科研产出
黄颡鱼养殖群体遗传多样性与遗传结构的微卫星分析
《淡水渔业 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(Fst=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(Fst=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
关键词： 黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco） 养殖群体 微卫星标记 遗传多样性
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利用SSR标记筛选DUS测试中甘蓝型油菜近似品种
《分子植物育种 》 2013 CSCD
摘要：随着分子标记技术的迅速发展,将分子标记运用于辅助植物新品种保护中的特异性、一致性和稳定性(distinctness,uniformity,stability,DUS)测试成为热门话题。为了探讨SSR标记用于甘蓝型油菜近似品种筛选的可行性,本研究以26份自交系和54份2008-2009、2009-2010和2010-2011年DUS测试品种为研究材料,从952对SSR引物中筛选出49对多态性丰富、带型清晰、易以统计的核心引物。49对引物共检测到57个位点311个等位变异,每个位点包含等位变异数变幅为2～13个,平均5.5个,平均多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.53。聚类结果表明,在遗传相似系数为0.93时,该套核心引物可将所有参试品种区分开,同一育种单位或地区的品种优先聚为一起,聚类结果与品种系谱基本吻合。说明SSR标记可用于DUS测试中甘蓝型油菜近似品种筛选。
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两系杂交小麦恢复系MR168抗条锈病基因遗传分析及分子标记定位
《遗传 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：小麦条锈病是影响杂交小麦普及推广的重要因素。文章利用基因推导法和SSR分子标记技术,研究了温光型两系杂交小麦恢复系MR168的抗条锈性遗传规律及其控制基因染色体位置。结果表明,MR168对CY29、CY31、CY32、CY33等条锈菌生理小种表现高抗至免疫;对SY95-71/MR168杂交组合的正反交F1、BC1、F2和F3群体分单株接种鉴定显示,MR168对CY32号小种的抗性受1对显性核基因控制,该抗病基因来源于春小麦品种辽春10号。利用集群分离分析法(Bulked segregant analysis,BSA)和简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记分析抗病亲本MR168、感病亲本SY95-71及183个F2代单株,发现了与MR168抗条锈病基因连锁的5个微卫星标记Xgwm273、Xgwm18、Xbarc187、Xwmc269、Xwmc406,并将该基因初步定位在1BS着丝粒附近,暂命名为YrMR168;构建了包含YrMR168的SSR标记遗传图谱,距离YrMR168最近的两个微卫星位点是Xgwm18和Xbarc187,遗传距离分别为1.9 cM和2.4 cM,这两个微卫星标记可用于杂交小麦抗条锈病分子标记辅助育种。
关键词： 杂交小麦 恢复系 抗条锈病基因 基因推导 遗传分析 微卫星标记
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人工合成六倍体小麦后代衍生群体Waxy蛋白亚基的分子标记
《中国农学通报 》 2008 北大核心
摘要：四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成六倍体小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。以引自CIMMYT的Syn768、Syn769和Syn780人工合成六倍体小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2:6后代群体中选育的113份优良高代系为材料,采用SSR特异引物的PAGE凝胶电泳对其Waxy蛋白亚基缺失类型进行了研究。结果表明,在所检测的121份材料中,8份材料缺失Waxy-B1型蛋白亚基,占全部材料的6.6%;没有检测到其他类型的缺失体。从每个人工合成六倍体小麦亲本材料所形成的后代衍生群体来看,Waxy-B1缺失体频率各不相同,说明Waxy蛋白亚基缺失类型在人工合成六倍体小麦后代衍生群体材料中的表现存在着随机性,与亲本的基因型状况关系极大。通过研究人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代的Waxy蛋白亚基缺失类型,有助于提高分子标记育种效率。
关键词： 人工合成六倍体小麦 Waxy蛋白亚基 分子标记辅助育种 微卫星标记
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人工合成六倍体小麦后代衍生群体Waxy蛋白亚基的分子标记
《西南农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成六倍体小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。以引自CIMMYT的Syn768、Syn769和Syn780人工合成六倍体小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2∶6后代群体中选育的113份优良高代系为材料,采用SSR特异引物的PAGE凝胶电泳对其Waxy蛋白亚基缺失类型进行了研究。结果表明,在所检测的121份材料中,8份材料缺失Waxy-B1型蛋白亚基,占全部材料的6.6%;没有检测到其他类型的缺失体。从每个人工合成六倍体小麦亲本材料所形成的后代衍生群体来看,Waxy-B1缺失体频率各不相同,说明Waxy蛋白亚基缺失类型在人工合成六倍体小麦后代衍生群体材料中的表现存在着随机性,与亲本的基因型状况关系极大。通过研究人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代的Waxy蛋白亚基缺失类型,有助于提高分子标记育种效率。
关键词： 人工合成六倍体小麦 Waxy蛋白亚基 分子标记辅助育种 微卫星标记
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人工合成小麦衍生品种川麦47的抗条锈病SSR分子标记定位
《农业生物技术学报 》 2007 CSCD
摘要：川麦47是利用高抗条锈硬粒小麦(Triticum durum)-节节麦(Aegilops tauschii)人工合成种基因资源与四川高产小麦(T.aestivum)绵阳26杂交和有限回交育成的高抗条锈病小麦新品种川麦47。为明确川麦47抗条锈性遗传基础,将川麦47与高感条锈小麦品种台长29杂交,获得杂交F1和F2群体;对川麦47与台长29构建的F2群体(355株)进行了条锈病抗性鉴定和遗传分析,结果表明,川麦47携带1个显性抗条锈病基因;利用SSR标记和F2分离群体分组分析法研究表明,该抗条锈病基因位于小麦1B染色体上,与微卫星分子标记Xgwm11/Xgwm18、Xgwm273和Xgwm498紧密连锁,遗传距离分别为2.2、4.5和3.9cM。川麦47可用于分子标记辅助育种。
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节节麦遗传多样性的SSR标记分析
《西南农业学报 》 2007 CSCD
摘要：节节麦是普通小麦的供体祖先种,具有丰富的遗传变异和优良性状,可用于拓宽现代小麦的遗传基础。本试验利用22个小麦D染色体组特异微卫星标记,对国内外的85份节节麦材料进行遗传多样性分析,结果共检测出195个等位变异,平均每个标记8.86个。节节麦染色体间平均等位变异顺序为6D>2D>5D>1D>7D>3D>4D;22个标记揭示的多态性信息指数——PIC值,分布在0.3385和0.8129之间,染色体间大小顺序为1D>5D>2D>4D>3D>6D>7D。研究表明,85份节节麦材料遗传多样性较高,为节节麦的有效利用提供了依据。
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人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代衍生群体的PPO基因分析
《分子植物育种 》 2006 CSCD
摘要：四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成六倍体小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。以引自CIMMYT的Syn768、Syn769、Syn780和Syn786人工合成六倍体小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2:6后代群体中选育的113份优良高代系和川麦38、川麦42、川麦43和川麦47育成品种为材料,采用SSR特异引物Xgwm312标记位点的PAGE凝胶电泳对其PPO基因型进行了研究。结果表明,Xgwm312位点的标记具有多态性,其PCR扩增产物可产生198bp、216bp、232bp和240bp四种等位基因变异片段。在所检测的117份后代衍生群体材料中,65份材料具有198bp片段的等位基因,占全部材料的55.56%;13份含216bp片段的等位基因,其频率为11.11%,35份材料具有232bp片段的等位基因,分布频率为29.91%;只有4份材料含有240bp片段的等位基因,仅占全部材料的3.42%。从每个人工合成六倍体小麦亲本材料所形成的后代衍生群体来看,基因等位变异片段分布频率各不相同。说明PPO基因在小麦杂交后代材料中基因型的表现存在着随机性,与亲本的基因型状况关系极大,并且在后代材料中出现了亲本都没有的240bp等位基因变异片段的材料。通过研究人工合成六倍体小麦与普通小麦杂交后代的PPO基因型,有助于提高分子标记育种效率,也有助于PPO基因型的多态性研究,并为人工合成六倍体小麦在我国小麦品种改良和分子标记育种中的应用提供依据和方法。
关键词： 人工合成六倍体小麦 分子标记辅助育种 PPO基因型 微卫星标记
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