科研产出
营养生长期持续高温处理对玉米叶片转录组及生化指标的影响
《玉米科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以玉米杂交种郑单958和登海605为材料，通过转录组测序分析玉米营养生长期叶片受热胁迫后基因差异表达、基因功能富集和KEGG通路富集，使用微量法和HPLC法分析叶片中相关生化指标的变化。结果表明，高温胁迫会降低光合作用关键酶二磷酸核酮糖羧化酶（Rubisco）和三羧酸循环限速酶柠檬酸合酶（CS）的活力，升高丙二醛（MDA）、脱落酸（ABA）和赤霉素（GA3）的含量，降低水杨酸（SA）的含量。与常温对照比，玉米营养生长期叶片受热胁迫后，两个品种4个比较组合累计检测到16 996个差异表达的基因，共同差异表达的基因有1 160个。光合作用、细胞代谢、叶绿体膜和质体膜等相关基因的表达会响应热胁迫。
关键词： 玉米 高温胁迫 转录组 差异表达基因 富集分析 表型
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基于RNA高通量测序分析灰葡萄孢侵染垫形成相关基因
《植物病理学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：灰葡萄孢产生功能上类似附着胞的侵染垫来侵染寄主植物,但目前对于侵染垫形成的分子机制尚不明确。本文利用高通量测序技术对菌株CanBC-1(弱毒,不形成侵染垫)和CanBC-1c-66(强毒,正常形成侵染垫)进行了转录水平比较。结果表明:在菌株CanBC-1中共检测到2 333个差异表达基因(与菌株CanBC-1c-66相比较),其中1 425个基因表达上调,908个基因表达下调。对差异表达基因进行功能注释(GO)分析发现,在细胞组分(Cellular component)中细胞(Cell)和细胞部分(Cell part)这2个亚类所占比例较大,在分子功能(Molecular function)中结合活性(Binding)和催化活性(Catalytic)这2个亚类所占比例较大。这些结果暗示差异基因主要参与细胞、代谢和发育等生物学过程。筛选得到12个与真菌致病相关的基因,其中BC1G_03994和BC1G_01012与稻瘟病菌侵染相关的classⅡ疏水蛋白基因Mhp1同源。RT-PCR检测发现这2个基因在弱毒菌株CanBC-1中表达下调,同时该菌株疏水性降低,推测它们可能参与灰葡萄孢侵染垫形成。这些差异基因的获得为揭示灰葡萄孢侵染形成的分子机制奠定了基础。
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