科研产出
川明参转录组分析及SSR分子标记开发
《中药材 》 2019 北大核心
摘要：目的:获得川明参转录组信息,探索川明参多糖和黄酮类化合物生物合成途径相关的基因,开发高效的SSR分子标记。方法:利用Illumina HiSeq 2500高通量测序对川明参全株进行转录组测序,经CAP3软件拼接组装后获得Unigenes,然后进行生物信息学分析。结果:获得了46 576 691条Clean Reads。从头组装产生了64 984条Unigenes。通过Blastx比对分析显示,比对到Uniprot数据库的Unigenes有35 604条(54.80%),Nr数据库有35 591(54.80%)条,GO数据库有18 291条(28.20%),COG数据库有19 950条(30.70%)。8 141条Unigenes(12.50%)映射到242条代谢通路,其中,58条Unigenes参与黄酮类化合物的生物合成,128条Unigenes参与川明参多糖的生物合成,共编码了28种不同的酶。此外,检测到18 271个SSR位点,设计SSR引物842对,选择30对引物用于36份川明参样品的遗传多样性分析,其中13对引物能在36份样品中成功扩增出条带。结论:川明参转录组数据可为探索川明参次生代谢产物的生物合成机制提供重要的参考,也可为川明参的遗传多样性研究和分子标记辅助育种提供依据。
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独脚金内酯途径相关基因的研究进展
《分子植物育种 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：独脚金内酯是一类萜内酯,最新研究证明独脚金内酯是一种可调控植物株型发育的新型植物激素,作为一种长距离信号分子来抑制植物分枝。独脚金内酯参与的植物分枝途径被称为类胡萝卜素衍生的MAX/RMS/D途径。至今独脚金内酯的合成和信号传导途径尚不清晰,已克隆的基因亦有限。本文综述了独脚金内酯途径中相关基因的研究进展,参与合成途径的基因包括编码同源蛋白CCD7的MAX3/RMS5/DAD3/D17/HTD1、编码同源蛋白CCD8的MAX4/RMS1/DAD1/D10、编码细胞色素P450单加氧酶的MAX1、以及编码β-胡萝卜素异构酶的D27;参与信号传导途径的基因包括编码核内高亮氨酸重复F-box蛋白的MAX2/RMS4/D3、编码α/β水解酶家族成员的D14/D88/HTD2、编码TCP家族转录因子的TB1、以及编码独脚金内酯信号传导途径抑制因子的D53。这些基因分别从水稻、拟南芥、矮牵牛、豌豆等多分枝突变体中克隆得到。本文还就独脚金内酯未来发展方向进行了展望。
1-脱氧野尻霉素的来源及合成研究进展
《蚕业科学 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：1-脱氧野尻霉素(1-deoxynojirimycin,DNJ)是一种有效的α-糖苷酶抑制剂,具有显著的降血糖作用。野尻霉素最先从链霉菌中发现,而天然DNJ最先是从桑根皮中分离到的。在植物中,已从桑树(MorusL.)、鸭跖草(Commelina communis)、风信子(Hyacinthus orientalis)以及沙参属植物(Adenophora triphyllavar.japonica)中分离鉴定到DNJ,其中桑树中的DNJ含量最高,并且因桑品种、药用部位、季节气候、地理土壤、叶位和发育阶段等因素的不同而存在很大差异。在微生物中,已从多种链霉菌和芽孢杆菌中分离到DNJ,还发现从桑树中分离到的嗜麦芽寡养假单胞杆菌(Stenotrophomonas maltophilia)和藤黄微球菌(Micrococcus luteus)2种内生菌也能够产生DNJ,已对多种微生物产DNJ的发酵条件进行研究。在昆虫中,除家蚕(Bombyxmori)富含DNJ外,野桑蚕(Bombyxmandarina)、桑蟥(Rondotia menciana)、桑尺蠖(Phthonandria atrineata)、桑螟(Diaphani apy-loalis)等取食桑叶的单食性或寡食性昆虫也富含DNJ,昆虫体内的DNJ来源于食物,其中家蚕体内DNJ的含量因蚕品种、发育时期、组织器官以及饲料等因素的不同而异,家蚕随龄期进展存在着对DNJ的吸收富集和排泄的周期性变化。目前已经对链霉菌、芽孢杆菌和鸭跖草体内DNJ的生物合成途径进行了探索,发现不同物种体内DNJ的合成机制不同。另已探明了DNJ的3种主要合成方法,人工合成的一些DNJ衍生物已经应用于临床。
关键词： 1-脱氧野尻霉素 来源 含量变化 生物合成 化学合成
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