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基于毛木耳CDS的福寿螺多功能纤维素酶基因密码子优化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王波 1 ; 李小林 1 ; 谭伟 1 ; 彭卫红 2 ;

作者机构： 1.;四川省农业科学院土壤肥料研究所;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室

2.;四川省农业科学院土壤肥料研究所;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室;

关键词： 福寿螺;毛木耳;密码子优化

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2017 年 08 期

页码： 1726-1731

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆福寿螺多功能纤维素酶基因(multi-functional cellulase gene,Mfc),进行密码子优化改造,便于后续毛木耳Mfc基因转导研究。【方法】采用Codon W软件分析福寿螺多功能纤维素酶基因Mfc及毛木耳转录本CDS密码子使用次数和同义密码子相对使用度差异,以毛木耳CDS密码子特征对福寿螺Mfc基因进行密码子优化。【结果】改造后的Mfcsg序列GC含量从原始Mfc序列的54.04%增加到58.16%,与毛木耳遗传背景一致。【结论】实验优化后获得的Mfcsg基因序列GC含量与毛木耳遗传背景一致,没有发夹结构、重复序列及反向重复序列,能够作为毛木耳外源基因转化应用。

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