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基于转录组和代谢组解析川芎对镉胁迫的响应机制

文献类型: 中文期刊

作者: 徐皖菁 1 ; 彭芳 2 ; 赵豆豆 1 ; 罗姣姣 2 ; 陶珊 2 ; 廖海浪 2 ; 毛常清 2 ; 吴宇 2 ; 朱秀 3 ; 徐正君 4 ; 张超 2 ;

作者机构: 1.四川省农业科学院经济作物研究所

2.四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所

3.贵州师范大学

4.四川农业大学水稻研究所

关键词: 川芎;镉胁迫;转录组;代谢组

期刊名称: 中国农业科技导报

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2024 年 26 卷 010 期

页码: 98-109

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解不同水平镉(Cd)胁迫下川芎基因表达和代谢产物的变化规律,探究川芎对Cd胁迫的响应机制,利用盆栽试验,以不添加Cd溶液的清洁土壤为对照,设置1、3、6、10 mg·kg-1共4个Cd胁迫处理水平,采用转录组学测序(RNA sequencing,RNA-seq)和超高效液相色谱质谱联用(ultra performance liquid chromatography tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)技术,筛选川芎抗Cd胁迫的关键基因与代谢通路。结果表明,共筛选到8 569个差异表达基因,包括上调基因6 859个,下调基因1 710个。与对照相比,4个Cd处理组的共有差异基因仅1个,为CML19,可能是川芎抗Cd胁迫的关键基因。代谢组共标注和定量了1 238种差异代谢物,在KEGG数据库中注释得到76条代谢通路,其中包括氨基酸代谢、氨酰基-tRNA的生物合成和脂肪酸的生物合成等。联合分析表明,当受到不同水平Cd胁迫时,川芎通过调节不同种类氨基酸来维持自身代谢平衡,在川芎抗Cd胁迫中发挥重要作用。研究结果为川芎抗Cd胁迫提供科学支撑与理论依据,为针对川芎资源的栽培育种及缓解Cd胁迫等相关研究提供基础。

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