文献类型： 中文期刊
作者： 余懋群 1 ; 龙海 1 ; 邓光兵 1 ; 潘志芬 1 ; 徐德林 1 ; 张洁 2 ;
作者机构： 1.;成都军区总医院;中国科学院成都生物研究所;遵义医学院;四川省农业科学院生物技术核技术研究所
2.;成都军区总医院;中国科学院成都生物研究所;遵义医学院;四川省农业科学院生物技术核技术研究所;
关键词： 大麦;表达序列标签;简单序列重复;分子标记;生物信息
期刊名称： 应用与环境生物学报
ISSN： 1006-687X
年卷期： 2018 年 01 期
页码： 102-106
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 大麦是一种古老的栽培作物,也是分子遗传学研究中常用的模式植物,为满足大麦基因作图、遗传多样性、种质资源鉴定和分子辅助育种等研究的需求,拟在NCBI公共数据库基础上,开发基于表达序列标签(EST)的简单序列重复(SSR)分子标记.从NCBI数据库中获得了525 781条大麦EST序列,将这些序列进行聚类和去冗余后共获得61 902个Unigene,随后通过MISA软件搜索Unigene中的SSR位点,并设计引物9 659对,最后通过电子PCR(E–PCR)和普通PCR对引物进行验证.结果显示:(1)61 902个Unigene中含有SSR位点24 648个,其中复合SSR位点5 843个,约占3.42%,单纯SSR位点23 805个,约占96.58%;(2)经E-PCR验证后发现9 659对SSR引物中有1 060对(11%)能够成功扩增出产物;(3)随机选取的11对引物经普通PCR验证发现,这些引物都能在2份野生大麦品种、2份栽培大麦品种及1份小麦、硬粒小麦、荆州黑麦和节节麦中成功扩增.本研究表明日益丰富的EST公共数据库是大麦SSR分子标记的重要来源;利用EST公共数据库、SSR搜索软件,结合E–PCR验证是开发SSR分子标记省时高效的手段.
- 相关文献
[1]黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析. 张聪,李明,屈会娟,张敏,阎文昭,蒲志刚. 2014
[2]四川大麦种质资源营养品质分析. 杨武云,胡晓蓉,江登阳. 1996
[3]大麦种质资源的酯酶同工酶研究. 邱敦莲,李正玮. 1992
[4]不同品种大麦与高粱的酿酒性能对比. 唐玉明,任道群,刘茂柯,田新惠,刘颖. 2018
[5]间栽和混播对作物病害的防治效果. 刘波微,罗林明,席亚东. 2006
[6]玉米S组CMS育性恢复基因的分子标记定位. 李建生,刘纪麟,石永刚. 1997
[7]小麦锈菌AFLP分子标记技术体系的建立. 唐静,蒲志刚,张敏,阎文昭. 2005
[8]四川花生产业现状及育种方向. 岳福良,张小军,张相琼,张小红,李文均. 2012
[9]水稻品种选育中常用的分子标记概述. 薛文君,宋丽,王爱东,高方远. 2017
[10]不同遗传背景甜糯双隐性玉米种质的SSR鉴定. 宋俏姮,孔亮亮,刘俊峰,杨跃华,张垚,高必军. 2020
[11]水稻Pi9位点6个稻瘟病抗性基因特异分子标记的开发及应用. 杨好,黄衍焱,易春霖,石军,谭楮湉,任文芮,王文明. 2023
[12]利用辐射诱变技术创制抗稻瘟病紫叶两系水稻新材料. 吴孝波,冯慧,黄强,刘勇强,姬红丽,杨芳,刘育生,彭云良,杨成明. 2018
[13]四种分子标记技术在甘薯及I.trifida遗传多样性研究中的应用. 冯俊彦,赵珊,李明,张聪,屈会娟,杨松涛,乔帅,谭文芳,王大一,蒲志刚. 2018
[14]分子标记预测杂种优势的研究现状. 李琳,蒲志刚,徐利远. 2006
[15]四川小麦品种淀粉特性、多酚氧化酶活性和黄色素含量相关基因的分子标记鉴定. 郑建敏,伍玲,李俊,蒲宗君,朱华忠. 2015
[16]西北条锈菌源区冬小麦育种抗条锈病基因的利用现状与策略. 白斌,张怀志,杜久元,张晓洋,何瑞,伍玲,张哲,张耀辉,曹世勤,刘志勇. 2024
[17]优质面条商品小麦澳白麦相关品质基因的分子标记鉴定. 伍玲,郑建敏,朱华忠. 2012
[18]离子束诱变体水稻JD-1的表型及基因组变异分析. 敬银钦,高方远,刘利平,苏相文,任明鑫,陆贤军,吕建群,金文杰,胡运高,任鄄胜,任光俊. 2021
[19]分子标记在作物遗传育种中的应用. 蔡平钟,何俊蓉,阎文昭. 1999
[20]绿色优质高产水稻新品种的选育与应用. 任鄄胜,陆贤军,苏相文,康海岐,吴贤婷,曾礼华,吕建群,刘利平,任光俊. 2018
作者其他论文 更多>>
-
段木银耳菌渣栽培毛木耳配方初筛
作者：张洁;罗建华;刘宏平;叶雷;张波;马世均;陈顺;杨学圳;李小林;周清平;谭伟;刘如县
关键词：毛木耳;段木;菌渣;配方筛选;产量;生物转化率
-
通江银耳生产困境及对策
作者：刘如县;谭伟;罗建华;刘宏平;张波;叶雷;李小林;张洁
关键词：通江银耳;生产表现特征;生产困境;科技对策
-
四川小麦品种HMW-GS组成及品质参数演变分析
作者：蒋云;郝明;刘登才;吕季娟;汤述尧;宣朴;郭元林;陈谦;王颖;肖俊;张洁
关键词：四川小麦;高分子量谷蛋白亚基;品质;演变分析
-
小麦Glu-1D位点HMW-GS近等基因系创制及对品质的影响
作者：蒋云;张连全;郝明;范超兰;甯顺腙;姜博;杨苗苗;张洁;吕季娟;刘登才
关键词：小麦;剩余杂合体;近等基因系;加工品质;高分子量谷蛋白亚基
-
基于表型性状的藜麦种质遗传多样性分析
作者：唐力为;代沙;蔺雨阳;任尧;李倩;吕婉茹;张洁;补雪梅;蒋云
关键词：藜麦;种质资源;表型性状;遗传多样性;主成分分析;聚类分析
-
抗条锈病弱筋小麦新品种-川辐14
作者：蒋云;张洁;宣朴;尹春蓉;王颖;肖俊;郭元林
关键词：
-
普通小麦川麦60-簇毛麦3V(3D)代换系的分子细胞学鉴定
作者：张洁;蒋云;郭元林;王颖;邓光兵;宣朴;龙海
关键词：簇毛麦;3V染色体;川麦60;小麦-簇毛麦3V(3D)代换系;抗条锈性
