科研产出
川芎SSR标记开发及遗传多样性分析
《中国现代中药 》 2024
摘要:目的:基于川芎基因组调研结果开发简单重复序列(SSR)标记,对109份川芎种质资源进行遗传多样性分析,为川芎种质资源评价、保存和新品种选育等提供理论依据。方法:基于Survey测序已组装序列挖掘川芎基因组中的SSR位点并设计引物,筛选多态性高的引物,对109份川芎种质资源进行遗传多样性和遗传分化分析,并在川芎及其近缘物种中进行通用性验证。结果:36对引物在109份川芎种质资源中共检测到102个等位基因位点,观测等位基因数为2.833 3,期望杂合度为0.488 5,Shannon's指数为0.807 1,Nei基因多样性为0.486 0,多态信息含量为0.419 4,采集的109份川芎种质资源具有丰富的遗传多样性。基于遗传距离的聚类分析显示,在遗传相似系数为0.76处,109份川芎聚为两大类,但其与地理分布关系不大。通用性验证显示,36对SSR引物在川芎及其近缘物种中通用性较好。结论:开发的36对SSR标记能很好地揭示川芎的遗传多样性,供试109份川芎种质遗传分化小、基因流较大。
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利用SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响
《植物病理学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:本文采用茎秆牙签接种法将单一核盘菌菌株接种至不同油菜品种茎秆,再从46个油菜品种茎秆内收集接种后形成的菌核进行分离纯化和培养,并采用SRAP技术对46株核盘菌菌株进行了遗传分化分析。从12对检测引物中共获得357个位点,其中多态性位点273个,占76.47%;UPGMA聚类分析显示,在相似系数为0.77时,46株核盘菌菌株能够分为7组。当以寄主的抗(耐)病程度、寄主品种类型和品种选育地来源为标准将菌株分为不同群体时,AMOVA(analysis of molecular vari-ance)结果表明核盘菌菌株在各群体内变异率分别为98.50%、105.16%和95.36%,均达到极显著水平(P<0.001),而寄主品种选育地群体间的遗传变异达到极显著,变异率为4.64%。结果表明:核盘菌菌株接种不同油菜品种后,菌株间存在明显的遗传分化,这种分化与油菜品种的选育地来源有密切关系。
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分子标记所揭示的人工合成小麦与推广品种杂交后代中出现的新变异
《云南植物研究 》 2006 北大核心 CSCD
摘要:杂交和多倍化是小麦进化和遗传分化的重要途径,新变异的产生为人工选育小麦新品种提供了物质基础。本文选用了分布于小麦A、B、D基因组的92个SSR标记对硬粒小麦—节节麦人工合成小麦衍生材料川W5436(CW5436)及其双亲人工合成小麦Syn786(♀)和绵阳26(My26(♂))进行了遗传分析,结果表明:人工合成小麦的各等位基因并不是按孟德尔遗传的规律传递到后代中;川W5436与双亲比较在1个SSR位点上发生了川W5436所特有的新变异,主要表现在新型DNA片段的增加,即W5436出现了双亲不具有的特殊条带。表明人工合成小麦与普通小麦杂交过程中通过人工选择的压力使双亲的遗传物质产生了偏态分离而且微卫星序列发生了改变。本文对杂交转育中SSR位点遗传分化在小麦进化中的作用等问题进行了讨论。
关键词: 人工合成小麦 多倍化 选择压 微卫星DNA 遗传分化 变异
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