文献类型： 中文期刊

作者： 王威威 ¹ ; 李德鑫 ¹ ; 李秋娥 ¹ ; 廖海 ¹ ; 张富丽 ² ; 周嘉裕 ¹ ;

作者机构： 1.西南交通大学生命科学与工程学院

2.四川省农业科学院质量标准与检测技术研究所

关键词： 暗紫贝母;鲨烯合酶;基因克隆;表达分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 2596-2603

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】:克隆名贵药材暗紫贝母（Fritillaria unibracteata）鲨烯合酶（Squalene synthase, SQS）基因的全长ORF序列（FuSQS）,并对其进行生物信息学分析和不同组织表达水平分析。【方法】利用PCR方法,克隆得到FuSQS,利用生物信息学方法预测FuSQS蛋白的基本理化性质、保守结构域、二级及三级结构等蛋白特性,利用Clustal W和MEGA 7.0分别进行氨基酸序列对比和系统进化分析,通过Real-time PCR分析FuSQS在暗紫贝母不同组织的表达水平。【结果】FuSQS长度为1230 bp（GenBank登录号MW365404）,编码1条长度为409个氨基酸残基的肽链,相对分子质量为46.84 kDa,等电点（pI）为6.33,含有法尼基焦磷酸结合口袋和Mg²⁺结合位点等保守结构域。系统进化树表明FuSQS与油棕、宽瓣重楼、水稻、玉米等单子叶植物进化关系较近。Real-time PCR结果显示,FuSQS在不同组织中表达量有显著差异。【结论】FuSQS的克隆、生物信息学分析及其在鳞茎中的高表达特征,这为进一步研究FuSQS在暗紫贝母生物碱生物合成途径的调控机制提供科学依据。