丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状全基因组关联分析

王言; 顾以韧; 梁艳; 杨雪梅; 杨跃奎; 吕学斌; 龚建军; 陈晓晖; 应三成; 曾凯; 雷云峰; 陶璇; 何志平; 《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因.以 166 头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析.结果表明,有 1 个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1 个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3 个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因.本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值.

关键词： 丫杈猪 全基因组关联分析 生长发育性状 候选基因