科研产出
丹参线粒体和叶绿体微卫星标记开发及多样性分析
《西北植物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:该研究通过生物信息学方法,对丹参线粒体、叶绿体基因组序列进行SSR位点搜索,利用Primer3.0软件在线设计SSR引物,通过PCR扩增,筛选出扩增效果好、多态性高的10对cpSSR引物和13对mtSSR引物,用于分析61份丹参品种的遗传多样性和鼠尾草属植物种间的通用性。结果显示:(1)从2条基因组序列中搜索到32个cpSSR位点和24个mtSSR位点,其中叶绿体单核苷酸的重复序列最多为31个,占96.9%,重复类型中以A/T形式的微卫星最为丰富。(2)23对SSR引物共检测出46个等位基因,平均每个SSR位点等位基因数是2个,有效等位基因数为1.566;预期杂合度(He)为0.346,高于双子叶植物的平均水平(He=0.190);多态信息含量(PIC)为0.278,大于0.250小于0.500;Shannons信息指数为0.519,表明所采集的丹参呈中等水平的遗传多样性。(3)聚类分析表明,61份丹参材料的遗传相似系数在0.54~0.96之间,并在遗传相似系数为0.64处将61份丹参分为6个亚群:四川、山东和安徽省的丹参聚集在Ⅰ和Ⅱ亚群中,说明四川中江、山东和安徽地区的丹参亲缘关系较近,而来源于四川中江的丹参分布于所有亚群,表明四川中江的丹参具有丰富的多态性。(4)通用性检测结果显示,11对mtSSR引物在9种鼠尾草属中的平均通用性比率为64.63%,通用性较高;9对cpSSR引物在10种鼠尾草属中的平均通用性比率为44.66%,通用性较低;引物cp5p、cp8p和cp10p在野芝麻亚科植物属间的通用性较好。研究表明,开发的23对SSR引物在鼠尾草属内具有很好的适用性,可以为该属种间的亲缘关系和种内遗传分化研究提供分子依据。
关键词: 丹参 线粒体微卫星 叶绿体微卫星 遗传多样性 通用性
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四川中江丹参根际和非根际土壤真菌种群多样性PCR-DGGE分析
《西南农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要:以中江县患病丹参根际与非根际土壤、正常生长丹参根际与非根际土壤为研究对象,在测定土壤理化性质基础上,采用PCR-DGGE技术研究了土壤真菌类群多样性。结果表明,与正常生长丹参土壤相比,患病丹参土壤理化性质发生了较大变化,其中,土壤有机质、全氮、碱解氮、速效磷和速效钾含量分别降低了60%、52%、18%、18%和45%。PCR-DGGE分析表明,连作导致患病丹参根际与非根际土壤真菌类群差异变小;对代表性条带克隆测序,结果表明Acremonium sclerotigenum,茎点霉属(Phoma sp.),Phialocephala fortinii和Chaetomium sp.为土壤中优势类群。说明土壤肥力退化及致病真菌是造成丹参连作障碍的原因。
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灵丹菌质发酵工艺的初探
《时珍国医国药 》 2011 北大核心 CSCD
摘要:目的筛选灵芝与丹参双向固体发酵菌株,优化发酵工艺参数,获得灵丹菌质最适的发酵组合及工艺参数。方法由不同灵芝菌株与丹参药性基质组成不同的发酵组合,在一定条件下进行双向固体发酵,以菌丝长势,菌质药效、毒性、化学成分为指标进行发酵菌株筛选及发酵工艺参数优化。结果灵芝菌株ZL30与丹参双向固体发酵时菌丝长势尤佳、菌质活血化瘀药效显著,为最优发酵菌株,其组合为最适发酵组合,最佳发酵工艺参数为:基质含水量70%、灭菌温度100℃、灭菌时间60 min、发酵终点40 d。结论以药用真菌双向性固体发酵工程为原理和方法进行灵丹双向固体发酵及灵丹菌质的研发、利用,切实可行。
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中药材土传病害拮抗木霉的筛选与应用初探
《云南农业大学学报 》 2002 CSCD
摘要:用稀释平板法对 5 1份来自不同地区、不同生态环境的丹参、川红花等 10种主要川产道地中药材根际土样分离到 6 2个木霉菌株 ;木霉种群以哈茨木霉 (Trichodermaharzianum)为主 ,其次是桔绿木霉 (T .citrinoriride)和拟康氏木霉 (T .pseudokoningii)等。对峙法培养结果表明 ,木霉菌株T2 3,T5 6 ,T4 5对尖孢镰刀菌、立枯丝核菌均具有较强的拮抗作用。初步研究了T2 3,T5 6在田间对中药材的防病作用 ,木霉处理不仅能显著提高川红花、丹参的出苗率 ,且对其幼苗具有促生作用 ,对川红花枯萎病和丹参根腐病的相对防效均达 5 0 %以上
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