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基于RNA高通量测序分析灰葡萄孢侵染垫形成相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 汤洁静 1 ; 张蕾 2 ; 吴明德 3 ; 杨龙 4 ;

作者机构： 1.华中农业大学农业微生物学国家重点实验室

2.四川省农业科学院植物保护研究所

3.湖北省作物病害监测和安全控制实验室

4.华中农业大学植物科技学院

关键词： 灰葡萄孢;侵染垫;表达谱分析;差异表达基因

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2016 年 46 卷 05 期

页码： 605-613

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 灰葡萄孢产生功能上类似附着胞的侵染垫来侵染寄主植物,但目前对于侵染垫形成的分子机制尚不明确。本文利用高通量测序技术对菌株CanBC-1(弱毒,不形成侵染垫)和CanBC-1c-66(强毒,正常形成侵染垫)进行了转录水平比较。结果表明:在菌株CanBC-1中共检测到2 333个差异表达基因(与菌株CanBC-1c-66相比较),其中1 425个基因表达上调,908个基因表达下调。对差异表达基因进行功能注释(GO)分析发现,在细胞组分(Cellular component)中细胞(Cell)和细胞部分(Cell part)这2个亚类所占比例较大,在分子功能(Molecular function)中结合活性(Binding)和催化活性(Catalytic)这2个亚类所占比例较大。这些结果暗示差异基因主要参与细胞、代谢和发育等生物学过程。筛选得到12个与真菌致病相关的基因,其中BC1G_03994和BC1G_01012与稻瘟病菌侵染相关的classⅡ疏水蛋白基因Mhp1同源。RT-PCR检测发现这2个基因在弱毒菌株CanBC-1中表达下调,同时该菌株疏水性降低,推测它们可能参与灰葡萄孢侵染垫形成。这些差异基因的获得为揭示灰葡萄孢侵染形成的分子机制奠定了基础。

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