文献类型: 中文期刊
作者: 余懋群 1 ; 龙海 1 ; 邓光兵 1 ; 潘志芬 1 ; 徐德林 1 ; 张洁 2 ;
作者机构: 1.;成都军区总医院;中国科学院成都生物研究所;遵义医学院;四川省农业科学院生物技术核技术研究所
2.;成都军区总医院;中国科学院成都生物研究所;遵义医学院;四川省农业科学院生物技术核技术研究所;
关键词: 大麦;表达序列标签;简单序列重复;分子标记;生物信息
期刊名称: 应用与环境生物学报
ISSN: 1006-687X
年卷期: 2018 年 01 期
页码: 102-106
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 大麦是一种古老的栽培作物,也是分子遗传学研究中常用的模式植物,为满足大麦基因作图、遗传多样性、种质资源鉴定和分子辅助育种等研究的需求,拟在NCBI公共数据库基础上,开发基于表达序列标签(EST)的简单序列重复(SSR)分子标记.从NCBI数据库中获得了525 781条大麦EST序列,将这些序列进行聚类和去冗余后共获得61 902个Unigene,随后通过MISA软件搜索Unigene中的SSR位点,并设计引物9 659对,最后通过电子PCR(E–PCR)和普通PCR对引物进行验证.结果显示:(1)61 902个Unigene中含有SSR位点24 648个,其中复合SSR位点5 843个,约占3.42%,单纯SSR位点23 805个,约占96.58%;(2)经E-PCR验证后发现9 659对SSR引物中有1 060对(11%)能够成功扩增出产物;(3)随机选取的11对引物经普通PCR验证发现,这些引物都能在2份野生大麦品种、2份栽培大麦品种及1份小麦、硬粒小麦、荆州黑麦和节节麦中成功扩增.本研究表明日益丰富的EST公共数据库是大麦SSR分子标记的重要来源;利用EST公共数据库、SSR搜索软件,结合E–PCR验证是开发SSR分子标记省时高效的手段.
- 相关文献
[1]黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析. 张聪,李明,屈会娟,张敏,阎文昭,蒲志刚. 2014
[2]四川大麦种质资源营养品质分析. 杨武云,胡晓蓉,江登阳. 1996
[3]间栽和混播对作物病害的防治效果. 刘波微,罗林明,席亚东. 2006
[4]不同品种大麦与高粱的酿酒性能对比. 唐玉明,任道群,刘茂柯,田新惠,刘颖. 2018
[5]大麦种质资源的酯酶同工酶研究. 邱敦莲,李正玮. 1992
[6]褐飞虱的饲养及抗褐飞虱水稻鉴定方法. 姜虹芮,吕建群. 2016
[7]玉米S组CMS育性恢复基因的分子标记定位. 李建生,刘纪麟,石永刚. 1997
[8]枇杷果肉色泽深浅性状的分子标记鉴定. 谢红江,李靖,涂美艳,陈栋,江国良. 2012
[9]四川小麦品种籽粒硬度和穗发芽抗性相关基因的分子标记鉴定. 郑建敏,伍玲,李俊,万洪深,杨漫宇,罗江陶,刘廷辉,杨开俊,蒲宗君. 2018
[10]春化、光周期和矮秆基因在不同国家小麦品种中的分布及其效应. 夏先春,张勇,张晓科,刘建军,唐建卫,杨学明,张俊儒,刘茜,李式昭,何中虎. 2012
[11]水稻空间诱变的遗传变异及突变体的AFLP分子标记. 张志勇,郑家奎,向跃武,张志雄,蔡平钟,文春描. 2006
[12]四川地方玉米种质的SSR聚类分析. 荣廷昭,杨俊品,潘光堂. 2004
[13]生物技术在国兰中的应用. 叶兰香,何俊蓉,王海娥,卓碧萍,刘菲,熊学琴. 2010
[14]分子标记遗传距离用于水稻杂种优势预测研究进展. 张涛,蒋开锋,郑家奎. 2010
[15]稻瘟病抗性基因Pita特异性分子标记的开发及应用. 张姝,苏菁. 2016
[16]分子标记遗传效应预测杂交水稻产量性状. 杨正林,赵芳明,桑贤春,凌英华,谢戎,何光华. 2010
[17]金针菇菌株遗传多样性的ISSR分析. 鲜灵. 2013
[18]利用TRAP标记分析83份烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系. 向秋燕,阎文昭,蒲志刚,邢小军,刘东阳,冯俊彦. 2016
[19]四川小麦品种高、低分子量麦谷蛋白基因和1B/1R易位的分子标记鉴定. 郑建敏,伍玲,李俊,蒲宗君,朱华忠. 2014
[20]分子标记在作物遗传育种中的应用. 蔡平钟,何俊蓉,阎文昭. 1999
作者其他论文 更多>>
-
四川小麦品种HMW-GS组成及品质参数演变分析
作者:蒋云;郝明;刘登才;吕季娟;汤述尧;宣朴;郭元林;陈谦;王颖;肖俊;张洁
关键词:四川小麦;高分子量谷蛋白亚基;品质;演变分析
-
普通小麦川麦60-簇毛麦3V(3D)代换系的分子细胞学鉴定
作者:张洁;蒋云;郭元林;王颖;邓光兵;宣朴;龙海
关键词:簇毛麦;3V染色体;川麦60;小麦-簇毛麦3V(3D)代换系;抗条锈性
-
基于表型性状的藜麦种质遗传多样性分析
作者:唐力为;代沙;蔺雨阳;任尧;李倩;吕婉茹;张洁;补雪梅;蒋云
关键词:藜麦;种质资源;表型性状;遗传多样性;主成分分析;聚类分析
-
抗条锈病弱筋小麦新品种-川辐14
作者:蒋云;张洁;宣朴;尹春蓉;王颖;肖俊;郭元林
关键词:
-
藜麦在四川省阿坝州的适应性研究
作者:蒋云;郑亮;李倩;赵丽华;张洁;唐力为;郭元林
关键词:藜麦;引种;农艺性状;品质性状
-
簇毛麦3V染色体在不同小麦遗传背景下的传递
作者:张洁;蒋云;郭元林;王颖;杨燕;李小燕;邓自圆;邓光兵;宣朴;龙海
关键词:簇毛麦;3V染色体;传递率;染色体结构变异;条锈抗性
-
近红外光谱法快速测定藜麦籽粒粗蛋白含量
作者:赵丽华;巩元勇;张洁;林长彬;王颖;李学武;代寻;蒋云
关键词:近红外光谱;藜麦籽粒;蛋白质含量;偏最小二乘法