科研产出
石榴根腐病植株和健康植株根际土壤细菌群落结构及多样性分析
《中国果树 》 2025 北大核心
摘要：研究石榴根腐病病株与健康植株的根际土壤细菌群落结构及多样性变化，为探究石榴根腐病的微生态发病机理及防治提供理论基础。利用高通量测序技术，分析和比较石榴根腐病患病植株和健康植株的根际土壤细菌群落结构组成及多样性特点。结果表明：患病植株与健康植株相比，根际土壤细菌多样性和丰富度均未达到显著差异；Beta多样性分析表明，患病植株与健康植株根际土壤的细菌群落组成存在明显差异；在优势门菌群中，放线菌门（Actinobacteriota）和变形菌门（Proteobacteria）相对丰度在患根腐病的植株根际土壤中均显著高于健康植株，而酸杆菌门（Acidobacteriota）、芽单胞菌门（Gemmatimonadota）、绿弯菌门（Chloroflexi）以及黏球菌门（Myxococcota）相对丰度在健康植株的根际土壤中均高于患病植株。在属水平上，链霉菌属（Streptomyces）、Actinospica属、分枝杆菌属（Mycobacterium）相对丰度在患病植株根际土壤中均高于健康植株；而芽单胞菌属（Gemmatimonas）相对丰度在健康植株根际土壤中高于患病植株；LefSe分析结果表明，放线菌门和芽单胞菌门在患病植株和健康植株根际土壤中的差异最大。综上所述，健康石榴植株感染根腐病后，根际土壤细菌群落结构和多样性发生了一定程度变化，链霉菌属为相对丰度最高的属，在患根腐病的植株根际土壤中明显富集，可作为候选生防菌群。
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淀粉基保水剂对芒果园土壤真菌群落结构的影响
《四川农业科技 》 2025
摘要：为揭示辐照合成的淀粉基保水剂对芒果园土壤真菌群落结构的影响，以四川省攀枝花市干热河谷区的芒果园为研究对象，比较保水剂处理(SAP)和不施用保水剂(CK)下土壤0～20 cm和20～40 cm真菌群落的组成、结构、物种多样性、营养结构多样性和功能多样性的差异。结果表明，SAP和CK处理之间的真菌群落结构特征存在一定的差异。在0～20 cm土层，SAP的指示物种为真菌寄生属(Hypomyces)、Arthropsis、短柄帚霉属(Scopulariopsis)、生赤壳科(Bionectriaceae)及其下拟赤壳属(Nectriopsis)、靴耳科(Crepidotaceae)及其下靴耳属(Crepidotus)、裂圆盾菌科(Schizoparmaceae)、笋顶孢霉属(Acrostalagmus)、Chaetomellaceae及其下Pilidium。在20～40 cm土层，SAP的指示物种为Torulaceae及其下串状酵母菌属(Torula)。SAP未改变土壤真菌物种多样性，但改变了土壤真菌的营养结构。SAP显著降低了20～40 cm土层兼性腐生和共生的寄生菌的相对丰度，并显著降低了0～20 cm土层仅兼具动物病原菌、粪腐菌、内生真菌、附生植物、植物腐生菌和木质腐生菌功能的真菌类群。此外，保水剂还改善了土壤干湿环境调控以被孢菌门(Mortierellomycota)为代表的功能真菌群落丰度。
关键词： 淀粉基保水剂 高通量测序 群落结构 腐生真菌 共生真菌
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黄河上游支流白河、黑河鱼类群落组成与结构特征
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：白河和黑河是黄河上游四川省境内的两条支流,其独特的环境及气候条件,为黄河上游特有鱼类提供了良好的繁殖和栖息生境。为了解白河和黑河的鱼类种类组成、群落结构及其多样性,本研究结合历史资料,于2022年冬季(11月)、2023年春季(4月)、夏季(7月)和秋季(9月)对白河和黑河开展了鱼类资源调查。共采集到鱼类11种2936尾,隶属于1目2科8属;其中,黄河上游特有鱼类有花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)、极边扁咽齿鱼(Platypharodon extremus)、骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)和黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi) 4种,国家Ⅱ级重点保护鱼类有骨唇黄河鱼、拟鲇高原鳅(Triplophysa siluroides)、极边扁咽齿鱼、厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychus pachycheilus) 4种,四川省级重点保护鱼类黄河高原鳅(Triplophysa papptnhtimi) 1种,外来物种鲤(Cyprinus carpio)和鲫(Carassius auratus) 2种,分别占总种类数的36.36%、36.36%、9.09%和18.18%。相对重要性指数(IRI)显示,花斑裸鲤和硬刺高原鳅(Triplophysa scleroptera)为白河优势种;花斑裸鲤和厚唇裸重唇鱼为黑河优势种。Shannon-Wiener多样性指数(H)、Margalef丰富度指数(D)和Pielou均匀度指数(J)分别为1.764～2.364、1.364～1.798和0.7854～0.8747。丰度/生物量曲线表明,白河、黑河鱼类群落结构相对稳定,以大个体的鱼类为优势种,群落受到外界扰动程度小。Cluster和NMDS分析显示,在一定的相似性水平上,白河、黑河鱼类群落均分为3组,表明鱼类群落结构组成分布存在差异。与历史资料相比,白河和黑河鱼类呈现种类减少、多样性下降的趋势,其分别占历史总种类数的72.73%、66.67%;但黄河上游特有和保护鱼类占比很高,达到54.55%,且为典型的青藏(中亚)高原鱼类区系。本研究提供了四川境内黄河水系主要支流鱼类资源现状的基础数据,同时为该段黄河上游鱼类的保护提出了建议。
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土壤修复剂协同昆虫病原线虫对黄瓜根际土壤线虫群落的影响
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要：为探索土壤修复剂(soil amendment,SA)协同昆虫病原线虫(Heterorhabditis beicherriana)对南方结节线虫(Meloidogyne incognita)的抑制作用以及对黄瓜根际土壤生态环境的影响，以‘千秋1号’黄瓜为试验品种，采用室内盆栽试验方法，通过设置6个试验组对黄瓜根际土壤线虫群落结构、生态多样性和功能多样性等方面进行研究。结果显示，试验60 d后施入SA和昆虫病原线虫相比其他处理根结植物类寄生线虫减少，小杆属和中杆属等食细菌类线虫增多；营养类群指数和基础成分指数均有所回升，线虫通路比指数显著升高，土壤有机分解以细菌分解为主；线虫区系仍位于土壤养分较好且以细菌降解为主的A区，其他组则从A区逐渐下降到D区。研究表明，SA协同昆虫病原线虫能有效抑制南方根结线虫，同时可以提高土壤线虫的多样性，有效缓解土壤食物网结构退化的趋势。
关键词： 土壤修复剂 昆虫病原线虫 南方根结线虫 黄瓜 群落结构
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不同饲养模式对家蚕蚕沙微生物群落结构的影响
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究不同饲养模式下家蚕蚕沙细菌微生物群落结构,探讨不同饲料对家蚕蚕沙微生物组成的影响,为今后蚕沙的综合利用提供科学参考.[方法]以家蚕品种"9211·9215 ×川58·川62"为对象,采用全龄饲料育和全龄桑叶育2种饲养模式进行饲养,对其5龄蚕沙进行16S rDNA V3~V4区域扩增,利用Illumina NovaSeq二代测序平台对扩增片段进行高通量测序,最后通过细菌Alpha多样性、OTU聚类、稀疏曲线和物种注释分析,解析不同饲养模式下蚕沙微生物群落结构组成.[结果]与桑叶育对照组相比,饲料育处理组蚕沙细菌微生物物种组成及其多样性指标均较高,且呈显著差异(P<0.05).在菌群结构方面,对照组主要优势菌门为蓝细菌(Cyanobacteria,55.38%)、厚壁菌门(Firmicutes,32.50%)和变形菌门(Proteobacteria,11.55%),处理组主要优势菌门为变形菌门(Proteobacteria,68.18%)、厚壁菌门(Firmicutes,24.1%)和放线菌门(Actinobacteria,7.28%),其中厚壁菌门和变形菌门均为2组蚕沙的优势菌门.[结论]不同饲育模式下蚕沙微生物群落物种组成及相对丰度存在差异(P<0.05),饲料育组家蚕蚕沙细菌群落结构的物种数目和物种多样性显著高于桑叶育组.
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培养原料种类的减少对人工窖泥发酵剂菌群结构的影响
《中国酿造 》 2020
摘要：为实现人工窖泥发酵剂(APMSC)的品质控制,从前期开发的发酵剂配方中分别取出老熟窖泥、曲药、酒糟和黄水初步形成4个简化配方,采用扩增子测序和色谱技术比较了各配方发酵剂的微生物群落结构及香味物质含量差异.结果显示,各配方发酵剂样品中共检测到70个微生物操作分类单元(OTU),其中71.43%为各组样品共有,未检测到独有OTU.各配方样品的优势微生物均存在于其余分组中,仅物种相对丰度有所差异.根据酿酒有益微生物的丰度高低,选择了一种简化配方(无老熟窖泥作原料)发酵剂养护窖池,使酿造白酒的主体香味物质含量得到显著提高.结果表明,即使缺失了某一种培养原料,人工窖泥发酵剂的功能微生物物种也可能由其他原料补充,而原料种类的减少是实现发酵剂品质控制的主要途径.
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安宁河中游着生藻类群落结构及其与环境因子的关系
《淡水渔业 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解安宁河中游着生藻类群落结构及其与环境因子的相关性,分别于2015年7-8月和2016年1-2月对安宁河干支流的着生藻类进行丰水期和枯水期的调查,并在安宁河支流选取有代表性的三个样点,于2015年7月-2016年6月对其着生藻类进行周年调查.结果显示:共检出着生藻类4门37属81种,其中以硅藻门种类最多(60种);安宁河干流丰水期着生藻类的密度和生物量都显著低于支流,而枯水期着生藻类的密度和生物量都显著高于支流;曲壳藻属未定种(Achnanthes sp.)、桥弯藻属未定种(Cymbella sp.)、异极藻属未定种(Gompho-nema sp.)和偏肿桥弯藻(Cymbella ventricosa)等为安宁河支流全年出现的优势种;安宁河支流着生藻类密度以4月最高,9月最低,生物量以2月最高,9月最低;冗余分析(RDA)结果显示,丰水期安宁河着生藻类群落结构主要与底质类型和流速密切相关,枯水期群落结构主要与海拔和pH相关;安宁河支流着生藻类分布的周年变化与pH和水深密切相关.
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土壤细菌群落对湿热灭菌蚕沙还田的响应
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本文旨在揭示无外源微生物干扰下,土壤微生物群落对蚕沙中养分物质的利用状况,探索蚕沙无害化还田后的生态效应。【方法】通过向土壤中添加湿热灭菌蚕沙的方式来模拟无害蚕沙还田,并采用高通量测序技术测定土壤细菌群落结构及多样性,以揭示土壤微生物对于湿热灭菌蚕沙还田的快速响应状况。【结果】湿热灭菌蚕沙还田对土壤细菌结构无显著的影响(P> 0. 05),但减少了土壤细菌的种类,其Chao I指数、Shannon多样性指数和Simpson多样性指数显著降低(P <0. 05)。较对照而言,与纤维素降解相关的厚壁菌门、放线菌门和变形菌门细菌的相对丰度在湿热灭菌蚕沙还田条件下会显著增加,特别是一些链霉菌属、芽孢杆菌目、梭菌科、毛螺菌科、短波单胞杆菌属、固氮螺旋菌属和假黄单胞菌属的细菌类群。【结论】土壤细菌群落的结构和功能相对稳定,湿热灭菌蚕沙还田会快速激活与纤维素代谢相关的细菌类群,并通过增加相对丰度的方式促进土壤自我修复。
关键词： 蚕沙 高通量测序 群落结构 群落结构 微生物多样性 纤维素降解
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蚕沙对土壤细菌群落结构的影响
《蚕业科学 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为调查向土壤中丢弃蚕沙对土壤细菌群落结构所造成的影响,以未添加蚕沙的土壤为对照,通过向土壤中添加蚕沙,恒温培养30 d后,对比土壤细菌群落结构。结果表明,添加蚕沙处理一定程度上改变了土壤细菌群落的结构和优势种群,降低了土壤细菌群落的多样性,但影响并不显著。在属水平上,潜在指示蚕沙的标志菌有短波单胞菌属(Brevundimonas)、纤维菌属(Cellulosimicrobium)、新鞘氨醇菌属(Sphingobium)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)和链霉菌属(Streptomyces)6类。其中,纤维菌属(Cellulosimicrobium)的纤维化纤维菌(Cellulosimicrobium cellulans)还是处理组在种水平上的生物标志物,较对照组的统计学差异值大于4。研究结果可为今后的蚕沙还田和蚕沙有机污染物治理等提供参考。
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白酒酒醅纤维素降解菌的多样性分析及其分离筛选
《食品与发酵工业 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为拓展纤维素降解菌资源,将浓香和清香型白酒酒醅样品富集培养于羧甲基纤维素钠(sodium carboxymethyl cellulose,CMC-Na)液体培养基,利用变性梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和平板培养法研究富集培养物的细菌多样性,筛选高效纤维素降解菌。DGGE结果显示,原始酒醅样品和富集培养物的细菌多样性无显著差异(p<0.05),但群落结构相似性较低;富集培养物中的细菌分类于Acinetobacter、Bacillus、Klebsiella、Lactococcus、Paenibacillus。经刚果红水解圈、纤维素酶(carboxymethyl cellulase,CMCase)活力和滤纸条降解试验测定,获得3株纤维素降解力较强的细菌,分别为Paenibacillus sp.、Acinetobacter sp.和Gluconobacter sp.。由这3株细菌构建的复合菌系在液态发酵条件下对水稻秸秆和小麦秸秆均具有显著的降解作用,降解率分别为35.32%和28.89%。白酒酒醅蕴藏高效的纤维素降解菌,具有开发利用潜力。
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