科研产出
烟草青枯病的发生流行及生防菌防控的根际微生物效应研究进展
《烟草科技 》 2024 北大核心
摘要：综述了国内烟草青枯病的发生、症状特征、生防菌的应用及其对根际微生物群落的影响.①烟草青枯病病原为青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum),该菌具有丰富的遗传多样性;②发病面积较大、为害较重的产区有广东、广西、福建、湖南、浙江等省(自治区)及安徽省的皖南烟区、四川省的宜宾和泸州等烟区,发病率达30%~100%;③多种微生物的联合应用或拮抗菌与(生物)有机肥、生物质炭等的配合施用可以更好地控制烟草青枯病;④生防菌的应用显著影响了烟草根际土壤细菌和真菌群落的多样性,并使根际微生物群落朝着更均衡的方向发展.
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整合宏基因组学分析生猪养殖粪污堆肥发酵过程中微生物群落动态变化
《动物医学进展 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以猪粪和菌渣为发酵原料,进行有氧堆肥处理,在堆肥第 1、4、8、12、16、22、29 天,进行上、中、下分层多点采样,提取总 DNA 构建文库,经定量和检测合格后,利用宏基因组测序分析堆肥过程中微生物区系变化与致病微生物动态变化.结果表明,堆肥期间微生物丰度发生明显变化,其中细菌丰度先升后降,病毒丰度变化平稳,真菌丰度稍有增长,古细菌丰度则稍有下降.在堆肥初始时,变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门等微生物群落为优势菌门;变形菌门在堆肥的第 4 天迅速达到高点,然后迅速下降并维持在原始水平,其中试验组的变化比对照组更为平稳;厚壁菌门在堆肥的前 4d,丰度急速下降,然后缓慢下降;拟杆菌门在堆肥期间,丰度持续上升.同时,大肠埃希氏菌、沙眼衣原体、肠道沙门氏菌、化脓性链球菌、停乳链球菌等强致病微生物,随着堆肥的进行,其丰度均逐渐下降.试验组和对照组的菌群结构和丰度变化趋势均无显著差异.
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不同氮源配比营养液对水培生菜根系微生物群落的影响
《中国土壤与肥料 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：水培技术用于蔬菜生产是对传统土壤栽培模式的重要补充,也是现代农业的重要手段,研究不同氮源配比营养液对水培生菜根系微生物群落组成及功能预测对水培生菜质量安全具有重要意义.水培试验地位于四川省成都市温江区,营养液处理包括:100%无机氮源(T1),100%有机氮源(T2),50%无机氮源和50%有机氮源(T3).不同处理生菜生长过程控制完全相同,水培营养液成分除氮添加有差异外,其他成分均相同.采用高通量测序方法测定生菜根系微生物群落结构并进行功能预测.α多样性分析表明,3个处理细菌种类无显著性差异,T2处理生菜根系细菌丰富度和均匀度最高.主坐标分析表明,T2处理根系细菌群落结构与T1、T3之间差异较大,T1与T3处理细菌群落结构相对相似.物种组成分析表明,在目水平上,3个处理下分离到丰度排名前10的类群分别为假单胞菌目、鞘氨醇单胞菌目、黄色单胞菌目、β-变形菌目、柄杆菌目、根瘤菌目、黄杆菌目、类固醇杆菌目、Salinisphaerales和立克次氏体目.其中Pseudomonadales为TI和T3样品中的主要优势群类,Xanthomonadales为TI样品中的第二优势群类.Sphingomonadales为T2样品中的主要优势群类.在属水平发现10种差异显著的细菌,其中T2处理下生菜根系细菌中鞘脂菌属、Asticcacaulis、Pelomonas、Phenylobacterium、Uliginosibacterium、IS-44、Methylopila和Pseudolabrys的Indval值最高,为该处理中属水平的指示物种,T1处理下Stenotrophomonas和Aeromonas的Indval值最高,为该处理中属水平的指示物种,T3处理中Chryseobacterium的Indval值最高,为该处理中属水平的指示物种.PICRUSt2功能预测分析发现,碳水化合物代谢和氨基酸代谢是3个处理下根系细菌最丰富的代谢途径,区别在于氨基酸代谢、辅助因子和维生素的代谢活动在T2处理下显著增加,且与T1和T3差异显著或极显著,但脂质代谢、萜类和多酮类化合物的代谢、信号转导、细胞运动、内分泌系统、聚糖的生物合成与代谢及传染病活动显著低于T1和T3处理.因此加入有机氮的营养液生菜根系细菌丰富度更高,同时表现出更强的功能特征.但如果仅加入50%有机氮营养液对细菌群落和功能的影响不十分明显.100%有机氮来源营养液配方可能对生菜生长及品质带来更多正向的影响.
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羊肚菌栽培对沙漠砂基质中微生物群落及基质理化性质的影响
《生物技术通报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为开发沙漠砂代替土壤作为羊肚菌栽培基质,研究羊肚菌栽培对沙漠砂中微生物群落及基质理化性质的影响。利用扩增子测序分别检测栽培与未栽培羊肚菌的沙漠砂中细菌、真菌群落,解析总有机碳、腐殖质和氮素含量等理化性质。收获子实体产量（1 210±259）g/m2鲜重,说明沙漠砂栽培羊肚菌可行。沙漠砂基质中微生物多样性在羊肚菌栽培过程中短暂下降,在羊肚菌出菇采收后回升。真菌群落以子囊菌门为主。随着羊肚菌在沙漠砂中增殖,扫描电镜观察到大量菌丝形成网络状缠绕固定沙漠砂颗粒。细菌群落以变形菌门、放线菌门、拟杆菌门为主。假单胞菌属相对丰度在羊肚菌菌丝生长期明显上升,蓝细菌门在羊肚菌采收后大幅度扩增,伴随总氮和铵态氮含量显著上升,超越了栽培羊肚菌之前的初始水平。栽培羊肚菌使沙漠砂中有机质含量提升7倍,出菇后基质中胡敏酸、富啡酸、胡敏素含量显著上升。研究结果揭示了用沙漠砂种植羊肚菌在收获高值农产品的同时改良沙漠砂理化性质的应用潜力。
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十字花科作物根肿病对根际土壤微生物群落的影响
《生态学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究根肿病对十字花科作物根际土壤微生物多样性的影响,以罹病大白菜和健康株根际土壤为研究对象,采用高通量测序技术对2组样本的细菌16S rDNA和真菌ITS基因进行序列测定,分析了样本间的微生物群落结构和组成差异,同时测定根际土壤理化性质,探讨根肿病、土壤微生物群落、土壤环境因子三者的相关性。研究表明:1)患病植株根际土壤pH和总磷、总钾、碱解氮、速效钾含量显著低于正常植株根际土,而交换性钙含量明显增加。2)根肿病的发生降低了根际土壤中细菌种群的丰富度和多样性程度,但对根际土壤中的真菌α-多样性无明显影响。3)变形菌门、拟杆菌门、放线菌门等是所测土壤样本的主要优势细菌种群,其中患病植株根际土壤中拟杆菌门丰度显著高于健康植株根际土壤,放线菌门丰度则显著降低(P<0.05)。优势细菌纲为γ-变形菌纲、拟杆菌纲、α-变形菌纲、放线菌纲、酸杆菌纲等,2组土壤样本间多种优势细菌纲相对丰度差异显著。4)根际土壤优势真菌类群为子囊菌门、被孢霉门、担子菌门和壶菌门,其相对丰度在患病和健康株根际土壤样本中均有明显差异。主要真菌纲为散囊菌纲、被孢霉纲、锤舌菌纲等,并且土壤样本间的多种优势真菌纲相对丰度存在显著性差异。5)主坐标分析结果表明病株根际土壤与健康株根际土壤细菌和真菌群落结构差异明显,冗余分析结果显示速效钾和交换性钙是根际土壤微生物群落变化的主要影响因素。研究结果为揭示根肿病发生的根际微生态机制以及研发根肿病综合防控技术提供理论支撑。
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土壤改良施肥对白菜根际微生物群落结构的影响
《北方园艺 》 2018 北大核心
摘要：为了了解改良施肥方式对土壤微生物群落结构的影响,以白菜为试材,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对常规施用化肥和改良施肥(化肥减量、增施有机肥、增施土壤调理剂)条件下白菜根际真菌和细菌群落结构进行了研究。结果表明:改良施肥后增加了白菜产量,缓解了土壤酸化的情况,土壤养分增加,改良施肥方式白菜根际真菌和细菌丰度和多样性大于常规施肥处理,2种施肥方式微生物群落组成和优势类群有较大差异。改良施肥后白菜根际微生物种类增多,优势类群发生了较大变化。
关键词： 白菜 改良施肥 MiSeq高通量测序 微生物群落
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