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资源类型: 中文期刊
关键词:SSR(模糊匹配)
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沙田柚多倍体遗传差异的SSR分析

果树学报 2009 北大核心 CSCD

摘要:应用21对柑橘SSR引物对7份有沙田柚血缘的不同倍性材料进行了基因组的遗传差异分析。平均每对引物扩增出3个等位基因,每对引物可检测到的等位基因数目为2~5个不等,多态性带纹为62.5%。NTSYS软件进行相似系数计算,7份材料的相似性系数为0.763~0.892。UPGMA法聚类分析,在相似性系数为0.83处可划分为3类,即3株天然四倍体为第Ⅰ类;2株人工同源四倍体与1株天然三倍体为第Ⅱ类;二倍体母株为第Ⅲ类。天然三倍体与二倍体的遗传相似性较四倍体与二倍体的遗传相似性更高。4对引物(CAT01,TAA33,AG14 and TC26)可以区分天然四倍体与人工同源四倍体。与亲本二倍体母本相比,所试三倍体和四倍体均发生了DNA水平变异,表现为带纹缺失同时又增加了新的带纹。这些多倍体试材可为培育无核三倍体柑橘提供丰富变异的亲本材料。

关键词: 沙田柚 多倍体 SSR

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新型甘蓝型油菜核不育材料绵7AB-4-2农艺性状鉴定及分子检测

西南农业学报 2008 北大核心 CSCD

摘要:本实验对新型甘蓝型油菜核不育材料绵7AB-4-2与其姊妹系绵7AB-4-1进行农艺性状差异性及SSR引物上的多态性研究,并对绵7AB-4-2进行不育保持率及其与姊妹系绵7AB-4-1和其它不同来源不育材料进行测交和回交不育率进行研究,结果表明:绵7AB-4-2与其姊妹系7AB-4-1的农艺性状在0.05水平上差异不显著。绵7AB-4-2的可育株自交不育率可达60%以上,而姊妹系绵7AB-4-1的可育株自交不育率25%左右;与姊妹系绵7AB-4-1和其它9个不同来源的不育材料进行测交时,对同类型不育材料可保持不育率达90%以上,回交不育率在80%以上。绵7AB-4-2与姊妹系绵7AB-4-1在SSR引物a2、E10上存在条带上的差异。

关键词: 甘蓝型油菜 隐性核不育 可育株自交 测交 回交 SSR 多态性

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利用SSR分子标记技术揭示“硬粒小麦-节节麦”人工合成六倍体小麦的遗传差异

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:为引入小麦近缘属种的优良基因和遗传变异、扩宽普通小麦的遗传基础,本文选用36对小麦A,B和D基因组的微卫星引物,对135份人工合成六倍体小麦的遗传多样性进行了评价。36对引物共检测到193个等位变异,每个位点等位变异数在2~14个之间,平均每个位点检测到5.36个等位变异;A,B和D 3个基因组检测到的等位变异数D>A>B,遗传多样性指数D>A>B。综合平均遗传丰富度和香浓指数两个指标分析结果表明,人工合成六倍体小麦第1和6同源群遗传多样性水平较高,第4和7同源群遗传多样性水平较低;21条染色体中,6D和2D染色体的遗传多样性最高,7D和4B染色体的遗传多样性最低。135份人工合成六倍体小麦遗传相似系数在0.36~0.85之间,平均遗传相似系数A>B>D基因组。人工合成六倍体小麦变异类型丰富,是改良普通小麦的重要基因资源。

关键词: 人工合成六倍体小麦 遗传多样性 SSR

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穗重型小麦品种川麦42与穗数型品种川农16遗传差异的SSR标记分析

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:川麦42和川农16是四川省近年育成的两种不同类型高产小麦品种。本文选用250对微卫星(SSR)标记引物对两个品种在DNA分子水平上进行了遗传差异的研究。结果表明:250对引物均能扩出清晰地条带,其中129对引物的扩增产物存在多态性差异,占引物总数的51.6%;这为进一步利用川麦42 X川农16构建的重组自交系标记川麦42和川农16的一些重要基因奠定了基础。

关键词: 川农16 川麦42 SSR

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利用SSR标记分析“川育12”和人工合成小麦“SYN780”的遗传差异

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:四川育成品种“川育12”和CIMMYT硬粒小麦-节节麦人工合成种“SYN780”都具有优质小麦基因,本试验利用小麦A、B和D基因组上的229对引物对“川育12”和“SYN780”进行了SSR分子标记比较分析。结果表明,229个SSR标记位点中有140个位点“川育12”和“SYN780”存在多态性差异,占位点数的61.1%。这140个差异位点在A、B和D3个基因组的分布频率(占该基因组被检测位点数)不一致,其中B基因组分布最多,D基因组分布最少,其顺序为B(64.2%)>A(63.5%)>D(54.9%)。

关键词: SSR 人工合成小麦 遗传差异

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川W565的复小穗性状遗传分析

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:川W565是一个具有复小穗特性的普通小麦新材料,其复小穗特性遗传性状稳定,可用于超高产小麦育种。本试验选用人工合成小麦Syn83(普通小穗型)与复小穗小麦川W565杂交构建的F2群体,对复小穗性状进行了遗传分析,结果表明,川W565的复小穗性状是由1对隐性基因控制。同时利用SSR标记对复小穗性状进行了初步标记,为下一步复小穗基因的精细定位奠定了基础。

关键词: 普通小麦 复小穗 SSR

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甜瓜分子标记纯度鉴定研究

中国瓜菜 2006

摘要:以2个甜瓜品种西域雪1号、西域雪2号及其亲本为试材,建立并优化了单粒种子DNA快速提取法和适合甜瓜的RAPD、SSR分子标记杂交种纯度鉴定体系。从100条随机引物中筛选出G17用于西域雪2号纯度鉴定,可有效区分母本和杂交种。从19对SSR引物中筛选出9对稳定扩增、多态性丰富的引物构建西域雪1号、西域雪2号的SSR指纹图谱。SSR分子标记用较少引物即可扩增出品种特异性条带,且多数F1代带型呈双亲互补,非常适合种子纯度鉴定。同时,使用高浓度、非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,条带更清晰,可区分只相差1个碱基的扩增片段,同RAPD相比,SSR分子标记更适合甜瓜杂交种纯度快速鉴定。

关键词: SSR RAPD 指纹图谱 甜瓜杂交种 纯度鉴定

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SSR在鸭茅种质资源遗传多样性研究中的应用初探

西南农业学报 2006 CSCD

摘要:本文以鸭茅基因组DNA为模板,利用小麦SSR引物对鸭茅SSR反应体系中的一些重要参数进行摸索和优化实验,建立了一套鸭茅SSR分子标记的最优化反应体系,在15μl体系中,最终浓度或量:Mg2+为2.5 mm/L、dNTP为400μmol/L、Taq酶为1.0U、引物浓度为2.0~2.5μpmol/L、模板NDA量为60~80 ng。同时成功的筛选出20对能较好的应用于鸭茅种质资源遗传多样性研究的SSR引物,可用于鸭茅SSR标记的进一步研究。

关键词: 鸭茅 遗传多样性 SSR 应用

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利用SSR标记分析“川麦42”和“川麦43”的遗传差异

西南农业学报 2006 CSCD

摘要:“川麦42”和“川麦43”是源于CIMMYT硬粒小麦-节节麦人工合成种的姊妹系,具有高产、高抗条锈等特征。本实验利用小麦A、B、D基因组上的91对引物对“川麦42”和“川麦43”进行了SSR分子标记比较分析。结果表明,分析的91个SSR标记位点中有61个位点“川麦42”与“川麦43”多态性一致,占位点数的67.03%;有30个位点两个品种存在多态性差异,占位点数的32.97%;30个差异位点在A、B和D三个基因组的分布频率(占该基因组被检测位点数)不一致,其中A基因组分布最多,B基因组分布最少,其顺序为A>D>B。

关键词: 人工合成小麦 “川麦42” 硬粒小麦 节节麦 SSR

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杂交香稻亲本遗传距离与产量杂种优势的相关性研究

中国农业科学 2006 北大核心 CSCD

摘要:目的研究遗传距离与杂种优势的相关性,为杂交水稻育种提供依据。方法利用SSR标记检测R527等恢复系与泸香90A等不育系间的遗传距离,并分析遗传距离与产量杂种优势间的相关性。结果杂交香稻亲本间遗传距离与产量性状及其各构成因素杂种优势间的相关系数偏小(-0.257~0.292),均未达显著水平。结论所选用的杂交水稻亲本间的遗传距离大小并不能反映杂种优势;所选用的SSR标记不能预测水稻产量杂种优势,利用分子标记遗传距离来预测杂交水稻杂种优势的可靠性有待进一步探讨。

关键词: 香稻 杂种优势 SSR 遗传距离 相关性

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