科研产出
甜柠檬实生后代四倍体创制及其分子细胞遗传组成鉴定
《西南农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】创制甜柠檬(Citrus lumia Risso)多倍体种质，创建其分子和细胞遗传组成鉴定新体系，为种质资源创新和鉴定利用提供新方法体系。【方法】通过实生苗根尖染色体计数筛选甜柠檬多倍体材料，与二倍体对比分析多倍体的叶形、气孔等植物学性状。利用47对分布于柑橘9条染色体上的SSR标记，分析多倍体甜柠檬的亲本来源。利用柑橘全部9条染色体特异的寡核苷酸荧光原位杂交(Oligo-FISH)涂染探针，精准鉴定多倍体甜柠檬的染色体组成。【结果】染色体计数表明获得四倍体甜柠檬材料1份(2n=4x=36)。与二倍体对照相比，其表现出叶形指数变小、叶片增厚、气孔指数变大、气孔密度降低。47对SSR标记扩增结果显示，四倍体和二倍体甜柠檬拥有完全一致的遗传条带。Oligo-FISH涂染显示，在四倍体中每个染色体特异探针均识别4条同源染色体，无染色体间重排。分子标记和细胞遗传学鉴定结果共同表明，该四倍体甜柠檬系二倍体自然加倍得到的同源四倍体。【结论】创新了柑橘类多倍体材料创制及分子细胞遗传组成鉴定体系，丰富了甜柠檬特色种质资源。
关键词： 柑橘 甜柠檬 多倍体 寡核苷酸荧光原位杂交 SSR分子标记
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45份糯高粱种质资源主要农艺性状和SSR标记的遗传多样性分析
《作物杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：糯高粱是酿造优质白酒的重要原料，为挖掘优异糯高粱资源材料，对45份不同来源的糯高粱种质资源10个主要农艺性状进行了分析，并用40对SSR引物解析糯高粱的遗传变异。结果表明，10个农艺性状的变化幅度、变异系数和遗传多样性指数均较大，42.2%的农艺性状间呈极显著相关性；40对SSR引物共检测到98个等位基因，多态信息含量变幅为0.044～0.690，其Shannon指数分布范围为0.1105～1.3626，遗传相似系数范围为0.235～0.980。结果表明本研究的45份糯高粱资源具有较为丰富的遗传多样性。基于主要农艺性状和SSR分子标记的UPGMA聚类分析分别将45份糯高粱资源划分为6大类和4大类。2种方法的聚类结果一致性较差，但可互为补充。研究结果为糯高粱种质资源的创新和新品种培育提供了理论参考，同时筛选出了一批优异的糯高粱资源材料。
关键词： 糯高粱 种质资源 主要农艺性状 SSR分子标记 遗传多样性分析
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基于三代全长转录组测序的极边扁咽齿鱼SSR分子标记开发
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于三代全长转录组测序数据,开发极边扁咽齿鱼SSR分子标记,积累和丰富该物种遗传信息,为后期指导和优化人工繁殖技术提供理论参考.[方法]基于极边扁咽齿鱼三代全长转录组测序结果(PRJNA792686),分析SSR分布情况,筛选出具有多态性的SSR引物,并对2个流域37尾边扁咽齿鱼的遗传多样性进行分析.[结果]极边扁咽齿鱼单核苷酸重复SSR个数最多,占37.87%,二核苷酸~六核苷酸重复序列依次占31.77%、10.32%、1.29%、0.25%和0.10%;二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸和六核苷酸重复序列均以重复次数5~8次居多,分别占各自SSR总数的55.26%、94.90%、70.92%和89.52%;之后随重复次数增加而逐渐减少,当重复次数为21~24次时最低,分别占各自SSR总数的2.63%、0.04%、2.68%和0.单核苷酸重复序列以重复次数9~12次居多,占其SSR总数的71.43%;五核苷酸重复序列的重复次数主要集中在5~8次,占其SSR总数的83.33%;三核苷酸、四核苷酸和五核苷酸重复序列中,排名前5的序列分别是TA(17.07%)、AT(16.95%)、TG(15.29%)、AC(12.51%)和CA(9.71%);TTA(7.53%)、GAT(6.07%)、TAT(5.93%)、CAG(5.50%)和GAG(5.50%);TATC(4.83%)、TTTA(4.32%)、TTCT(3.81%)、TATT(3.56%)和TGTT(3.18%).共设计38对SSR引物,最终筛选得到9对SSR多态性引物.2个流域的极边扁咽齿鱼等位基因数(Na)为3~29,其中,A流域极边扁咽齿鱼的期望杂合度(He)为0.484~0.931,香农指数(H′)为0.677~2.793;B流域极边扁咽齿鱼的He为0.315~0.948,H′为0.578~3.075.[结论]2个流域的极边扁咽齿鱼具有较高的遗传多样性.开发的9个多态性SSR分子标记可用于极边扁咽齿鱼育种和种质保护.
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基于SSR分子标记的象草变异分析
《四川农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]从分子水平上确认能够在四川泸州叙永县东牛牧场自然越冬并且含糖量有明显差异的7个单株象草材料是否存在遗传变异.[方法]对8份供试材料进行含糖量测定并利用SSR分子标记进行引物筛选及PCR扩增.[结果]22对引物共扩增出166条清晰有效的条带,其中有114条多态性条带,多态性条带比率为68.67%.聚类结果表明,8份供试材料间的遗传相似系数在0.560~0.795之间,SA-4和桂牧1号的遗传相似系数最小,亲缘关系较远.[结论]根据不同引物扩增出现的特异性条带,推测含糖量最高的SA-4是桂牧1号的芽变材料.该结果为象草芽变新材料选育提供了分子生物学依据.
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