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猪δ冠状病毒重庆流行株的诊断与N基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴学婧 1 ; 于吉锋 1 ; 叶勇刚 1 ; 肖璐 1 ; 毛从剑 1 ; 曹冶 1 ; 康润敏 1 ;

作者机构: 1.四川省畜牧科学研究院

关键词: 猪δ冠状病毒;诊断;N基因;遗传进化分析

期刊名称: 畜禽业

ISSN: 1008-0414

年卷期: 2024 年 35 卷 002 期

页码: 1-8

摘要: 2023 年重庆市某规模化养猪场猪群发生腹泻疫情,通过临床观察、RT-PCR检测、N基因克隆测序及序列分析对采集的腹泻仔猪肠道组织进行鉴定.结果显示,发病猪水样腹泻,小肠壁变薄、黏膜充血;成功检测到1 株猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV),命名为CQ2023 株.该毒株N基因序列全长1 029 bp,与30 株GenBank中登录的参考毒株N基因序列比对显示,核苷酸序列相似性为96.7%~99.4%,其中PDCoV CQ2023 株与CHN-HeN06-2022 株的相似性最高,为99.4%.遗传进化分析显示PDCoV CQ2023 株属于国内流行株,与国内PDCoV毒株CHN-HeN06-2022 等处于同一进化分支,亲缘关系最近.该次研究成功鉴定出该猪场腹泻疫情由PDCoV感染引起,并进行了N基因序列分析,为PDCoV的流行病学研究、遗传进化、预防及诊断试剂的研究提供数据支持.

  • 相关文献

[1]猪流行性腹泻病毒CH/SCJY/2022株的分离鉴定及遗传进化分析. 吴学婧,于吉锋,肖璐,毛从剑,叶勇刚,曾凯,潘梦,谢晶,曹冶,李兴玉,林毅,叶健强,张先惠,魏勇,青易,康润敏. 2024

[2]虹鳟常见病毒性疾病的诊断与防治. 陈春娜,黄颖颖. 2009

[3]家蚕微孢子虫PCR检测的研究. 徐兴耀,黄自然,卢铿明,庄楚雄,邵寒霜,刘志昕,郑学勤. 1997

[4]奇异变形杆菌检测方法研究进展. 刘亚东,王育伟,刘卜玮,赖爽,张晓晖,李廷见,周爱民,肖龙. 2019

[5]口蹄疫诊断方法的研究进展. 邹敏,张国伟,成磊,罗仁革. 2023

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