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莴笋红叶基因图位克隆及分子标记开发

文献类型： 中文期刊

作者： 李春 1 ; 何振 2 ; 刘小俊 2 ; 梁根云 2 ; 李艺凡 2 ; 杨楠 2 ; 蔡鹏 2 ; 李跃建 2 ; 房超 2 ; 刘独臣 2 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院园艺研究所蔬菜种质与品种创新四川省重点实验室

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关键词： 莴笋;红叶;图位克隆;分子标记

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 523-528

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]研究莴笋叶色变异的遗传基础,加速莴笋新品种育种进程,提高育种效率.[方法]通过构建红叶和绿叶莴笋杂交群体,分析遗传规律,利用混池分组分析法(BSA-seq)和图位克隆法精细定位并克隆了莴笋红叶基因Lactuca sativa Red Leaf 1(LsRL1),根据变异位点设计了分子标记用于红叶莴笋分子标记辅助育种.[结果]遗传分析结果显示F2分离群体中红叶个体与绿叶个体的分离比为3∶1,说明研究中莴笋叶色表型受一个基因控制,且红叶相对于绿叶为显性性状.混池分组分析法(BSA-seq)将莴笋叶色基因LsRL1初步定位在莴笋第5染色体336.00 Mb到339.64 Mb的范围内.利用图位克隆的方法进一步将LsRL1基因的范围缩小至2个Indel分子标记ls06和ls12之间的85.17 kb区间内,这一区间内包含2个基因LOC111892298和LOC111892911.亲本间差异位点分析将LsRL1的候选基因确定为LOC111892911,该基因在拟南芥中的同源基因编码一个bHLH转录因子,参与花青素合成途径的调控.[结论]基于LsRL1基因在2个亲本间的插入缺失变异,我们开发了一个可用于红叶莴笋分子标记辅助育种的Indel标记,以加速红叶莴笋的育种进程.

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