基于毛木耳CDS的福寿螺多功能纤维素酶基因密码子优化分析

王波; 李小林; 谭伟; 彭卫红; 《西南农业学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：【目的】克隆福寿螺多功能纤维素酶基因(multi-functional cellulase gene,Mfc),进行密码子优化改造,便于后续毛木耳Mfc基因转导研究。【方法】采用Codon W软件分析福寿螺多功能纤维素酶基因Mfc及毛木耳转录本CDS密码子使用次数和同义密码子相对使用度差异,以毛木耳CDS密码子特征对福寿螺Mfc基因进行密码子优化。【结果】改造后的Mfcsg序列GC含量从原始Mfc序列的54.04%增加到58.16%,与毛木耳遗传背景一致。【结论】实验优化后获得的Mfcsg基因序列GC含量与毛木耳遗传背景一致,没有发夹结构、重复序列及反向重复序列,能够作为毛木耳外源基因转化应用。

关键词： 福寿螺 毛木耳 密码子优化