科研产出
甘蓝型油菜LPAT家族基因鉴定与表达模式分析
《作物杂志 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶(lysophosphatidylcholine acyltransferase,LPAT)在植物脂肪酸的积累和代谢中起着至关重要的作用,为了研究LPAT基因家族在甘蓝型油菜(Brassica napus)中的进化和表达模式,利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜全基因组水平进行BnLPAT基因的鉴定,并对其理化性质、系统进化、基因结构、顺式作用元件和表达模式进行分析。结果表明,在甘蓝型油菜全基因组水平一共鉴定到44个LPAT基因,它们不均等分布在17条染色体上。根据系统发育关系分为LPAT1~LPAT5,共5个分支,相邻分支的成员具有相似的基因结构和保守基序构成。在推定的BnLPAT基因启动子区域一共鉴定到4类共42种顺式作用元件。此外,表达模式分析发现它们在不同组织部位均能检测到,进一步检测了12个BnLPAT基因在种子发育过程中以及4个基因在高、中、低含油量材料中的表达特征。
关键词: 溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶(LPAT) 甘蓝型油菜 基因家族鉴定 表达模式
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酪氨酸酶和漆酶基因在不同颜色金针菇中的表达模式
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:【目的】在金针菇(Flammulina filiformis)基因组中鉴定酪氨酸酶(TYR)和漆酶(Lac)基因家族成员,分析TYR和Lac家族基因的组织表达模式及在不同颜色金针菇菌盖表皮中的相对表达水平,为研究TYR和Lac基因在金针菇颜色差异调控中的功能提供理论基础。【方法】基于基因组数据系统鉴定金针菇TYR和Lac基因家族成员,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析基因在不同颜色菌株(白色、黄色和褐色)菌柄和菌盖表皮组织的表达水平,并对酶活性进行测定。【结果】在金针菇基因组中共鉴定到3个TYR基因和11个Lac基因,编码蛋白均具有该家族典型保守结构域和保守基序,并与其他食用菌的相同基因家族成员亲缘关系较近。RT-qPCR分析显示,TYR3、Lac6和Lac11基因则在不同颜色菌株菌盖表皮的表达水平均高于菌柄表皮组织;Lac2在颜色较深的褐色菌盖表皮中显著高表达,而在白色和黄色菌株相对较低。进一步测定酶活性显示,白色菌盖表皮组织中的TYR酶活性显著高于褐色和黄色菌株;而Lac酶活性则在褐色菌盖表皮组织更高,其次是黄色,白色菌株中Lac酶活最低。【结论】在金针菇中鉴定出3个TYR和11个Lac家族基因;其中,漆酶家族成员可能通过催化酚类物质氧化聚合参与金针菇黑色素合成,导致金针菇菌盖呈现褐色表型。
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薄荷UV-B受体基因McUVR8 的克隆与表达分析
2025
摘要:随着城市化和工业化的快速发展,重金属污染对水生生态系统造成不可估量的威胁,并可通过食物链富集效应严重威胁人类生命健康,已然成为全球性关注的环境问题。在此背景下,以生物修复技术为代表的绿色环境治理方案因其环境友好性和可持续发展性而备受关注。藻类作为水生生态系统中的重要初级生产者,具有高度多样性和生态适应性,并通过多种分子机制响应重金属胁迫。莱茵衣藻(
关键词: 薄荷 UV-B受体McUVR8 蛋白特征 蛋白互作 表达模式 生信分析 基因克隆
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