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资源类型: 中文期刊
关键词:代谢组(模糊匹配)
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小麦品种对浓香型大曲品质、微生物群落及代谢产物的影响

《食品科学 》 2025 EI 北大核心 CSCD

摘要:本研究采用理化分析、感官评价、扩增子测序和非靶向代谢组技术,对12个小麦新品种的品质性状、制曲品质、大曲中细菌和真菌微生物群落结构以及代谢特征进行分析。品质性状分析结果表明低籽粒硬度、蛋白质含量、湿面筋含量的小麦品种更适宜于生产优质大曲。扩增子分析发现各小麦品种所制大曲中的优势细菌为明串珠菌属(Leuconostoc)、泛菌属(Pantoea)、高温放线菌属(Thermoactinomyces)、乳球菌属(Lactococcus)和糖多孢菌属(Saccharopolyspora),优势真菌则为嗜热青霉属(Thermomyces)、嗜热子囊菌属(Thermoascus)、曲霉属(Aspergillus)、扣囊复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)和毛孢子菌属(Trichosporon)。相关性分析发现嗜热青霉属、扣囊复膜孢酵母属、科萨克氏菌属(Kosakonia)、根霉属(Rhizopus)和根黏孢霉属(Rhizomucor)与部分大曲感官品质指标均呈显著正相关(P<0.05),而明串珠菌属则与部分大曲感官品质指标呈显著负相关(P<0.05),表明真菌对大曲品质可能具有更大的贡献。代谢组分析发现木糖醇和甘油酸等代谢物不仅是影响大曲质量的关键组分,同时也是区分不同小麦品种所制大曲的潜在生物标志物。本研究揭示了优质制曲小麦的关键性指标参数,可为制曲专用小麦新品种选育和优质大曲发酵提供参考。

关键词: 小麦 品质性状 制曲 微生物群落结构 代谢组 多元统计分析

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转录组和代谢组联合分析揭示稻曲病菌的致病因子

《中国水稻科学 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:[目的]由稻曲病菌引起的稻曲病是一种世界性水稻真菌病害,该病严重威胁水稻的产量和品质.探明稻曲病菌的致病分子机制,可为制定稻曲病防治策略和抗病分子育种开辟新思路.[方法]用稻曲病菌接种水稻幼穗,采用转录组和代谢组测序技术对接种后9 d显症的样本(S)和未接种的PXD25菌丝(CK)进行代谢组和转录组测序,以稻曲病菌菌株UV-8b基因组作为参考基因组进行对比,利用FPKM法计算基因表达量,以|log2fold change|≥1且P≤0.05为条件筛选差异表达基因(DEG);以P≤0.05且VIP≥1为标准筛选差异代谢物(DAM).[结果]转录组测序分析表明,S vs.CK有6708个DEG,通过GO富集和KEGG代谢途经分析,将DEG划分为GO功能下的3708个词条、110条代谢途径;DEG中有91个转录因子,分属23个转录因子家族,包括bZIP、C6、C2H2等;分析显著富集代谢途径发现,线粒体自噬、次生代谢和氨基酸代谢等途径显著富集,基因表达量都发生显著变化,其中次生代谢途径中的差异表达基因都显著上调,推测这些基因在稻曲病菌致病中发挥重要作用.非靶代谢组共鉴定出392个差异代谢物(DAM),DAM分析发现丙氨酸、酪氨酸、组氨酸、蛋氨酸、半胱氨酸以及脂肪酸类物质(亚油酸、棕榈酸、月桂酸、肉豆蔻酸)等都显著积累.转录组和代谢组联合分析发现苯丙氨酸、酪氨酸、半胱氨酸和蛋氨酸等氨基酸代谢途径与淀粉和蔗糖等与糖代谢相关途径显著富集,表明这些代谢物和基因可能与稻曲病菌的致病性密切相关.[结论]线粒体自噬、次生代谢和氨基酸代谢等代谢途径中DEG在稻曲病菌致病中发挥重要作用,丙氨酸、酪氨酸、组氨酸、蛋氨酸、半胱氨酸以及脂肪酸类物质等代谢物与稻曲病菌的致病性密切相关.

关键词: 稻曲病菌 转录组 代谢组 差异表达基因 差异代谢物

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基于转录组和代谢组解析川芎对镉胁迫的响应机制

《中国农业科技导报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:为了解不同水平镉(Cd)胁迫下川芎基因表达和代谢产物的变化规律,探究川芎对Cd胁迫的响应机制,利用盆栽试验,以不添加Cd溶液的清洁土壤为对照,设置1、3、6、10 mg·kg-1共4个Cd胁迫处理水平,采用转录组学测序(RNA sequencing,RNA-seq)和超高效液相色谱质谱联用(ultra performance liquid chromatography tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)技术,筛选川芎抗Cd胁迫的关键基因与代谢通路。结果表明,共筛选到8 569个差异表达基因,包括上调基因6 859个,下调基因1 710个。与对照相比,4个Cd处理组的共有差异基因仅1个,为CML19,可能是川芎抗Cd胁迫的关键基因。代谢组共标注和定量了1 238种差异代谢物,在KEGG数据库中注释得到76条代谢通路,其中包括氨基酸代谢、氨酰基-tRNA的生物合成和脂肪酸的生物合成等。联合分析表明,当受到不同水平Cd胁迫时,川芎通过调节不同种类氨基酸来维持自身代谢平衡,在川芎抗Cd胁迫中发挥重要作用。研究结果为川芎抗Cd胁迫提供科学支撑与理论依据,为针对川芎资源的栽培育种及缓解Cd胁迫等相关研究提供基础。

关键词: 川芎 镉胁迫 转录组 代谢组

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基于UPLC-QTOF-MS代谢组学技术的黄苦荞和黑苦荞茶汤差异成分比较

《现代食品 》 2023

摘要:本研究以黄苦荞和黑苦荞茶汤为研究对象,采用UPLC-QTOF-MS代谢组学技术系统分析两者之间代谢成分的差异.结果显示,茶汤样品在正离子和负离子模式下分别鉴定得到139和103种物质.基于PLS-DA模型分析,发现黄苦荞和黑苦荞茶汤在代谢水平上存在显著差异,并通过VIP值筛选出两者之间的差异代谢物104个.此外,KEGG通路富集分析表明,这些差异代谢物富集在氨基酰-tRNA的生物合成,不饱和脂肪酸的生物合成,半乳糖代谢和木质素、亚木质素和蜡的生物合成等多条代谢通路上.本研究可为明晰黑苦荞和黄苦荞功能成分的差异提供参考.

关键词: 黑苦荞茶 黄苦荞茶 代谢组 KEGG富集分析

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转录组和代谢组在林木真菌病害防御反应中的应用研究进展

《世界林业研究 》 2022 北大核心 CSCD

摘要:真菌病害是林木的主要生物胁迫之一,严重影响林业生态安全和经济效益。近年来随着组学技术的突破,转录组技术和代谢组技术已成功应用于林木真菌病害研究,主要包括致病和抗病关键基因的挖掘、林木防御物质的动态合成、抗病分子育种等方面,但林木如何抵御真菌病害及其两者间的互作机制仍是今后研究的热点与难点。文中通过对林木遭受真菌侵染后的转录组信息和代谢组信息进行探讨,包括类黄酮物质合成途径、植物激素信号转导、林木防御关键基因和关键代谢物、关键防御机制及功能网络等,将在理论上丰富林木响应真菌病害侵染的过程,为林木和真菌病害的互作研究奠定基础,并为林木抗性育种和化学防治提供参考;此外,基于目前转录组和代谢组在林木真菌病害防御反应方面的研究,对林木基因组研究、多组学联合研究以及病原菌组学研究等进行展望,以期为林木真菌病害研究提供新思路。

关键词: 林木真菌病害 转录组 代谢组 防御反应

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