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丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王言 1 ; 顾以韧 1 ; 梁艳 1 ; 杨雪梅 1 ; 杨跃奎 1 ; 吕学斌 1 ; 龚建军 1 ; 陈晓晖 1 ; 应三成 1 ; 曾凯 1 ; 雷云峰 1 ; 陶璇 1 ; 何志平 1 ;

作者机构: 1.四川省畜牧科学研究院

关键词: 丫杈猪;全基因组关联分析;生长发育性状;候选基因

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 60 卷 008 期

页码: 239-243

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因.以 166 头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析.结果表明,有 1 个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1 个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3 个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因.本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值.

  • 相关文献

[1]基于SNP芯片的丫杈猪保种群体遗传结构研究. 陶璇,杨雪梅,梁艳,刘一辉,汪勇,孔繁晶,雷云峰,杨跃奎,王言,安瑞,杨坤,吕学斌,何志平,顾以韧. 2023

[2]茶树叶型性状的全基因组关联分析. 王小萍,王云,熊元元,刘晓,李明红,张厅,赖谦,李春华. 2023

[3]川乡黑猪基因组选择信号分析. 梁艳,顾以韧,刘鹏亮,郝晓东,弥世荣,陶璇,杨雪梅,杨跃奎,王言,陈晓晖,龚建军,吕学斌,何志平. 2024

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