科研产出
施用猪粪水对青脆李果实品质和产量、土壤中微生物群落与抗生素耐药基因的影响
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]为了解猪粪浇灌对青脆李果实品质和产量、土壤性质、土壤中微生物群落与抗生素耐药基因的影响.[方法]以5年生青脆李作试材,设置猪粪水按不同比例(100%、75%、50%、25%、0%)替代化肥田间试验,通过单果重、单果横径等外观指标,李子每667 m2产量,维生素C、可溶性固形物等果实品质指标测定,分析不同施肥处理对青脆李果实品质和产量的影响;基于土壤中pH、有机质含量等理化指标测定,分析不同施肥处理对李树土壤理化性质的影响;基于Illumina Hiseq 4000测序平台对李树土壤宏基因组测序,分析猪粪水浇灌对土壤中微生物群落变化、抗生素耐药基因分布的影响.[结果]不同施肥处理青脆李果实品质和产量研究结果表明,"75%猪粪+25%化肥""50%猪粪+50%化肥"处理青脆李果实外观品质均较优,"50%猪粪+50%化肥"处理青脆李每667 m2产量最高.不同施肥处理对李树土壤理化性质的研究结果显示,各处理间有机质、碱解氮等理化指标均不存在显著性差异(P>0.05).宏基因组测序分析结果显示,"100%猪粪"组中的优势菌群为放线菌,而其余4组的优势菌群均为假单胞菌门;共鉴定39个抗生素本体(ARO),随着猪粪水用量的减少,土壤样品中检出ARO种类、ARO相对丰度和均呈依次递减趋势.[结论]本研究条件下,猪粪水部分替代化肥为青脆李树施肥是可行的,且以"50%猪粪+50%化肥"进行施肥最佳.
关键词： 青脆李 猪粪 土壤 菌群 宏基因组 抗生素 耐药基因
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整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究生猪养殖粪污在堆肥过程中耐药基因的消减规律。【方法】以猪粪和菌渣为发酵原料，进行有氧堆肥处理，在堆肥第1、4、8、12、16、22、29天，进行上、中、下分层多点采样，提取总DNA构建文库，经定量和检测合格后，进行宏基因组测序分析。通过宏基因组学方法对堆肥过程中耐药基因的动态变化进行分析。【结果】堆肥期间共发现613个耐药基因，分别对32类抗生素产生耐药。其中，丰度较高的抗生素分别为青霉烷类抗生素（Penam）、头孢菌素类抗生素（Cephalosporin）、氨基糖苷类抗生素（Aminoglycoside antibiotic）、磷霉素类抗生素（Fosfomycin）、糖肽类抗生素（Glycopeptide antibiotic）和四环素类抗生素（Tetracycline antibiotic）,这与现实中常用的抗生素种类相吻合。分析发现耐药基因的消减出现2个峰值，第一个峰值出现在试验起始时，在第4天迅速下降，然后在第12天（对照组）和第8天（实验组）达到第二个峰值，随着细菌的自然凋亡，耐药基因的丰度又下降到低值，慢慢消减下去。【结论】在堆肥过程中，生猪养殖粪污中耐药基因丰度呈现波动式消减。
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整合宏基因组学分析生猪养殖粪污堆肥发酵过程中微生物群落动态变化
《动物医学进展 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以猪粪和菌渣为发酵原料,进行有氧堆肥处理,在堆肥第 1、4、8、12、16、22、29 天,进行上、中、下分层多点采样,提取总 DNA 构建文库,经定量和检测合格后,利用宏基因组测序分析堆肥过程中微生物区系变化与致病微生物动态变化.结果表明,堆肥期间微生物丰度发生明显变化,其中细菌丰度先升后降,病毒丰度变化平稳,真菌丰度稍有增长,古细菌丰度则稍有下降.在堆肥初始时,变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门等微生物群落为优势菌门;变形菌门在堆肥的第 4 天迅速达到高点,然后迅速下降并维持在原始水平,其中试验组的变化比对照组更为平稳;厚壁菌门在堆肥的前 4d,丰度急速下降,然后缓慢下降;拟杆菌门在堆肥期间,丰度持续上升.同时,大肠埃希氏菌、沙眼衣原体、肠道沙门氏菌、化脓性链球菌、停乳链球菌等强致病微生物,随着堆肥的进行,其丰度均逐渐下降.试验组和对照组的菌群结构和丰度变化趋势均无显著差异.
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不同处理方法对芽苗菜表面微生物的控制和消除
《现代食品科技 》 2018 北大核心
摘要：为了深入研究即食蔬菜在不同处理下微生物的消长变化及种群结构变化规律,本实验从芽苗菜入手,采用水洗,辐照、冷热激,含氯消毒剂、有标识杀菌成分的清洗剂等5种方法对芽苗菜进行处理,建立微生物总数动态生长模型,利用微生物宏基因组学的方法调查处理前后的微生物种群丰度变化,选择性培养后采用基质解析电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS)对优势种群进行鉴定。实验结果表明即食芽苗菜微生物总数稳定在一个数量级(5~6 lg CFU/g),处理会将微生物种群结构平衡打破,但经过一段时间微生物总量会恢复之前稳定水平。其中辐照方法影响最为明显;水活性方法(水洗,冷热激,有标识杀菌成分的清洗剂清洗)影响相对较小且恢复较快,但内含不同成分,微生物控制效果稍有差异。实验结论为处理原理的差异是影响微生物种群结构的主要原因。此外辐照方法会将芽苗菜优势种群假单胞菌属和乳酸菌属改变为芽孢菌属,并在其中检出蜡样芽孢杆菌,增加了食用安全风险,就是说即食蔬菜微生物的控制最有效的方法并不一定是最安全的方法。在即食果蔬微生物控制中不仅要考虑微生物总量的降低也需要综合微生物微观生态学的其他因素。
关键词： 芽苗菜 清洗 辐照 宏基因组 微生物预测模型 基质解吸电离飞行时间质谱
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