科研产出
鸡肌肉发育相关miR- 133c- 3p靶基因筛选与鉴定
2025
摘要:旨在研究鸡不同组织及骨骼肌卫星细胞中miR-133c-3p的表达情况,并利用生物信息学分析筛选其在胸肌中影响肌肉生长发育的关键靶基因。本研究利用在线网站预测鸡miR-133c-3p靶基因,进行GO和KEGG富集分析并构建蛋白-蛋白互作网络;利用在线公共数据库,分析胸肌相对于其他组织的miR-133c-3p表达量及筛选潜在靶基因,并通过双荧光素酶报告基因试验进行靶标验证。结果表明:1)预测获得103个靶基因;功能富集分析显示靶基因参与多种高分子化合物的合成与转运过程;并显著富集到肌动蛋白细胞骨架调控、mTOR等多条肌肉生长发育相关信号通路。2)PPI网络共筛选到5个Hub基因。3)miR-133c-3p仅在胸肌和心脏中表达,在胸肌中的表达量极显著高于心脏(
关键词: 鸡 miR-133c-3p 生物信息学 基因表达量 肌肉生长发育 靶标验证
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鸡肌肉发育相关miR-133c-3p靶基因筛选与鉴定
《中国农业大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:旨在研究鸡不同组织及骨骼肌卫星细胞中miR-133c-3p的表达情况,并利用生物信息学分析筛选其在胸肌中影响肌肉生长发育的关键靶基因。本研究利用在线网站预测鸡miR-133c-3p靶基因,进行GO和KEGG富集分析并构建蛋白-蛋白互作网络;利用在线公共数据库,分析胸肌相对于其他组织的miR-133c-3p表达量及筛选潜在靶基因,并通过双荧光素酶报告基因试验进行靶标验证。结果表明:1)预测获得103个靶基因;功能富集分析显示靶基因参与多种高分子化合物的合成与转运过程;并显著富集到肌动蛋白细胞骨架调控、mTOR等多条肌肉生长发育相关信号通路。2)PPI网络共筛选到5个Hub基因。3)miR-133c-3p仅在胸肌和心脏中表达,在胸肌中的表达量极显著高于心脏(P<0.01),且在卫星细胞增殖分化期间其表达水平呈先下降后上升的规律。4)共筛选到SGK1、MYH9、KLF7和NFAT5 4个靶基因。5)双荧光素酶报告基因检测发现miR-133c-3p与NFAT5存在靶标关系。综上,鸡miR-133c-3p在胸肌中可通过靶向NFAT5间接调控肌肉生长发育。本研究为解析鸡miR-133c-3p的功能及其分子机制提供了参考和依据。
关键词: 鸡 miR-133c-3p 生物信息学 基因表达量 肌肉生长发育 靶标验证
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鸡miR-133a-3p的表达、生物信息学分析及其靶基因初筛
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要:为了研究鸡不同组织中miR-133a-3p的表达情况并预测其靶基因,进行GO、KEGG富集分析,对关键靶基因进行初筛,阐明其在机体中的作用。通过miRBase检索15个物种的miR-133a-3p序列,采用MEGA 7.0进行多物种序列比对及系统进化树构建;使用TargetScan、miRDB预测鸡miR-133a-3p的靶基因,再取交集,对其进行GO、KEGG富集分析;通过qPCR检测miR-133a-3p在罗斯308肉鸡各组织中的表达量,并检测其靶基因在不同生长周龄(W0~W6)胸肌中的表达规律。结果表明,不同物种miR-133a-3p的成熟序列同源性极高,物种间保守,系统进化树分析发现,鸡miR-133a-3p与原鸽聚为一支;预测获得145个靶基因,GO富集分析显示,靶基因富集到酶活性调控、分子功能负调控、内质网系统形成、肌球蛋白结合等条目,KEGG结果显示,靶基因富集到p53、mTOR、FoxO、肌动蛋白细胞骨架调控等多条与肌肉生长发育相关的信号通路;对肌肉生长发育相关通路进行分析,挖掘到PIK3CB、NRAS、EGFR、PRKAA1、IGF1R这5个显著富集基因;miR-133a-3p仅在胸肌、腿肌、心脏中表达,且在胸肌中的表达量显著高于心脏、腿肌(P<0.01);随着生长周龄的增长,miR-133a-3p在胸肌中的表达量先升后降,而靶基因IGF1R的表达量呈先降后升的规律,它们的拐点均在第3周龄,二者负相关。综上说明,鸡miR-133a-3p在肌肉组织中特异性表达,很可能通过靶基因IGF1R调控肌肉生长发育。
关键词: 鸡 miR-133a-3p 生物信息学 表达分析 肌肉生长发育 靶基因筛选
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蛋鸡输卵管子宫部蛋壳钙化节律及其分子调控途径
《中国家禽 》 2019 北大核心
摘要:高产蛋鸡具有近似24 h的产蛋规律(近日节律),被排出卵巢的卵在输卵管各部位具有相对固定的停留时间,其中停留于子宫部的时间最长。时钟基因是生物钟的最基本组成单位,其节律性表达预示着生物钟的存在,研究发现时钟基因调控动物繁殖周期,并且在鸡输卵管子宫部中节律性表达,输卵管子宫部是蛋壳形成的主要部位,可以推测生物钟存在于输卵管子宫部,时钟基因通过发条机制调控蛋壳形成相关离子、离子通道蛋白、离子结合蛋白、蛋壳特异性基质蛋白等下游蛋壳形成相关基因节律性表达,从而保证蛋壳按序合成和蛋鸡产蛋的连续性。
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