颡鱼生长相关遗传标记研究提供可靠的分子遗传学工具。
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黄颡鱼养殖群体遗传多样性与遗传结构的微卫星分析
《淡水渔业 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(Fst=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(Fst=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
关键词： 黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco） 养殖群体 微卫星标记 遗传多样性
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基于微卫星标记的不同地区乌鳢和白化乌鳢群体遗传多样性研究
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]为了解7个不同地理位置的4个乌鳢(Channa argus)群体和3个白化乌鳢育成群体的群体遗传多样性和遗传分化特点.[方法]采用20对微卫星引物对4个乌鳢群体和3个白化乌鳢育成群体,共计350尾个体的微卫星位点进行了分型检测,分析了所有微卫星标记的多态性及遗传多样性信息,并分析了群体间遗传分化特点.[结果]所有20对微卫星引物共检测出356个等位基因,等位基因数(Na)介于4~40个,每个位点平均有17.8个等位基因.观测杂合度(Ho)介于0.000~0.791,平均值为0.578;期望杂合度(He)介于0.31~0.91,平均值为0.732;多态信息含量(PIC)介于0.271~0.901,平均值为0.700,且所有乌鳢群体的Na、Ho、He、PIC均高于白化乌鳢群体.7个群体的遗传分化指数(FST)在0.07 876~0.40 303,所有群体间的遗传分化均达显著水平(P<0.05).将4个乌鳢群体和3个白化乌鳢群体分为两组进行分子方差分析(AMOVA),发现这几个群体的遗传变异主要来源于个体内,占遗传变异来源总量的69.65%.而UPGMA系统发育树聚类结果显示4个乌鳢群体和3个白化乌鳢群体分别被聚类到了 2个独立分支上.[结论]本研究的3个白化乌鳢群体的遗传多样性均相对低于4个乌鳢,在繁育过程中应加强白化乌鳢遗传多样性保护,尽量避免近亲交配,本研究为乌鳢和白化乌鳢的遗传资源保护及综合利用提供理论依据.
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达氏鲟微卫星标记的开发及性别相关位点的筛选
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】由于达氏鲟缺乏第2性征,外部特征不足以判定其性别,所以通过筛选性别特异性的分子标记来进行性别鉴定将对达氏鲟养殖有着重要的意义。【方法】本研究从达氏鲟高通量测序获得的转录组数据库中,开发多态性的微卫星位点,并结合已报道的达氏鲟微卫星来进行性别相关位点的分析。【结果】根据转录组数据开发了15个具有多态性的微卫星位点,期望杂合度和Shannon-Wiener多样性指数分别在0.3831～0.8607和0.6541～1.9663。利用该15个微卫星位点和已报道的91个达氏鲟或鲟鱼通用的微卫星标记,在96尾(48♀,48♂)性成熟的达氏鲟个体中进行扩增并测序分型,结果显示1个位点ADX21的2个等位基因ADX21-144bp和ADX21-151 bp在雌雄个体间出现的频率差异达到了60%,分别为雄性优势条带和雌性优势条带,推测该位点可能与性别存在一定关联。【结论】本研究使用目前为止鲟鱼中使用数量最多的微卫星标记来进行大样本量的雌雄差异分析,为今后鲟鱼性别连锁标记的开发奠定了基础。
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利用SSR标记筛选DUS测试中甘蓝型油菜近似品种
《分子植物育种 》 2013 CSCD
摘要：随着分子标记技术的迅速发展,将分子标记运用于辅助植物新品种保护中的特异性、一致性和稳定性(distinctness,uniformity,stability,DUS)测试成为热门话题。为了探讨SSR标记用于甘蓝型油菜近似品种筛选的可行性,本研究以26份自交系和54份2008-2009、2009-2010和2010-2011年DUS测试品种为研究材料,从952对SSR引物中筛选出49对多态性丰富、带型清晰、易以统计的核心引物。49对引物共检测到57个位点311个等位变异,每个位点包含等位变异数变幅为2～13个,平均5.5个,平均多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.53。聚类结果表明,在遗传相似系数为0.93时,该套核心引物可将所有参试品种区分开,同一育种单位或地区的品种优先聚为一起,聚类结果与品种系谱基本吻合。说明SSR标记可用于DUS测试中甘蓝型油菜近似品种筛选。
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两系杂交小麦恢复系MR168抗条锈病基因遗传分析及分子标记定位
《遗传 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：小麦条锈病是影响杂交小麦普及推广的重要因素。文章利用基因推导法和SSR分子标记技术,研究了温光型两系杂交小麦恢复系MR168的抗条锈性遗传规律及其控制基因染色体位置。结果表明,MR168对CY29、CY31、CY32、CY33等条锈菌生理小种表现高抗至免疫;对SY95-71/MR168杂交组合的正反交F1、BC1、F2和F3群体分单株接种鉴定显示,MR168对CY32号小种的抗性受1对显性核基因控制,该抗病基因来源于春小麦品种辽春10号。利用集群分离分析法(Bulked segregant analysis,BSA)和简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记分析抗病亲本MR168、感病亲本SY95-71及183个F2代单株,发现了与MR168抗条锈病基因连锁的5个微卫星标记Xgwm273、Xgwm18、Xbarc187、Xwmc269、Xwmc406,并将该基因初步定位在1BS着丝粒附近,暂命名为YrMR168;构建了包含YrMR168的SSR标记遗传图谱,距离YrMR168最近的两个微卫星位点是Xgwm18和Xbarc187,遗传距离分别为1.9 cM和2.4 cM,这两个微卫星标记可用于杂交小麦抗条锈病分子标记辅助育种。
关键词： 杂交小麦 恢复系 抗条锈病基因 基因推导 遗传分析 微卫星标记
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人工合成六倍体小麦后代衍生群体Waxy蛋白亚基的分子标记
《中国农学通报 》 2008 北大核心
摘要：四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成六倍体小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。以引自CIMMYT的Syn768、Syn769和Syn780人工合成六倍体小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2:6后代群体中选育的113份优良高代系为材料,采用SSR特异引物的PAGE凝胶电泳对其Waxy蛋白亚基缺失类型进行了研究。结果表明,在所检测的121份材料中,8份材料缺失Waxy-B1型蛋白亚基,占全部材料的6.6%;没有检测到其他类型的缺失体。从每个人工合成六倍体小麦亲本材料所形成的后代衍生群体来看,Waxy-B1缺失体频率各不相同,说明Waxy蛋白亚基缺失类型在人工合成六倍体小麦后代衍生群体材料中的表现存在着随机性,与亲本的基因型状况关系极大。通过研究人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代的Waxy蛋白亚基缺失类型,有助于提高分子标记育种效率。
关键词： 人工合成六倍体小麦 Waxy蛋白亚基 分子标记辅助育种 微卫星标记
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实心小麦86-741茎秆的解剖分析及壁厚特性的SSR标记
《作物学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：以实心小麦86-741、新疆稻麦及其杂种F1为材料,利用石蜡切片和SSR标记方法对86-741的实心特性进行了分析。结果表明,实心小麦86-741茎内仅有极小髓腔,髓腔中有髓,机械组织中有维管束的分布;杂种F1偏向实心亲本86-741,有髓腔,但髓腔的直径小于新疆稻麦,机械组织所占的比例小于亲本86-741;86-741维管束数最多,F1代其次,新疆稻麦最少。遗传分析与SSR标记结果表明,86-741髓的有无是由双隐性基因控制的;而其壁厚性状由位于3BL染色体上的单显性基因控制,与SSR标记Xgwm-547的遗传距离为5.3cM。暂将该壁厚基因定名为Cwt-1。Xgwm-547可用于辅助转育壁厚特性,提高小麦品种的抗倒伏能力。
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人工合成六倍体小麦后代衍生群体Waxy蛋白亚基的分子标记
《西南农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成六倍体小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。以引自CIMMYT的Syn768、Syn769和Syn780人工合成六倍体小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2∶6后代群体中选育的113份优良高代系为材料,采用SSR特异引物的PAGE凝胶电泳对其Waxy蛋白亚基缺失类型进行了研究。结果表明,在所检测的121份材料中,8份材料缺失Waxy-B1型蛋白亚基,占全部材料的6.6%;没有检测到其他类型的缺失体。从每个人工合成六倍体小麦亲本材料所形成的后代衍生群体来看,Waxy-B1缺失体频率各不相同,说明Waxy蛋白亚基缺失类型在人工合成六倍体小麦后代衍生群体材料中的表现存在着随机性,与亲本的基因型状况关系极大。通过研究人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代的Waxy蛋白亚基缺失类型,有助于提高分子标记育种效率。
关键词： 人工合成六倍体小麦 Waxy蛋白亚基 分子标记辅助育种 微卫星标记
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